The family Closteroviridae revised

Martelli, G. P.; Agranovsky, A. A.; Bar‐Joseph, M.; Boscia, D.; Candresse, Thierry; Coutts, Robert H.A.; Dolja, Valerian V.; Falk, Bryce W.; Gonsalves, D.; Wilhelm, Jochen; Karasev, Alexander V.; Minafra, A.; Namba, Susumu; Vetten, H. J.; Wisler, G. C.; Yoshikawa, Nobuyuki

doi:10.1007/s007050200048

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“…This could be an argument against the creation of a family regrouping these viruses. However, there are several other examples of families (e.g., Potyviridae, Closteroviridae) or even genera (e.g., Begomovirus in the family Geminiviridae) that include members that have either bipartite and monopartite genomes [2,25,36]. In spite of their apparent diversity, plant picornavirales share several similar features in their genomic organizations (Fig.…”

Section: Virus Structurementioning

confidence: 99%

Secoviridae: a proposed family of plant viruses within the order Picornavirales that combines the families Sequiviridae and Comoviridae, the unassigned genera Cheravirus and Sadwavirus, and the proposed genus Torradovirus

Sanfaçon

Wellink

Gall³

et al. 2009

Arch Virol

240

139

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Section: Virus Structurementioning

confidence: 99%

Secoviridae: a proposed family of plant viruses within the order Picornavirales that combines the families Sequiviridae and Comoviridae, the unassigned genera Cheravirus and Sadwavirus, and the proposed genus Torradovirus

Sanfaçon

Wellink

Gall³

et al. 2009

Arch Virol

240

139

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“…Podem estar envolvidas no complexo viral causador desta doença até nove espécies (GLRaV-1 a -9), destacando-se, pela incidência e danos que ocasionam, as espécies GLRaV-1 e GLRaV-3 (família Closteroviridae, gênero Ampelovirus) e GLRaV-2, a única espécie do complexo classificada na família Closteroviridae, gênero Closterovirus (Fajardo et al, 2003;Fauquet et al, 2005). O GLRaV-2 também se destaca pelos sintomas específicos que pode induzir, pois está associado aos sintomas de incompatibilidade da enxertia e de declínio em vinhedos jovens (Abou Ghanem-Sabanadzovic et al, 2000;Martelli et al, 2002;Bertazzon & Angelini, 2004;Meng et al, 2005a). O GLRaV-2 possui partículas alongadas e flexuosas, genoma de RNA de fita simples e senso positivo com 16.494 nt e oito ORFs.…”

Section: Introductionunclassified

Variabilidade do gene da proteína capsidial de três espécies virais que infectam videiras no Brasil

Radaelli¹,

Fajardo²,

Nickel³

et al. 2009

Trop. plant pathol.

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RESUMOO objetivo deste trabalho foi avaliar a variabilidade de três vírus (Rupestris stem pitting-associated virus -RSPaV, Grapevine leafroll-associated virus 2 -GLRaV-2 e Grapevine fanleaf virus -GFLV) que infectam videiras no Brasil, através da caracterização molecular do gene da proteína capsidial (CP). Foram amplificados fragmentos que compreendem os genes completos da CP de nove isolados de RSPaV (780 pb), seis de GLRaV-2 (597 pb) e três de GFLV (1515 pb) por RT-PCR, utilizando-se oligonucleotídeos específicos para cada espécie viral. Os DNAs amplificados foram clonados e sequenciados. Os isolados de RSPaV foram reunidos em quatro grupos pela análise filogenética das sequências obtidas com valores de identidade de nucleotídeos (nt) que variaram de 81 a 99%. Para GLRaV-2, dois grupos foram definidos a partir das sequências de nt, com valores de identidade que variaram de 88 a 99% e, para GFLV, foram definidos dois grupos, com valores de identidade de nt que variaram de 89 a 98%. Os diferentes isolados das três espécies virais estudadas também foram detectados utilizando-se hibridização com sondas não-radioativas, marcadas com digoxigenina, possibilitando identificar de forma inequívoca as amostras infectadas, independentemente dos isolados virais empregados para síntese das sondas. Palavras-chave: RSPaV, GLRaV-2, GFLV, RT-PCR, Vitis spp., sonda não-radioativa. ABSTRACT Coat protein gene variability of three viral species infecting grapevines in BrazilThe purpose of this study was to evaluate the variability of three viruses (Rupestris stem pitting-associated virus -RSPaV, Grapevine leafroll-associated virus 2 -GLRaV-2 and Grapevine fanleaf virus -GFLV) infecting grapevines in Brazil, through molecular characterization of the coat protein (CP) gene. DNA fragments were amplified comprising the complete CP genes of nine isolates of RSPaV (780 bp), six of GLRaV-2 (597 bp) and three of GFLV (1515 bp) by RT-PCR, using specific primers for each viral species. The amplified DNA fragments were cloned and sequenced. RSPaV isolates were clustered into four groups by phylogenetic analysis of the nucleotide (nt) sequences of the CP gene, showing identity values ranging from 81 to 99%. For GLRaV-2, two groups were defined from nt sequences, with identity values ranging from 88 to 99% and for GFLV, two groups were defined with identity values ranging from 89 to 98%. The isolates of each viral species studied here were detected by non-radioactive probes labeled with digoxigenin, allowing unambiguous identification of infected samples, independent of the isolate used as template for probe synthesis.

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“…Sua análise filogenética é baseada em motivos conservado da proteína Hsp70 e a principal proteína de revestimento a CP (Figura 3). Estes genes são usados para identificação da família e têm sido alvo de estudos para as variabilidade genética e evolução dos membros da família (Martelli et al, 2002;Tzanetakis, et al, 2007).…”

Section: Família Closteroviridaeunclassified

“…Os vetores do velarivírus não são conhecidos (Martelli et al, 2002;. Exceto para velarivírus, todos são transmitidos de forma não persistente independentemente do tipo de vetor e são patogênicos para uma ampla gama de culturas herbáceas e lenhosas, a que podem causar grandes danos.…”

Section: Família Closteroviridaeunclassified

“…......................................................................................... 31 1.2.2 Família Bunyaviridae ........................................................................................ Closterovírus são transmitidos por afídios; ampelovírus por cochonilhas e crinivírus por mosca branca. Os vetores do velarivírus não são conhecidos (Martelli et al, 2002;. Exceto para velarivírus, todos são transmitidos de forma não persistente independentemente do tipo de vetor e são patogênicos para uma ampla gama de culturas herbáceas e lenhosas, a que podem causar grandes danos.…”

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Detecção e análise filogenética de vírus em melancia e construção de novos vetores virais para expressão de proteínas em células de inseto

Quirino¹

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por estar sempre disposto a me ajudar e principalmente pelo incentivo nas horas difíceis.Aos membros da banca por aceitarem gentilmente a participar da minha Defesa de Tese e por contribuírem para o melhorar o trabalho.À Universidade de Brasília pela oportunidade de crescimento profissional.À CAPES, pelo apoio financeiro.A todos que de alguma forma contribuíram para a minha formação. ......................................................................................... 31 1.2.2 Família Bunyaviridae ........................................................................................ Closterovírus são transmitidos por afídios; ampelovírus por cochonilhas e crinivírus por mosca branca. Os vetores do velarivírus não são conhecidos (Martelli et al., 2002;. Exceto para velarivírus, todos são transmitidos de forma não persistente independentemente do tipo de vetor e são patogênicos para uma ampla gama de culturas herbáceas e lenhosas, a que podem causar grandes danos. Distintos geminivírus podem infectar plantas monocotiledoneas, dicotiledoneas e também são encontrados em infecções mistas (King et al., 2011). São vírus importantes, dos quais causam sérios prejuízos sobre ampla variedade de plantas, sendo considerada a segunda família mais numerosas entre os fitovírus, ultrapassada apenas pela famíliaPotyviridae. As doenças causadas por geminivírus, provavelmente podem ter surgido devido a diferentes fatores, abrangendo também a recombinação de diferentes geminivírus co-infectando uma planta e, com isso possivelmente surgindo vírus mais 36 virulentos (Briddon et al., 1996). Família LuteoviridaeOs membros da família Luteoviridae pertencem aos gêneros Luteovirus, A poliproteína é clivada por três proteases codificadas pelo próprio vírus denominadas P1, HC-Pro e NIa, atuando em locais específicos em cada espécie. As proteases P1 e HC-Pro autoclivam-se e a NIa está envolvida em seu próprio processo de clivagem em cis e em seis clivagens adicionais em trans, no total de oito a dez peptídeos maduros (Adams et al., 2005; Chung et al., 2008;Azad et al., 2014) (Tabela 2). 39Tabela 2: As propriedades das diferentes proteínas de potyvírus (adaptda King et al., 2011; Chung et al., 2008). Proteínas Funções P1 (32-64 K) O primeiro produto da poliproteína potyviral, é uma proteína cujas funções durante o ciclo de infecção são desconhecidas;  Contribui para o ciclo de infecção do vírus, mas não é essencial;  Um domínio carboxi terminal de serina-protease que catalisa a sua clivagem a partir do próprio poliproteína viral;  Exibe forte de atividade de ligação ao RNA;  Tamanho das sequências nucleotídicas, são variáveis em diferentes espécies do género. HC-Pro (56-58 K) "Helper componentproteinase" Uma cisteína proteinase que auto-cliva a poliproteína viral no C-terminal;  Sintomatologia  Transmissão pulgão  Circulação sistêmica  Inibe a defesa do hospedeiro, supressão de silenciamento gênico P3 (37 K)  Patogenicidade planta;  Possivelmente âncoras para o complexo de replicação na membrana. 6K1Funcionalidade de...

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The family Closteroviridae revised

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Secoviridae: a proposed family of plant viruses within the order Picornavirales that combines the families Sequiviridae and Comoviridae, the unassigned genera Cheravirus and Sadwavirus, and the proposed genus Torradovirus

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