O artigo analisou os impactos da variação na produtividade do trabalho geradas pela pandemia da Covid-19, tanto na economia nacional como na do município do Rio de Janeiro por meio do modelo de equilíbrio geral computável inter-regional B-MARIA-RJ calibrado para o arranjo populacional do Rio de Janeiro. Foram simulados choques na produtividade do trabalho para 22 setores da economia em quatro regiões: município do Rio de Janeiro; restante do arranjo populacional do Rio de Janeiro; resto do Estado do Rio de Janeiro; e demais regiões do Brasil. Os choques resultaram em queda no PIB (-9,3%), consumo das famílias (-16,9%) e emprego (-13,3%) no município cariosa, sendo o setor mais afetado, o de alojamento e alimentação. Dentre os impactos regionais, o Arranjo Populacional do Rio de Janeiro e o município do Rio de Janeiro foram as regiões mais afetadas; enquanto os setores, o de serviços de alojamento foi o mais impactado, regional e nacionalmente. Os choques na produtividade do trabalho provenientes da pandemia impactaram os indicadores setoriais de forma heterogênea, portando, a ação governamental deve considerar as particularidades de cada um dos setores e regiões de forma a mitigar os impactos negativos provenientes da pandemia sobre a economia regional e nacional de forma eficiente.