Walking along the rabies genome: is the large G-L intergenic region a remnant gene?

Abstract

Rabies cDNA clones, obtained by "walking This friding is discussed in terms of the evolution of unsegmented negative-strand RNA viruses.Unsegmented negative-strand RNA viruses are grouped into two families, Rhabdoviridae and Paramyxoviridae. Although they differ widely in their host range and their interaction with the host cell, all these viruses share a similar genomic organization and use the same multiplication strategy during their lytic cycle. The RNA genome is first used as template for the synthesis of monocistronic transcripts, then for replication into positive-strand genomes that are then replicated into the negative-strand genomes and these are encap-

Molecular epidemiology of rabies virus in France: comparison with vaccine strains

“…Oligodeoxynucleotide primers used for amplification were chosen from conserved regions flanking the W pseudogene by comparison between the rabies virus (PV strain) and the Mokola virus genome (Tordo et al, 1986. They were produced with an Applied Biosystems DNA Synthesizer, subjected to detritylation and alkaline deprotection, and used without further purification.…”

Epidemiología molecular de epizootias de rabia en Colombia, 1994-2002: evidencia de rabia humana y canina asociada a quirópteros.

“…(34). Al examinar las secuencias rábicas estudiadas, se observa que existen más sustituciones de nucleótidos en la región G que en el fragmento del pseudogen Psi secuenciado, esto a pesar de la naturaleza no codificante de este último, que lo convierte en una región aceptora de sustituciones espontáneas (2,8,21). La aparente discrepancia se explica de la siguiente manera: el gen G es una región altamente variable, debido a la deriva antigénica a la que se encuentra expuesta la proteína G (2,35), a su vez, el endodominio es la región más variable dentro del gen G (35).…”

“…Un par de iniciadores conocido como G-L (8, 10) fue utilizado para amplificar por RT-PCR un fragmento de 902 nucleótidos, el cual codifica para el endodominio de la proteína G (aminoácidos 447 al 525 de la proteína G), y también para los aminoácidos 1 al 35 de la proteína L. El mencionado fragmento también contiene la región intergénica no codificante conocida como pseudogen Psi (21). El iniciador G de sentido positivo, tiene la secuencia 5' GACTTGGGTCTCCCAACTGGGG 3' y alínea con los nucleótidos 4665 al 4687 de ARN rábico.…”

“…El iniciador G de sentido positivo, tiene la secuencia 5' GACTTGGGTCTCCCAACTGGGG 3' y alínea con los nucleótidos 4665 al 4687 de ARN rábico. El iniciador L de sentido negativo tiene la secuencia 5' CAAAGGAGAGTTGAGATTGTAGTC 3' y alínea con los nucleótidos 5543 al 5566 del ARN rábico (8,10,21,22).…”

Expressão gênica empregando pseudopartículas em células de mamíferos (HEK 293T e Huh 7.0) cultivadas em diferentes meios de cultura livres de soro.

“…Seu genoma é um filamento único de RNA negativo não segmentado e já foi completamente sequenciado (TORDO et al, 1986(TORDO et al, , 1988 Figura 2-Vírus da raiva e suas proteínas O genoma de RNA de cadeia negativa, encapsulado dentro da nucleoproteína (amarelo). A polimerase viral (azul) e fosfoproteína (laranja), que formam o núcleo interno ou cápside.…”