La variabilidad estacional e interanual de la bahía de Tumaco ha sido estudiada a partir de mediciones oceanográficas y meteorológicas, acopiadas desde 1999 y 1992, respectivamente. Durante el período estudiado se pudo establecer una estacionalidad con dos condiciones definidas dentro de un ciclo anual: la primera de febrero a principios de abril, caracterizada por el enfriamiento de la columna de agua, con valores entre 13.6 y 26°C, la elevación de la termoclina y haloclina (O a 20 m) y aumento en la concentración de nutrientes; la segunda comprende el resto del año, con temperaturas más altas, entre 14 y 27.8°C, y unas termoclina y haloclina más profundas (30 a 50 m). Este ciclo anual ocurre debido a la presencia de la Zona de Convergencia Intertropical, ZCIT, en la región Pacifico Ecuatorial Este, consistente con la intensidad de los vientos Alisios del Noreste y Sureste y las consecuentes corrientes superficiales. Esta estacionalidad se vió afectada por eventos globales como: las ondas Kelvin ecuatoriales del primer modo baroclinico, durante abril-mayo, que aumentaron la temperatura superficial del mar, TSM, la temperatura ambiente, TA, y las precipitaciones; el evento La Niña 1999-2000, que causó valores bajos de TSM (26.5°C), anomalías negativas del nivel medio del mar, NMM, y un incremento en la concentración de nutrientes con los máximos valores del periodo estudiado; nitritos (0.2 pM), fosfatos (2 pM), silicatos (50 pM) y amonio (4 pM); y desde septiembre de 2002 por el inicio de un evento El Niño de débil a moderada intensidad, identificado por las anomalías positivas del NMM de más de 10 cm, aumentos en las precipitaciones y TA, así como en la profundización de la isoterma de 15°C.