Wingless Type (WNT) signaling pathway is an evolutionarily conserved pathway that is crucial for the cell fate determination, survival and expansion of lymphocyte progenitors. It has been demonstrated that deregulated WNT signaling is one of the participating mechanism underlying lymphoid leukemogenesis. Inactivating mutations and methylation in Adenomatous Polyposis Coli (APC) gene, a negative regulator of WNT pathway, can cause ligand independent WNT pathway simulation. In this study, promoter methylation and expression of the APC gene is evaluated in childhood lymphoid and myeloid acute leukemia patients (n= 118) and representative cell lines by using methylation specific PCR (MS-PCR) and real time quantitative PCR (QRT-PCR). APC gene promoter found hypermethylated in the 56% of childhood acute leukemia patients [49.2% of B-cell acute lymphoblastic leukemia (B-ALL), 62.5% of T-cell acute lymphoblastic leukemia (T-ALL) and 64.1% of Acute myeloid leukemia (AML)]. To evaluate the reflection of promoter methylation, APC mRNA levels were examined and found that all acute lymphoblastic leukemia subgroups have statistically lower APC expression levels compared to controls. Although there was no association with clinical parameters, promoter hypermethylation of APC gene seems to be a common epigenetic event in acute leukemia and leading to differential expression levels among different acute leukemia phenotypes.Keywords: APC, methylation, Expression, Acute leukemia, WNT signaling ÖZET Akut Lösemi Hastalarında APC Tümör Baskılayıcı Geninin Artmış HipermetilasyonuWNT sinyal ileti yolağı evrimsel olarak korunmuş, lenfosit progenitor hücrelerin büyümesi ve farklılaşmasında görevli önemli bir yolaktır.Son yıllarda yapılan çalışmalar WNT sinyal ileti yolağının hematopoetik malignansilerde de önemli bir yeri olduğuna işaret etmektedir.WNT sinyal ileti yolağında görev alan APC geni, B-katenini degrede eden degredasyon kompleksi elemanlarından birisi olması nedeniyle yolağın negatif regülasyonunda anahtar role sahiptir. Gende meydana gelen inaktive edici mutasyonlar veya metillenme, WNT aktivasyonuna sebep olmaktadır. Bu çalışmada APC geni ekspresyonu ve metilasyonu çocukluk çağı akut lenfoblastik ve myeloblastik lösemi hastalarında (n= 118) metilasyon spesifik PZR ve eş zamanlı kantitatif PZR ile incelenmiştir. APC geni promotör bölgesi hastaların %56'sında (%49.2 B-ALL, %62.5 T-ALL %64.1 AML hastalarında) hipermetile olarak tespit edilmiştir. Metilasyonun, gen ekspresyonuna olan etkisini değerlendirmek için APC mRNA seviyeleri incelendiğinde tüm akut lenfoblastik lösemi hastalarında anlatımın kontrollere göre istatistiksel olarak azaldığı görülmüştür. APC anlatımı ile klinik parametreler arasında bir korelasyon gözlememekle birlikte, APC promotör metilasyonunun farklı ALL fenotipleri arasında farklı gen anlatım düzeylerine neden olduğu gözlenmiştir.
scite is a Brooklyn-based organization that helps researchers better discover and understand research articles through Smart Citations–citations that display the context of the citation and describe whether the article provides supporting or contrasting evidence. scite is used by students and researchers from around the world and is funded in part by the National Science Foundation and the National Institute on Drug Abuse of the National Institutes of Health.
hi@scite.ai
10624 S. Eastern Ave., Ste. A-614
Henderson, NV 89052, USA
Copyright © 2024 scite LLC. All rights reserved.
Made with 💙 for researchers
Part of the Research Solutions Family.