Wingless Type (WNT) signaling pathway is an evolutionarily conserved pathway that is crucial for the cell fate determination, survival and expansion of lymphocyte progenitors. It has been demonstrated that deregulated WNT signaling is one of the participating mechanism underlying lymphoid leukemogenesis. Inactivating mutations and methylation in Adenomatous Polyposis Coli (APC) gene, a negative regulator of WNT pathway, can cause ligand independent WNT pathway simulation. In this study, promoter methylation and expression of the APC gene is evaluated in childhood lymphoid and myeloid acute leukemia patients (n= 118) and representative cell lines by using methylation specific PCR (MS-PCR) and real time quantitative PCR (QRT-PCR). APC gene promoter found hypermethylated in the 56% of childhood acute leukemia patients [49.2% of B-cell acute lymphoblastic leukemia (B-ALL), 62.5% of T-cell acute lymphoblastic leukemia (T-ALL) and 64.1% of Acute myeloid leukemia (AML)]. To evaluate the reflection of promoter methylation, APC mRNA levels were examined and found that all acute lymphoblastic leukemia subgroups have statistically lower APC expression levels compared to controls. Although there was no association with clinical parameters, promoter hypermethylation of APC gene seems to be a common epigenetic event in acute leukemia and leading to differential expression levels among different acute leukemia phenotypes.Keywords: APC, methylation, Expression, Acute leukemia, WNT signaling
ÖZET
Akut Lösemi Hastalarında APC Tümör Baskılayıcı Geninin Artmış HipermetilasyonuWNT sinyal ileti yolağı evrimsel olarak korunmuş, lenfosit progenitor hücrelerin büyümesi ve farklılaşmasında görevli önemli bir yolaktır.Son yıllarda yapılan çalışmalar WNT sinyal ileti yolağının hematopoetik malignansilerde de önemli bir yeri olduğuna işaret etmektedir.WNT sinyal ileti yolağında görev alan APC geni, B-katenini degrede eden degredasyon kompleksi elemanlarından birisi olması nedeniyle yolağın negatif regülasyonunda anahtar role sahiptir. Gende meydana gelen inaktive edici mutasyonlar veya metillenme, WNT aktivasyonuna sebep olmaktadır. Bu çalışmada APC geni ekspresyonu ve metilasyonu çocukluk çağı akut lenfoblastik ve myeloblastik lösemi hastalarında (n= 118) metilasyon spesifik PZR ve eş zamanlı kantitatif PZR ile incelenmiştir. APC geni promotör bölgesi hastaların %56'sında (%49.2 B-ALL, %62.5 T-ALL %64.1 AML hastalarında) hipermetile olarak tespit edilmiştir. Metilasyonun, gen ekspresyonuna olan etkisini değerlendirmek için APC mRNA seviyeleri incelendiğinde tüm akut lenfoblastik lösemi hastalarında anlatımın kontrollere göre istatistiksel olarak azaldığı görülmüştür. APC anlatımı ile klinik parametreler arasında bir korelasyon gözlememekle birlikte, APC promotör metilasyonunun farklı ALL fenotipleri arasında farklı gen anlatım düzeylerine neden olduğu gözlenmiştir.