Variabilidade genética estimada entre diplóides de banana por meio de marcadores microssatélites

Abstract

Resumo -O objetivo deste trabalho foi estimar a divergência genética entre 38 diplóides de banana do programa de melhoramento da Embrapa Mandioca e Fruticultura Tropical, incluindo genótipos melhorados, cultivados e selvagens, por meio de 15 marcadores microssatélites ou SSR. As similaridades genéticas, com base no coefi ciente de Jaccard, foram utilizadas para fazer o agrupamento dos genótipos pelo método UPGMA. O número de alelos obtidos foi 113, com média de 7,53 alelos por iniciador. A similaridade genética média foi de 0,22, e variou de 0,028 a 0,48, o que indica existência de variabilidade genética entre os genótipos. A análise de grupos, com base no polimorfi smo de microssatélites, não pôde separar completamente os híbridos melhorados, cultivados e selvagens. Alguns diplóides agruparam-se com base em sua origem geográfi ca, entre eles Musa ornata e IAC-1, e Tjau Lagada e Lidi, enquanto que, em outros, nenhuma relação foi estabelecida. Houve tendência de agrupamento entre os diplóides aparentados, como: SH3263 e 8694-20, 4279-01 e 9179-03, 1304-06 e 5854-03, 86B79-10 e 7341-03, 86B79-12 e 0337-02, e 9194-04 e 4154-08.Termos para indexação: Musa, diplóides, divergência genética, híbridos, marcadores moleculares. Genetic variability estimated in banana diploids through microsatellite markersAbstract -The objective of this work was to estimate the genetic diversity between 38 banana diploids from the banana breeding program of Embrapa Mandioca e Fruticultura Tropical (Embrapa Cassava and Tropical Fruits), including improved hybrids, cultivated and wild species, using fi fteen SSR markers. Genetic similarities were utilized to cluster genotypes through UPGMA, based on Jaccard coeffi cient. The average number of alleles per primer was 7.53, with a total of 113 alleles identifi ed. The average similarity was 0.22, and ranged from 0.028 to 0.48, indicating the existence of genetic variability between genotypes. The clustering analysis based on microsatellite polymorphism could not completely separate improved hybrids, cultivated and wild species. Some diploids grouped according to their geographic origins, among which Musa ornata and IAC-1, and Tjau Lagada and Lidi, while in others no relation was established. There was a trend of clustering among related diploids as: SH3263 and 8694-20; 4279-01 and 9179-03; 1304-06 and 5854-03; 86B79-10 and 7341-03; 86B79-12 and 0337-02; and 9194-04 and 4154-08.

Research Note New microsatellite markers for bananas (Musa spp)

“…Therefore, assessment of Musa genetic variability solely by using SSR markers continues to be widely used (e.g., Amorim et al, 2008;Jesus et al, 2009).…”

Genetic variability in banana diploids and nonparametric statistics of fragments associated with natural fruit finger drop

“…The authors noted that some genotypes were grouped according to geographical origins, while others had no other relationship. Amorim et al (2008) using SSR markers and diploid genotypes, also found no complete separation among improved, cultivated, and wild hybrids, and some diploids were grouped based only in their geographical origin. In this study, there was no separation of genotypes based solely on geographic origin, but genotypes were grouped based on their genomic constitution.…”

Diversidade genética de clones de bananeira 'Prata-Anã' (AAB) por meio de marcadores SSR

“…Dentre os marcadores existentes, os microssatélites (SSR) têm sido considerados os ideais para a caracterização e a avaliação da variabilidade genética, são abundantes, dispersos ao acaso no genoma, lócus específico, codominantes e multialélicos. Suas aplicações nos estudos com banana incluem a genotipagem, taxonomia e evolução, e saturação de mapas de ligação (AMORIM et al, 2008;JESUS et al, 2009).…”