Taxonomic structure and resistance of pathogens of nosocomial pneumonia in cancer patients
Search citation statements
Paper Sections
Citation Types
Year Published
Publication Types
Relationship
Authors
Journals
Cited by 3 publications
References 11 publications
Monitoring of the Frequency of Occurrence and Antibiotic Sensitivity of Pathogens of Bloodstream Infections in Patients with Oncohematological Profile
Цель. Анализ спектра выделенных на протяжении 2016–2022 гг. штаммов микроорганизмов, вызывавших инфекционные осложнения у пациентов онкогематологических отделений многопрофильного стационара; оценка уровня их резистентности для назначения своевременной антибактериальной терапии. Материалы и методы. Было проведено ретроспективное изучение микробиологических штаммов, выделенных в отделениях гематологического центра ГВКГ им. Н.Н. Бурденко от пациентов мужского и женского пола различного возраста с диагнозами: хронические и острые лейкозы, миеломы, лимфомы и другие заболевания, сопровождающиеся нарушением нормального процесса образования крови. Отбор биоматериала выполнялся из периферических вен и, как правило, на подъеме температуры. Выделение микроорганизмов осуществлялось стандартными микробиологическими методами с использованием гемокультиваторов BD Bactec 9050 или BacT/ALERT 3D. Идентификация патогенов и определение их чувствительности к антибактериальным препаратам – на бактериологических анализаторах Vitek 2 Compact и Phoenix M50 с последующей интерпретацией согласно требованиям EUCAST, v 11.0. Результаты. Было исследовано 3146 проб крови, выделено и протестировано 1416 штаммов бактерий. Количество пациентов с инфекцией кровотока составило 32,9%. Дрожжеподобные грибы выделены в 3,3% проб. В этиологической структуре возбудителей инфекций кровотока у онкогематологических пациентов на протяжении всего периода исследования преобладали грамположительные микроорганизмы (в основном коагулазонегативные стафилококки), частота их встречаемости возросла с 66,0 до 75,9%. Удельный вес грамотрицательной флоры за исследуемый период снизился с 34,0 до 24,1%. Грамотрицательные бактерии были представлены в основном энтеробактериями (K. pneumoniae, E. coli) и неферментирующими грамотрицательными бактериями рода Acinetobacter spp. Доля дрожжеподобных грибов значительно уменьшилась – с 12,8 до 5,0%. Преобладали дрожжеподобные грибы рода Candida – C. albicans и C. glabrata. Чувствительность выделенных микроорганизмов изменилась следующим образом. Доля метициллинрезистентных S. epidermidis снизилась на 6,5%, в то время как доля метициллинрезистентных S. aureus практически не изменилась (1%). Максимальное снижение чувствительности среди коагулазонегативных стафилококков произошло по отношению к фторхинолонам, левофлоксацину и моксифлоксацину (на 16,4% и 22,0% соответственно), а у S. aureus только по отношению к левофлоксацину на 15,6%. В группе стрептококков-энтерококков наибольшее снижение чувствительности произошло по отношению к левофлоксацину (на 12%) и пенициллинам (на 20%). Частота встречаемости ванкомицинрезистентных E. faecalis возросла на 4%. Представители энтеробактерий K. pneumoniae снизили свою чувствительность к аминогликозидам (гентамицину – на 18,6%, амикацину – на 25,9%), к цефалоспоринам 3–4-го поколения (цефтазидиму – на 5,8% и цефепиму – на 7,9%). Уровень чувствительности к карбапенемам снизился в среднем на 10%. K. pneumoniae в 80% случаев вырабатывали карбапенемазы и более чем в 20% – β-лактамазы расширенного спектра. Максимальное снижение уровня чувствительности E. coli зарегистрировано по отношению к гентамицину (на 11,7%) и ампициллину (на 16,7%). Штаммы E. coli лишь в 8% случаев вырабатывали карбапенемазы и в 5% – β-лактамазы расширенного спектра. Заключение. Мониторинг частоты встречаемости микроорганизмов – возбудителей инфекций кровотока у онкогематологических пациентов, а также их антибиотикочувствительности имеет большое значение в клинической практике с целью обеспечения рациональной антибактериальной терапии. Purpose. Analysis of the spectrum of strains of microorganisms isolated during 2016– 2022 that caused infectious complications in patients of oncohematology departments of the multidisciplinary hospital; assessment of their resistance level for the appointment of timely antibacterial therapy. Materials and methods. A retrospective study of microbiological strains isolated in the departments of the Hematology Center of the Burdenko Main Military Clinical Hospital from male and female patients of various ages with diagnoses of chronic and acute leukemias, myelomas, lymphomas and other diseases accompanied by a violation of the normal process of blood formation was conducted. The selection of biomaterial was performed from peripheral veins and, as a rule, at an increase in temperature. Microorganisms were isolated using standard microbiological methods using BD Bactec 9050 or BacT/ALERT 3D hemocultivators. Identification of pathogens and determination of their sensitivity to antibacterial drugs using Vitek 2 Compact and Phoenix M50 bacteriological analyzers, followed by interpretation according to the requirements of EUCAST, v 11.0. Results. 3146 blood samples were examined, 1416 bacterial strains were isolated and tested. The number of patients with blood stream infection was 32.9%. Yeast-like fungi were isolated in 3.3% of the samples. Gram-positive microorganisms (mainly coagulase-negative staphylococci) prevailed in the etiological structure of pathogens of bloodstream infections in oncohematological patients throughout the entire study period, their incidence increased from 66.0 to 75.9%. The proportion of gram-negative flora decreased from 34.0% to 24.1% during the study period. Gram-negative bacteria were mainly represented by Enterobacteria (K. pneumoniae, E. coli) and non-fermenting gram-negative bacteria of the genus Acinetobacter spp. The proportion of yeast-like fungi decreased significantly from 12.8% to 5.0%. Yeast-like fungi of the Candida genus, C. albicans and C. glabrata, prevailed. The sensitivity of the isolated microorganisms has changed as follows. The proportion of methicillin-resistant S. epidermidis decreased by 6.5%, while the proportion of methicillin-resistant S. aureus remained virtually unchanged (1%). The maximum decrease in sensitivity among coagulase-negative staphylococci occurred in relation to the fluoroquinolones levofloxacin and moxifloxacin (by 16.4% and 22.0%, respectively), and in S. aureus only in relation to levofloxacin by 15.6% in the group of streptococcal. Representatives of enterobacteria K. pneumoniae decreased their sensitivity to aminoglycosides (gentamicin – by 18.6%, amikacin – by 25.9%), to cephalosporins of the 3rd–4th generation (ceftazidime – by 5.8% and cefepime – by 7.9%). The level of sensitivity to carbapenems decreased by an average of 10%. K. pneumoniae produced carbapenemases in 80% of cases and extended-spectrum lactamases in more than 20%. The maximum decrease in the level of E. coli sensitivity was recorded in relation to gentamicin (by 11.7%) and ampicillin (by 16.7%). E. coli strains produced carbapenemases in only 8% of cases and extended-spectrum beta-lactamases in 5%. Conclusion. Monitoring the frequency of occurrence of microorganisms that cause blood stream infections in oncohematological patients, as well as their antibiotic sensitivity, is of great importance in clinical practice in order to ensure rational antibacterial therapy.
Monitoring of the Frequency of Occurrence and Antibiotic Sensitivity of Pathogens of Bloodstream Infections in Patients with Oncohematological Profile
Цель. Анализ спектра выделенных на протяжении 2016–2022 гг. штаммов микроорганизмов, вызывавших инфекционные осложнения у пациентов онкогематологических отделений многопрофильного стационара; оценка уровня их резистентности для назначения своевременной антибактериальной терапии. Материалы и методы. Было проведено ретроспективное изучение микробиологических штаммов, выделенных в отделениях гематологического центра ГВКГ им. Н.Н. Бурденко от пациентов мужского и женского пола различного возраста с диагнозами: хронические и острые лейкозы, миеломы, лимфомы и другие заболевания, сопровождающиеся нарушением нормального процесса образования крови. Отбор биоматериала выполнялся из периферических вен и, как правило, на подъеме температуры. Выделение микроорганизмов осуществлялось стандартными микробиологическими методами с использованием гемокультиваторов BD Bactec 9050 или BacT/ALERT 3D. Идентификация патогенов и определение их чувствительности к антибактериальным препаратам – на бактериологических анализаторах Vitek 2 Compact и Phoenix M50 с последующей интерпретацией согласно требованиям EUCAST, v 11.0. Результаты. Было исследовано 3146 проб крови, выделено и протестировано 1416 штаммов бактерий. Количество пациентов с инфекцией кровотока составило 32,9%. Дрожжеподобные грибы выделены в 3,3% проб. В этиологической структуре возбудителей инфекций кровотока у онкогематологических пациентов на протяжении всего периода исследования преобладали грамположительные микроорганизмы (в основном коагулазонегативные стафилококки), частота их встречаемости возросла с 66,0 до 75,9%. Удельный вес грамотрицательной флоры за исследуемый период снизился с 34,0 до 24,1%. Грамотрицательные бактерии были представлены в основном энтеробактериями (K. pneumoniae, E. coli) и неферментирующими грамотрицательными бактериями рода Acinetobacter spp. Доля дрожжеподобных грибов значительно уменьшилась – с 12,8 до 5,0%. Преобладали дрожжеподобные грибы рода Candida – C. albicans и C. glabrata. Чувствительность выделенных микроорганизмов изменилась следующим образом. Доля метициллинрезистентных S. epidermidis снизилась на 6,5%, в то время как доля метициллинрезистентных S. aureus практически не изменилась (1%). Максимальное снижение чувствительности среди коагулазонегативных стафилококков произошло по отношению к фторхинолонам, левофлоксацину и моксифлоксацину (на 16,4% и 22,0% соответственно), а у S. aureus только по отношению к левофлоксацину на 15,6%. В группе стрептококков-энтерококков наибольшее снижение чувствительности произошло по отношению к левофлоксацину (на 12%) и пенициллинам (на 20%). Частота встречаемости ванкомицинрезистентных E. faecalis возросла на 4%. Представители энтеробактерий K. pneumoniae снизили свою чувствительность к аминогликозидам (гентамицину – на 18,6%, амикацину – на 25,9%), к цефалоспоринам 3–4-го поколения (цефтазидиму – на 5,8% и цефепиму – на 7,9%). Уровень чувствительности к карбапенемам снизился в среднем на 10%. K. pneumoniae в 80% случаев вырабатывали карбапенемазы и более чем в 20% – β-лактамазы расширенного спектра. Максимальное снижение уровня чувствительности E. coli зарегистрировано по отношению к гентамицину (на 11,7%) и ампициллину (на 16,7%). Штаммы E. coli лишь в 8% случаев вырабатывали карбапенемазы и в 5% – β-лактамазы расширенного спектра. Заключение. Мониторинг частоты встречаемости микроорганизмов – возбудителей инфекций кровотока у онкогематологических пациентов, а также их антибиотикочувствительности имеет большое значение в клинической практике с целью обеспечения рациональной антибактериальной терапии. Purpose. Analysis of the spectrum of strains of microorganisms isolated during 2016– 2022 that caused infectious complications in patients of oncohematology departments of the multidisciplinary hospital; assessment of their resistance level for the appointment of timely antibacterial therapy. Materials and methods. A retrospective study of microbiological strains isolated in the departments of the Hematology Center of the Burdenko Main Military Clinical Hospital from male and female patients of various ages with diagnoses of chronic and acute leukemias, myelomas, lymphomas and other diseases accompanied by a violation of the normal process of blood formation was conducted. The selection of biomaterial was performed from peripheral veins and, as a rule, at an increase in temperature. Microorganisms were isolated using standard microbiological methods using BD Bactec 9050 or BacT/ALERT 3D hemocultivators. Identification of pathogens and determination of their sensitivity to antibacterial drugs using Vitek 2 Compact and Phoenix M50 bacteriological analyzers, followed by interpretation according to the requirements of EUCAST, v 11.0. Results. 3146 blood samples were examined, 1416 bacterial strains were isolated and tested. The number of patients with blood stream infection was 32.9%. Yeast-like fungi were isolated in 3.3% of the samples. Gram-positive microorganisms (mainly coagulase-negative staphylococci) prevailed in the etiological structure of pathogens of bloodstream infections in oncohematological patients throughout the entire study period, their incidence increased from 66.0 to 75.9%. The proportion of gram-negative flora decreased from 34.0% to 24.1% during the study period. Gram-negative bacteria were mainly represented by Enterobacteria (K. pneumoniae, E. coli) and non-fermenting gram-negative bacteria of the genus Acinetobacter spp. The proportion of yeast-like fungi decreased significantly from 12.8% to 5.0%. Yeast-like fungi of the Candida genus, C. albicans and C. glabrata, prevailed. The sensitivity of the isolated microorganisms has changed as follows. The proportion of methicillin-resistant S. epidermidis decreased by 6.5%, while the proportion of methicillin-resistant S. aureus remained virtually unchanged (1%). The maximum decrease in sensitivity among coagulase-negative staphylococci occurred in relation to the fluoroquinolones levofloxacin and moxifloxacin (by 16.4% and 22.0%, respectively), and in S. aureus only in relation to levofloxacin by 15.6% in the group of streptococcal. Representatives of enterobacteria K. pneumoniae decreased their sensitivity to aminoglycosides (gentamicin – by 18.6%, amikacin – by 25.9%), to cephalosporins of the 3rd–4th generation (ceftazidime – by 5.8% and cefepime – by 7.9%). The level of sensitivity to carbapenems decreased by an average of 10%. K. pneumoniae produced carbapenemases in 80% of cases and extended-spectrum lactamases in more than 20%. The maximum decrease in the level of E. coli sensitivity was recorded in relation to gentamicin (by 11.7%) and ampicillin (by 16.7%). E. coli strains produced carbapenemases in only 8% of cases and extended-spectrum beta-lactamases in 5%. Conclusion. Monitoring the frequency of occurrence of microorganisms that cause blood stream infections in oncohematological patients, as well as their antibiotic sensitivity, is of great importance in clinical practice in order to ensure rational antibacterial therapy.
В работе обсуждается проблема бактериальных инфекций, вызывающих осложнения у онкологических больных. Продемонстрированы данные, полученные в «НМИЦ онкологии им. Н. Н. Блохина» МЗ РФ о частоте выявления резистентных грамотрицательных и грамположительных бактерий из биоматериалов от больных клиники. Приводятся данные исследований механизмов резистентности, которые проводились на молекулярно-генетическом уровне. Отмечено относительное увеличение доли грамположительных микроорганизмов, в частности, коагулазонегативных стафилококков. Резистентность стафилококков обусловлена наличием генов mecA. В то же время ген резистентности к антибиотикам cfr отсутствует. Однако, выявленная у коагулазонегативных стафилокококков мутация 23SrRNA свидительствует о формировании резистентности. Среди мультирезистентных грамотрицательных микроорганизмов превалируют Klebsiella pneumoniae, Pseudomonas aeruginosa. 88,2 % изолятов клебсиелл имеют гены продукции сериновых карбапенемаз OXA-48. 46,7 % изолятов синегнойных палочек имеют гены продукции металло-беталактамаз VIM. 97,1 % изолятов Acinetobacter baumannii имеют гены продукции серино- вых карбапенемаз OXA-23. В большинстве случаев продукции карбапенемаз сопутствовал механизм нарушения проникновения карбапенемов в микробную клетку. Знание механизмов резистентности основных возбудителей инфекции дает возможность врачу выбирать оптимальные комбинации антибиотиков. Увеличение разнообразия выделяемых от больных бактериальных микроорганизмов косвенно говорит о возможности появления новых резистентных возбудителей, таких как Burkholderia cepacia, Achromobacter xylosoxidans и др. Также возможен рост числа резистентных штаммов среди обычно чувствительных возбудителей — кишечной палочки, энтеробактеров и протеев.
Structure of Microorganisms Isolated From Bronhoalveolar Lavage From Patients in the Department of Reanimation and Intensive Therapy
The aim of the work was to determine and compare the structure of microorganisms isolated from bronchoalveolar lavage from patients in the ICU of Clinics in 2016 and 2019. This work presents the results of a bacteriological examination of 229 samples from 139 patients for 2016 and 387 samples from 218 patients for 2019. The predominant microorganism in 2016 was Acinetobacter baumanii - 75 (26.2%). Less common were Klebsiella pneumoniae - 55 (19.2%), Pseudomonas aeruginosa - 35 (12.2%), Escherichia coli - 19 (6.6%). In 2019, the prevailing microorganism was K.pneumoniae - 158 (19.1%). As in 2016, A.baumanii - 115 (13.9%) and P. aeruginosa - 57 (6.9%) were most often found, but unlike 2016, in 2019 there was a high incidence of such pathogens as Enterococcus faecalis - 52 (6.3%), Candida albicans - 43 (5.2%), Staphylococcus aureus and Stenotrophomonas maltophilia - 40 (4.8%). One of the features is the presence of polymicrobial associations. In 2016, microorganisms isolated in monoculture predominated (53.4%), while in 2019 the frequency of occurrence of monocultures decreased and amounted to 24.7%. At the same time, a two-component association prevailed (31.5%). Thus, in ICU it is necessary to regularly monitor nosocomial pathogens not only to make the right decision when choosing antimicrobial therapy, but also to identify new potential nosocomial pathogens.
scite is a Brooklyn-based organization that helps researchers better discover and understand research articles through Smart Citations–citations that display the context of the citation and describe whether the article provides supporting or contrasting evidence. scite is used by students and researchers from around the world and is funded in part by the National Science Foundation and the National Institute on Drug Abuse of the National Institutes of Health.
Contact Info
hi@scite.ai
10624 S. Eastern Ave., Ste. A-614
Henderson, NV 89052, USA
Product
Resources
Copyright © 2024 scite LLC. All rights reserved.
Made with 💙 for researchers
Part of the Research Solutions Family.
