Signature Amino Acid Changes in Latent Membrane Protein 1 Distinguish Epstein–Barr Virus Strains

Abstract

Sequence variations in the Epstein-Barr virus (EBV) latent membrane protein 1 gene have been described in numerous EBV-associated tumors with some of these variations, most notably a 30-base pair deletion in the cytoplasmic carboxyl-terminal domain, suggested as associated with an increase in tumorigenicity. In this study, EBV DNA sequence was determined from 92 tissue specimens or cell lines, including nasopharyngeal carcinoma, oral hairy leukoplakia, post-transplant lymphoma, post-transplant without pathology, mononucleosis, Burkitt's lymphoma, parotid tumor, and normal from distinct geographical regions. The amino- and carboxyl-terminal sequences and, in some cases, the full-length sequences of latent membrane protein 1 were determined. Characteristic sequence patterns distinguished strains, with the carboxyl-terminal sequence being the most informative in distinguishing among the strains. Phylogenetic relationships between strains were determined, as were signature amino acid changes that discriminate between them. A correlation between strain and disease or strain and geographic location was not detected. The sequence variation and signature sequences identified at least seven distinct strains, as well as hybrid strains that apparently result from recombination.

Interaction of Epstein-Barr Virus Latent Membrane Protein 1 with SCFHOS/β-TrCP E3 Ubiquitin Ligase Regulates Extent of NF-κB Activation

“…Similar substitution within the DG-SXXS motif in I B␣ abrogated the ability of I B␣ to recruit ␤-TrCP/HOS (66). Furthermore, substitutions of Ser-366 (such as S366T, S366A, and S366N) are observed more frequently in LMP1 isolates from EBV-associated tumors than in LMP1 from peripheral blood lymphocytes from apparently healthy individuals (30,39,65,67,68). G212S mutation may not be as common as substitution of Ser-366 (65, 67).…”

Epstein–barr Virus in the Population of Two Geographically Different Regions of Russia

“…Нуклеотидные после-довательности изолятов LMP1, амплифициро-ванные из изучаемых образцов крови/смывов ротоглотки и транслированные в аминокислот-ные последовательности, подверглись класси-фикации на основании обнаруживаемых в этих последовательностях точковых мутаций, веду-щих к заменам отдельных аминокислот, фор-мированию делеций и дупликаций. При этом за основу была принята известная в литературе классификация Edwards et al [3], сформирован-ная на базе сиквенсного анализа транслирован-ных последовательностей гена LMP1, получен-ных от больных ВЭБ-ассоциированной патоло-гией и здоровых вирусоносителей из различных географических регионов мира. В классифика-ции Edwards et al обозначение вариантов LMP1 отражало их географическое происхождение: Alaskan (Ala), China 1(Ch1), China 2 (Ch2), China 3 (Ch3), Mediterranean+ (Med+), Mediterranean-(Med-) и North Carolina (NC).…”

Functional analysis of epstein-barr virus latent membrane proteins (LMP1) in patients with limphoproliferative disorders

“…Исследование отдельных мутаций этого гена выявило способность некоторых из них влиять на биологические свойства молекулы LMP1, что, вероятно, играет важную роль в этиопатогенезе заболеваний, вызываемых ВЭБ. Наибольший интерес представляют мутации C-терминального цитоплазматического домена, которые, как показано ранее, влияют на иммуногенность и время полужизни LMP1, что в конечном итоге способствует усилению его трансформирующего воздействия на клетку [13][14][15][16]. Не менее важную роль в изменениях свойств белка играют и точечные мутации, локализованные в трансмембранном домене LMP1; некоторые из них приводят к значительному снижению цитотоксического действия вирусного белка на клетку, что, возможно влияет на трансформирующий потенциал этого онкобелка [15].…”

“…Влияние мутаций на биологические свойства LMP1 особенно чётко прослеживается при сравнении двух генетически существенно различающихся вариантов этого белка, а именно обладающего низкой трансформирующей активностью прототипного LMP1-B95.8 и высокотуморогенного LMP1-Cao [13][14][15][16][17]. Эти различия выражаются в первую очередь в более высоких уровнях активации ключевых сигнальных путей клетки вариантом LMP1-Cao по сравнению с LMP1-B95.8 [7][8][9][10].…”

“…(1999), как Ch1 (China 1), Ch2 (China 2), NC (New York City), Med+ (Mediterranean +), Med-(Mediterranean -), а также низкодивергентного штамма В95.8b, предложенного в классификации Sandvej с соавт. (1997), характеризующегося минимальным набором мутаций [21,22].…”