Türkiye’nin Erzurum İlinde İnsan Tüketimi İçin Satılan İstavrit Balıklarında (Trachurus trachurus) Anisakis pegreffii’nin Moleküler Tanısı

Abstract

SummaryThis study was planned to identify six parasites detected in horse mackerels (Trachurus trachurus) sold for human consumption in Erzurum province. DNA extraction was performed on six parasites diagnosed as nematode. Species identification was done by PCR and PCR-RFLP analysis of ITS (ITS-1, 5.8S subunit rRNA gene and ITS-2) region of ribosomal DNA (rDNA) and partial sequencing of mitochondrial cytochrome c oxidase subunit 1 (mt-CO1) and mt-CO2 genes. According to the PCR and PCR-RFLP results, all parasites were identified as Anisakis pegreffii. Partial sequence of mt-CO1 gene of one randomly selected parasite was corresponding with A. simplex and mt-CO2 genes of two parasites were corresponding with A. pegreffii. With this study, A. pegreffii was molecularly detected for the first time in Turkey. Keywords: Anisakis pegreffii, Fish, PCR, PCR-RFLP, Sequencing Türkiye'nin Erzurum İlinde İnsan Tüketimi İçin Satılan İstavrit Balıklarında (Trachurus trachurus) Anisakis pegreffii'nin Moleküler Tanısı ÖzetBu çalışma, Erzurum ilinde insan tüketimi için satılan istavrit balıklarında (Trachurus trachurus) tespit edilen altı parazitin tür tanısını yapmak amacıyla planlanmıştır. Nematod olarak belirlenen altı parazitten DNA ekstraksiyonu yapılmıştır. Tür tanısı, rDNA'nın ITS bölgelerinin (ITS1, 5.8 alt ünite rRNA ve ITS2) PCR ve PCR-RFLP analizleri ve mitokondrial sitokrom c oksidaz alt ünite 1 (mt-CO1) ve mt-CO2 genlerinin kısmi olarak sekanslanması ile yapılmıştır. PCR ve PCR-RFLP sonuçlarına göre tüm parazitlerin Anisakis pegreffii olduğu belirlenmiştir. Rastgele seçilen bir parazitin mt-CO1 geninin kısmi sekans sonucu A. simplex, iki parazitin mt-CO2 geninin kısmi sekans sonuçları ise A. pegreffii ile uyuşmuştur. Bu çalışma ile A. pegreffii Türkiye'de ilk kez moleküler olarak tespit edilmiştir.

Effect of Anisakis pegreffii (Nematoda: Anisakidae) on Biochemical and Haematological Characteristics of Chub Mackerel (Scomber japonicus Houttuyn, 1782) Caught in the Dardanelles at Çanakkale, Türkiye

“…In the present study, Anisakis pegreffii were recovered within the body cavity, liver, gonad and muscles of chub mackerel (S. japonicus) caught in the Dardanelles, Çanakkale. Similarly, Trachurus trachurus (Mattiucci et al, 2008;Utuk et al, 2012), S. japonicus, Scomber scombrus, Micromesistius poutassou, Merluccius merluccius, Trachurus mediterraneus, Mullus barbatus (Pekmezci et al, 2014) and Zeus faber (Yardimci et al, 2014) were the fish intermediate hosts for A. pegreffii in the Turkish seas.…”

Türkiye’nin Doğu Akdeniz Kıyılarında Yayılım Gösteren İki Diplodus Tür Populasyonunda DNA Barkodlama ve Filogenetik analiz

“…In previous studies, 98-100% of many living species, including aquatic organisms, have been successfully identified using a small part of the cytochrome c oxidase subunit I (COI) gene (Aravind et al, 2007). Although some studies in Turkey in which COI was used in fishery products (Keskin et al, 2012;Utuk et al, 2012;Parmaksız et al, 2017), there are scarcely any studies on the species from the genus Diplodus.…”