Extended-spectrum β-lactamase (ESBL)-producing Escherichia coli has been documented in humans as well as in food-producing birds, including chickens, and for unknown reasons the prevalence has increased significantly during the last decade. With E. coli as a major opportunistic pathogen in chickens and with a potential for zoonotic transfer to human beings, ESBL-producing E. coli represents a major risk both to poultry production and to human health. This review presents some of the current problems with ESBL-producing E. coli in relation to poultry production, with a focus on chickens. To illustrate issues in relation to screening and typing, two case studies are included where one collection of ESBL-producing E. coli isolates was obtained from asymptomatic carrier chickens while the other was obtained from lesions in chickens. Pulsed-field gel electrophoresis and multi-locus sequence typing revealed a highly heterogeneous population of ESBL-producing E. coli. All isolates harboured between one and three large plasmids (>100 kb). Among isolates associated with asymptomatic chickens, the ESBL types SHV and TEM dominated, while CTX-M-1 dominated in disease-associated isolates. The isolates from diseased birds were occasionally of sequence types often associated with human infections, such as ST131. With improved tools to trace and screen for ESBL-producing E. coli at farm level, strategies can be selected that aim to reduce or eliminate the presence of ESBL-producing E. coli in poultry and poultry products meant for human consumption.

Numerous cases of tenosynovitis appeared in France causing high morbidity in free-range and standard broilers. The main clinical findings were lameness, stunting and non-uniform bodyweights. Although the natural mortality was low, the economic losses due to birds that had to be removed from the flock prematurely, downgrading of carcases and lower average weights at slaughter were substantial. Postmortem examinations, bacteriological, virological and serological examination confirmed the aetiology of avian orthoreovirus (ARV)-induced tenosynovitis. The isolated ARVs were analysed serologically and genetically. Sequencing of σC RT-PCR products and phylogenetic analysis revealed a new type of ARV. The virus was not neutralised in serum neutralisation test using monovalent sera from vaccinated chickens. Together with the flock data, epidemiology of these recent reovirus outbreaks in France was reconstructed. It is concluded that these reovirus isolates differ serologically and genetically from the well described reovirus isolates used in commercial vaccines which were not capable of preventing the disease. The outbreaks resulted in substantial losses in broilers from vaccinated breeders.

Les colibacilloses aviaires sont une pathologie fréquente conduisant à de nombreux traitements antibiotiques avec les risques d'émergence de résistance. Bien que limité, le risque zoonosique est décrit et nous confirmons l'augmentation de la prévalence de la colibacillose aviaire dans les élevages de l'Ouest, en 2009. Il est important de différencier les souches de colibacilles commensales des souches pathologiques et de comprendre leur épidémiologie. Les outils de la biologie moléculaire tels que l'amplification des facteurs de virulence par la réaction en chaîne par polymérase (PCR) et l'électrophorèse en champ pulsé, nous ont permis de caractériser précisément les souches ; les résultats amènent des hypothèses sur les modalités de la transmission des colibacilles. Si celle de la transmission verticale se confirmait, il faudrait envisager des méthodes de prévention efficaces, notamment par la vaccination. Mots-clés : colibacilles aviaires, facteurs de virulence.

Des cas cliniques de tendinite sont apparus sporadiquement, puis plus régulièrement, dans des élevages de poulets de chair dans différentes régions de France depuis 2010. Ces tendinites ont été identifiées comme dues à une réovirose en dépit de la vaccination des poules parentales avec des vaccins contenant différentes valences de réovirus précédemment décrits comme présents sur le terrain ; en outre une transmission horizontale notamment lors de l'éclosion a été observée. Les études virologiques conduites dans deux laboratoires aboutissent à l'identification d'un nouveau réovirus jusqu'à présent non décrit en Europe. Outre des différences au plan génétique entre ce nouveau virus et les souches vaccinales utilisées sur le terrain, des tests de séroneutralisation croisée ont montré des différences antigéniques, ce qui peut expliquer l'inefficacité des vaccins observée sur le terrain. Pour prévenir la multiplication de ces virus il apparait donc utile de réactualiser la composition des vaccins de manière à protéger les poules reproductrices et leur descendance. Mots-Clés : réovirus, tendinites, poulets de chair.

Les Coronavirus de la bronchite infectieuse aviaire sont reconnus comme étant l’un des agents pathogènes des poulets de chair et des poules pondeuses les plus fréquents dans le monde. Si le terme générique de bronchite infectieuse indique le tropisme respiratoire des premières souches isolées, il est apparu dès les années 1940 que les Coronavirus aviaires étaient capables de se multiplier dans le tractus génital des poules, causant des chutes de ponte et des anomalies des oeufs. Plus récemment, un tropisme de certaines souches pour les reins et le tube digestif a aussi été mis en évidence. L’autre caractéristique remarquable des Coronavirus aviaires est leur grande capacité de mutation donnant naissance à des familles de variants stables dont le pouvoir pathogène peut présenter certaines spécificités. Dans cette étude, nous nous intéresserons à la prévalence en France des variants de type Qx et à une de leur manifestation clinique parmi les plus spectaculaires : les «fausses pondeuses».