Uncovering the metabolomic fingerprint of breast cancer

Oakman, Catherine; Tenori, Leonardo; Biganzoli, Laura; Santarpia, Libero; Cappadona, Silvia; Luchinat, Claudio; Leo, Angelo Di

doi:10.1016/j.biocel.2010.05.001

Cited by 81 publications

(56 citation statements)

References 53 publications

Supporting

Mentioning

Contrasting

Unclassified

Order By: Relevance

“…Metabolomics is a post-genomic research field concerned with the study of metabolic profiles in biologic samples such as isolated cells (4), tissues (5) or body fluids (6)(7)(8)(9)(10). In recent years, metabolomic studies have provided a significant contribution to the detailed understanding of the biochemical network and pathways in oncology (11), highlighting the potential of metabolomic analyses of blood samples for the detection of cancers, including epithelial ovarian (12), leukemia (13), oral (14), breast (15,16), prostate (11), liver (17) as well as colorectal cancer (CRC; refs. [18][19][20][21][22][23][24][25].…”

Section: Introductionmentioning

confidence: 99%

Metabolomic NMR Fingerprinting to Identify and Predict Survival of Patients with Metastatic Colorectal Cancer

et al. 2012

Self Cite

View full text Add to dashboard Cite

Earlier detection of patients with metastatic colorectal cancer (mCRC) might improve their treatment and survival outcomes. In this study, we used proton nuclear magnetic resonance ( 1 H-NMR) to profile the serum metabolome in patients with mCRC and determine whether a disease signature may exist that is strong enough to predict overall survival (OS). In 153 patients with mCRC and 139 healthy subjects from three Danish hospitals, we profiled two independent sets of serum samples in a prospective phase II study. In the training set, 1 H-NMR metabolomic profiling could discriminate patients with mCRC from healthy subjects with a cross-validated accuracy of 100%. In the validation set, 96.7% of subjects were correctly classified. Patients from the training set with maximally divergent OS were chosen to construct an OS predictor. After validation, patients predicted to have short OS had significantly reduced survival (HR, 3.4; 95% confidence interval, 2.06-5.50; P ¼ 1.33 Â 10 À6 ).A number of metabolites concurred with the 1

show abstract

Section: Introductionmentioning

confidence: 99%

Metabolomic NMR Fingerprinting to Identify and Predict Survival of Patients with Metastatic Colorectal Cancer

et al. 2012

Self Cite

View full text Add to dashboard Cite

show abstract

“…Recently, in vivo studies have revealed differences in choline levels between subtypes 7 whereas in vitro studies of cells have shown that ER+ cells with low metastatic potential have higher levels of PCho, phosphodiesters and uridine diphosphosugar than the ERÀ cells. 8,9 However, other metabolic changes in breast cancers and their subtypes remain to be elucidated.…”

Section: Introductionmentioning

confidence: 99%

1H NMR metabolomics combined with gene expression analysis for the determination of major metabolic differences between subtypes of breast cell lines

et al. 2011

View full text Add to dashboard Cite

“…Метаболомные маркеры -это низкомолекулярные вещества (с мол. массой не более 1 кДа), характерные для трансформированных клеток, или концентрация которых повышается в таких клетках [15]. В литературе описано значительное количество метаболомных маркеров рака молочной железы, выявленных в культуральных клетках тканях (табл.…”

Section: * -адресат для перепискиunclassified

“…1) [16][17][18][19][20][21][22][23]. Позднее для диагностики рака молочной железы были предприняты попытки измерения концентрации в плазме крови таких потенциальных метаболомных маркеров как аминокислоты (например, глицина, аргинина), органические кислоты (пентадекановая кислота) и нуклеотиды (цитидин-5'-монофосфат, 8-гидрокси-2'-дезоксигуанозин, 5-гидроксиметил-2'-дезоксиуридин) [24], холин-содержащие метаболиты (холин, фосфохолин и глицерофосфохолин) [25], а также использовать метаболомные маркеры для оценки рецидивов рака молочной железы [26] и наличия микрометастазов [15,27]. В текущем году установлена панель маркеров, выявленных в сыворотке крови, позволяющая достоверно дискриминировать больных с локализованным и метастатическим раком молочной железы: гистидин, глутамат, фенилаланин, ацетоацетат, глицерол, пируват, N-ацетилгликопротеин и манноза [28].…”

unclassified

Modern approach of breast cancer diagnostics

Тамкович

2014

BIOMED KHIM

View full text Add to dashboard Cite

В представленном обзоре систематизированы литературные данные об используемых в настоящее время инструментальных, цитологических и молекулярных (метаболомные, протеомных, генетических и эпигенетических) методах в ранней диагностике рака молочной железы. Оценены аналитические возможности и перспективы использования этих методов в практической медицине.Ключевые слова: рак молочной железы, онкомаркеры, циркулирующие нуклеиновые кислоты, ранняя диагностика рака.ВВЕДЕНИЕ. Злокачественные новообразования молочной железы занимают лидирующее место в структуре онкологических заболеваний женщин. По данным Всемирной Организации Здравоохранения (ВОЗ) ежегодно в мире выявляется более 1,38 млн. новых случаев рака молочной железы и 460 тысяч смертей от него [1]. В России рак молочной железы также занимает первое место по показателям заболеваемости (20%) и смертности (17,3%) среди злокачественных заболеваний женщин в возрасте 40-85 лет [2].Проблема своевременного выявления рака молочной железы заключается не только в его бессимптомном развитии, но и в отсутствие надёжных маркёров, способствующих раннему выявлению неопластического процесса. По статистике, 80% больных сами случайно обнаруживают у себя опухоль, которая в половине случаев относится к распространенной стадии. Большинство больных выявляют на индивидуальных профилактических осмотрах врачи разных специальностей, значительно меньше -при проведении массовых профосмотров [3]. К сожалению, небольшие опухоли до 2 см и расположенные глубоко в ткани молочной железы практически не поддаются клинической диагностике [3]. 141 * -адресат для перепискиСовременным трендом в развитие диагностики РМЖ является разработка неинвазивных/малоинвазивных диагностических процедур. К их числу в первую очередь относятся различные инструментальные (маммография, УЗИ, МРТ, ПЭТ) методы анализа. Инструментальный контроль используется и для повышения эффективности биопсии. Современное диагностическое использование методов молекулярного анализа так же в первую очередь ориентировано на неинвазивный анализ -анализ биологических жидкостей, и, в первую очередь циркулирующей крови. Действительно, такой анализ не требует материала, полученного непосредственно из опухолевой ткани, а значит, не зависит от локализации/выявления опухоли, подразумевает раннее выявление первичных опухолей или вторичных очагов, и востребован современной диагностической медициной. Представленный обзор посвящен анализу современных трендов в диагностике РМЖ.1. ИНСТРУМЕНТАЛЬНЫЕ МЕТОДЫ ДИАГНОСТИКИ. Основным современным методом диагностики злокачественных новообразований молочной железы является маммография, позволяющая с достоверностью от 80 до 96% выявить новообразования молочной железы размером более 10 мм в диаметре. Скрининговая маммография проводится ежегодно с профилактической целью всем женщинам старше 40 лет, однако, несмотря на высокую эффективность, имеет ряд существенных недостатков. Например, получаемые дозы облучения не позволяют использовать рентгенологический метод для динамического наблюдения. Кроме того, маммография не...

show abstract

Uncovering the metabolomic fingerprint of breast cancer

Cited by 81 publications

References 53 publications

Metabolomic NMR Fingerprinting to Identify and Predict Survival of Patients with Metastatic Colorectal Cancer

Metabolomic NMR Fingerprinting to Identify and Predict Survival of Patients with Metastatic Colorectal Cancer

1H NMR metabolomics combined with gene expression analysis for the determination of major metabolic differences between subtypes of breast cell lines

Modern approach of breast cancer diagnostics

Contact Info

Product

Resources

About