Strategy for Rapid Identification and Antibiotic Susceptibility Testing of Gram-Negative Bacteria Directly Recovered from Positive Blood Cultures Using the Bruker MALDI Biotyper and the BD Phoenix System

Wimmer, Jana L.; Long, S. Wesley; Cernoch, Patricia L.; Land, Geoffrey A.; Davis, James R.; Musser, James M.; Olsen, Randall J.

doi:10.1128/jcm.00409-12

Cited by 66 publications

(44 citation statements)

References 14 publications

Supporting

Mentioning

Contrasting

Unclassified

Order By: Relevance

“…In recent years, MALDI-TOF MS has been developed for rapid and accurate identification of pathogens in blood cultures (25). Although MALDI-TOF MS reduces the time to identification when performed on blood cultures, it is not performed until a positive blood culture signal has been obtained, and therefore it registers a result hours after the methods reported here.…”

Section: Figmentioning

confidence: 99%

Colorimetric Sensor Array Allows Fast Detection and Simultaneous Identification of Sepsis-Causing Bacteria in Spiked Blood Culture

Lim

Mix

et al. 2014

J Clin Microbiol

View full text Add to dashboard Cite

Sepsis is a medical emergency demanding early diagnosis and tailored antimicrobial therapy. Every hour of delay in initiating effective therapy measurably increases patient mortality. Blood culture is currently the reference standard for detecting bloodstream infection, a multistep process which may take one to several days. Here, we report a novel paradigm for earlier detection and the simultaneous identification of pathogens in spiked blood cultures by means of a metabolomic "fingerprint" of the volatile mixture outgassed by the organisms. The colorimetric sensor array provided significantly faster detection of positive blood cultures than a conventional blood culture system (12.1 h versus 14.9 h, P < 0.001) while allowing for the identification of 18 bacterial species with 91.9% overall accuracy within 2 h of growth detection. The colorimetric sensor array also allowed for discrimination between unrelated strains of methicillin-resistant Staphylococcus aureus, indicating that the metabolomic fingerprint has the potential to track nosocomial transmissions. Altogether, the colorimetric sensor array is a promising tool that offers a new paradigm for diagnosing bloodstream infections.

show abstract

Section: Figmentioning

confidence: 99%

Colorimetric Sensor Array Allows Fast Detection and Simultaneous Identification of Sepsis-Causing Bacteria in Spiked Blood Culture

Lim

Mix

et al. 2014

J Clin Microbiol

View full text Add to dashboard Cite

show abstract

“…We have since successfully implemented in our clinical microbiology laboratory that serves as the reference laboratory for the HM system. 17 Prior to using MALDI-TOF, positive blood culture specimens were inoculated on appropriate solid agar media and subsequently identified by conventional clinical microbiology procedures.…”

Section: Data Collection and Definitionsmentioning

confidence: 99%

Integrating Rapid Diagnostics and Antimicrobial Stewardship in Two Community Hospitals Improved Process Measures and Antibiotic Adjustment Time

Lockwood

Perez

Musick

et al. 2016

Infect. Control Hosp. Epidemiol.

Self Cite

View full text Add to dashboard Cite

objective. To assess the impact of Matrix-Assisted Laser Desorption/Ionization Time-of-Flight (MALDI-TOF) mass spectrometry for rapid pathogen identification directly from early-positive blood cultures coupled with an antimicrobial stewardship program (ASP) in two community hospitals. Process measures and outcomes prior and after implementation of MALDI-TOF/ASP were evaluated.design. Multicenter retrospective study.setting. Two community hospitals in a system setting, Houston Methodist (HM) Sugar Land Hospital (235 beds) or HM Willowbrook Hospital (241 beds).patients. Patients ≥18 years of age with culture-proven Gram-negative bacteremia.intervention. Blood cultures from both hospitals were sent to and processed at our central microbiology laboratory. Clinical pharmacists at respective hospitals were notified of pathogen ID and susceptibility results.results. We evaluated 572 patients for possible inclusion. After pre-defined exclusion criteria, 151 patients were included in the pre-intervention group and 242 were included in the intervention group. After MALDI-TOF/ASP implementation, the mean identification time after culture positivity was significantly reduced from 32 hours (±16 hours) to 6.5 hours (±5.4 hours) (P < .001); mean time to susceptibility results was significantly reduced from 48 (±22) hours to 23 (±14) hours (P < .001); and time to therapy adjustment was significantly reduced from 75 (±59) hours to 30 (±30) hours (P < .001). Mean hospital costs per patient were $3,411 less in the intervention group compared with the pre-intervention group ($18,645 vs $15,234; P = .04).conclusion. This study is the first to analyze the impact of MALDI-TOF coupled with an ASP in a community hospital setting. Time to results significantly differed with the use of MALDI-TOF, and time to appropriate therapy was significantly improved with the addition of ASP.

show abstract

“…Az identifi kálás ideje, az előkészítő lépéseket is beleszámítva, körülbelül 30-40 perc, amely után az identifi kálás eredménye és az identifi kált törzs természetes rezisztenciája egy előzetes leletben közölhető. A baktériumüledék bizonyos szerzett rezisztenciamechanizmusok gyors kimutatására is alkalmas: például betaLACTA gyorsteszt (BioRad) a 3. generációs cephalosporinbontást detektálja, vagy PBP-latex gyorsteszt a methicillinrezisztencia kimutatására alkalmas, illetve az üledékből ismerve a baktériumspeciest, megkísérelhető automata rendszerrel az antibiotikumér-zékenységi vizsgálat [41]. Így átlagosan 12 óra alatt elkészülhet a teljes mikrobiológiai lelet.…”

Section: Baktériumok éS Gombák Direkt Kimutatása Pozitív Hemokultúrábunclassified

“…Így átlagosan 12 óra alatt elkészülhet a teljes mikrobiológiai lelet. Több felmérés alapján a különböző minta-előkészítési protokollokat alkalmazva 75-96%-ban sikerült speciesszinten identifikálni a kórokozót a pozitív jelzést adó hemokultúra-palackból [41,42]. Fontos kiemelni, hogy félrevezető eredményt adhat a többféle baktériumot tartalmazó pozitív hemokultúraminták direkt MALDI-TOF MS-vizsgálata (általában a domináns mikroba kerül azonosí-tásra), így a pozitív hemokultúrapalackból készített natív, illetve Gram-festett kenet mikroszkópos vizsgálata még MALDI-TOF MS-technika mellett sem nélkülözhető.…”

Section: Baktériumok éS Gombák Direkt Kimutatása Pozitív Hemokultúrábunclassified

Special application of matrix-assisted laser desorption ionization time-of-flight mass spectrometry in clinical microbiological diagnostics

et al. 2014

View full text Add to dashboard Cite

A mikrobiológiai diagnosztika területén kevés technikai fejlesztés volt az elmúlt évtizedekben, amely olyan rohamos fejlődést hozott volna a baktériumok és gombák fajszintű (speciesszintű) identifi kálásában, mint a "matrix-assisted laser desorption ionization time-of-fl ight" tömegspektrometria. A klinikai mikrobiológiai gyakorlatban ennek jelentősége felbecsülhetetlen, hiszen a kórokozó ismerete jelentősen befolyásolja a terápiás választást még az antimikrobás szerrel szembeni rezisztencia meghatározása előtt. A hagyományos speciesmeghatározás számos, a környezeti hatá-sok által befolyásolt biokémiai reakción alapszik és sok esetben igen időigényes folyamat. A speciális tömegspektro-metriás módszer néhány perc alatt elvégzi a kitenyésztett baktérium vagy gomba pontos identifi kálását a konzervált riboszomális fehérjék tömegspektrometriás mérése alapján. Emellett a módszer alkalmazásának lehetőségét számos más új területen is kutatják. Így például a pozitív hemokultúrákból történő direkt kórokozó-meghatározás segítségé-vel hamarabb megkezdhető a szeptikus beteg célzott antibiotikumkezelése. Lehetőség van a kórokozó direkt azonosítására pozitív vizeletmintából, esetleg egyébként steril testnedvekből, vagy megkísérelhető szelektív dúsítást követően Salmonella kimutatása székletből. Az izolált baktériumok "extended spectrum beta-lactamase" és karbapenemáztermelésének gyors kimutatása segítheti a terápiás választást. Ez a tömegspektrometriás módszer a közeljövő-ben a klinikai mikrobiológiai diagnosztika más területein is teret nyerhet, így például használható lehet a dezoxiribonukleinsav és a ribonukleinsav analízisére, gyors komplett rezisztencia meghatározására és más proteomikai alkalmazásokra is. A közlemény rövid áttekintést kíván adni ennek az új technikának a klinikai mikrobiológiai diagnosztikában való jelenlegi alkalmazhatóságáról. Orv. Hetil., 2014, 155(38), 1495-1503. Kulcsszavak: MALDI-TOF MS, speciesidentifi kálás, tipizálás, rezisztenciameghatározás Special application of matrix-assisted laser desorption ionization time-of-fl ight mass spectrometry in clinical microbiological diagnosticsMatrix-assisted laser desorption ionization time-of-fl ight mass spectrometry as a new possibility for rapid identifi cation of bacteria and fungi revolutionized the clinical microbiological diagnostics. It has an extreme importance in the routine microbiological laboratories, as identifi cation of the pathogenic species rapidly will infl uence antibiotic selection before the fi nal determination of antibiotic resistance of the isolate. The classical methods for identifi cation of bacteria or fungi, based on biochemical tests, are infl uenced by many environmental factors. The matrix-assisted laser desorption ionization time-of-fl ight mass spectrometry is a rapid method which is able to identify a great variety of the isolated bacteria and fungi based on the composition of conserved ribosomal proteins. Recently several other ÖSSZEFOGLALÓ KÖZLEMÉNY

show abstract

Strategy for Rapid Identification and Antibiotic Susceptibility Testing of Gram-Negative Bacteria Directly Recovered from Positive Blood Cultures Using the Bruker MALDI Biotyper and the BD Phoenix System

Cited by 66 publications

References 14 publications

Colorimetric Sensor Array Allows Fast Detection and Simultaneous Identification of Sepsis-Causing Bacteria in Spiked Blood Culture

Colorimetric Sensor Array Allows Fast Detection and Simultaneous Identification of Sepsis-Causing Bacteria in Spiked Blood Culture

Integrating Rapid Diagnostics and Antimicrobial Stewardship in Two Community Hospitals Improved Process Measures and Antibiotic Adjustment Time

Special application of matrix-assisted laser desorption ionization time-of-flight mass spectrometry in clinical microbiological diagnostics

Contact Info

Product

Resources

About