Retrovirus Receptor Interactions and Entry

Albritton, Lorraine M.

doi:10.1016/b978-0-12-811185-7.00001-7

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“…Assim como outros retrovírus, codifica duas poliproteínas: polimerase (pol), capsídeo (gag), seguido de envelope (env) e é flanqueado por regiões repetitivas longas (LTRs), que atuam como promotores de transcrição (Figura 4) 10,14,35 . A região da polimerase é a região mais conservada do vírus, que codifica as enzimas virais da transcriptase reversa (RT), a protease (PR) e da integrase (IN) que são essenciais para a replicação viral 37,38 e na família dos gammaretrovírus está situada na mesma ORF contínua que também codifica para o gag. A expressão da polimerase aparentemente ocorre através da supressão de terminação de um códon de parada 39 .…”

Section: Genomaunclassified

Investigação e caracterização molecular do retrovírus da reticuloendoteliose aviária (REV) no Brasil

Caleiro¹

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Dedico essa dissertação aos meus pais Cléia Santos Caleiro e Cláudio Rui Mateus Caleiro, aos meus irmãos Júlia Santos Caleiro e Daniel Santos Caleiro e ao meu namorado Caio, por acreditarem em mim e a me apoiarem nesse sonho AgradecimentosEm primeiro lugar, gostaria de agradecer a minha orientadora Dra. Camila Malta Romano.Você nesses 10 anos não foi somente o meu exemplo de Cientista, mas também uma amiga a qual me apoiou, me incentivou, me ouviu e me acolheu nos momentos mais difíceis, foi mãe na hora de me puxar as orelhas, de me colocar no caminho de volta e de compreender as minhas limitações sem desistir de mim, inclusive sempre acreditando em mim. Obrigada por ter me aceito lá trás, uma menina recém chegado em São Paulo e me dado essa oportunidade e essa honra de ser sua aluna. Você é e sempre será a melhor orientadora que alguém possa ter! A todos os funcionários do IMT, obrigada pela amizade e por terem me recebido tão bem ao longo desses anos.A Dra. Carla Torre Braconi, obrigada por ter me indicado e apresentado para a Camila.A Dra. Karin Kirchgatter e aos seus alunos, por me ajudarem com os experimentos e por ter cedidos as amostras.A Juliana Summa, ao veterinário Marcos e toda a equipe do DEPAVE -3, pela colaboração e por me auxiliar nas coletas.Ao Dr Jansen pelas preciosas amostras, pela ajuda na qualificação e pela oportunidade de trabalhar juntos no ICB.Aos meus pais Cléia e Cláudio por acreditarem em mim, me apoiarem nessa jornada e acima de tudo, por todo o amor e carinho e por serem a minha inspiração. Aos meu irmãos Júlia e Daniel, por todo amor e carinho.A todos os meus queridos amigos da Santa Funda Elíseos, por terem me dado todo suporte, risadas, admiração pela minha pesquisa e principalmente pela amizade.A minha queria amiga Ana Carolina, obrigada por todos os cafés terapias, pelo apoio e todas as palavras de carinho.A Dra Ester e sua equipe, em especial a Dra Ingra Morales, Dra Jaqueline Goes, Flávia Salles e a Thaís Colete, obrigada pela ajuda, incentivo, carinho e amizade. Aos meus amigos do Viroclub, em especial Heuder, Almir, Layla e Natan obrigada pela amizade, conversas cientificas e ao carinho. Aos meus tios Josineide e Osvaldo, obrigada por me acolherem e a me ajudar em todos os momentos. Sem vocês eu não teria chegado até aqui. Aos meus sogros Celina e Marcos e minha cunhada Andréia por terem me recebido tão bem na família de vocês e por todo o apoio e carinho.Por fim ao melhor namorado Caio Santos de Souza, obrigada por ser tão companheiro, amigo, me fazer rir nos momentos difíceis, por me ajudar nos experimentos, na escrita, em tudo.Você foi fundamental pra eu chegar ate aqui. Amo você.

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Section: Genomaunclassified

Investigação e caracterização molecular do retrovírus da reticuloendoteliose aviária (REV) no Brasil

Caleiro¹

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Causes of Cancer and Mechanisms of Carcinogenesis

Tarin

2023

Understanding Cancer

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Complete Genome Characterization of Reticuloendotheliosis Virus Detected in Chickens with Multiple Viral Coinfections

Chacón

Sedano-Herrera

Alfaro-Espinoza

et al. 2022

Viruses

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Reticuloendotheliosis virus (REV) is a retroviral pathogen capable of infecting several avian hosts and is associated with immunosuppression, anemia, proventriculitis, neoplasia, and runting–stunting syndrome. Its genome contains the three major genes, gag, pol, and env, and two flanking long terminal repeat (LTR) regions. Complete genome sequences of REV are limited in terms of geographical origin. The aim of this study was to characterize the complete genome of REV detected in Brazilian chickens with multiple viral coinfections and analyze the polymorphisms in the deduced amino acids sequences corresponding to its encoded proteins. We tested the presence and completeness of REV as well as other viral pathogens in samples from Brazilian poultry farms by qPCR. The complete genomes of two REV strains were sequenced by overlapping fragments through the dideoxy method. Phylogenetic analysis, pairwise identity matrix, polymorphism identification and protein modeling were performed along the entire genome. We detected REV in 65% (26/40) of the tested samples. Concomitant viral infections were detected in 82.5% (33/40) of the samples and in 90% (9/10) of the farms. Multiple infections included up to seven viruses. Phylogenetic analysis classified both Brazilian strains into REV subtype 3, and the pairwise comparison indicated that strains from the USA and fowlpox virus (FWPV)-related strains were the most identical. The subdomain p18 in gag, the reverse transcriptase/ribonuclease H in pol, and the surface (SU) in the env protein were the most polymorphic in genomic comparisons. The relevant motifs for each protein were highly conserved, with fewer polymorphisms in the fusion peptide, immunosuppression domain, and disulfide bonds on the surface (SU) and transmembrane (TM) of env. This is the first study to include complete genomes of REV in Brazil and South America detected in farms with multiple viral coinfections. Our findings suggest an involvement of REV as an immunosuppressor and active agent in the emergence and progression of multiple infectious diseases. We also found a possible etiological relationship between Brazilian strains and the USA and FWPV recombinant strains. This information highlights the need for epidemiological vigilance regarding REV in association with another pathogens.

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Retrovirus Receptor Interactions and Entry

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Investigação e caracterização molecular do retrovírus da reticuloendoteliose aviária (REV) no Brasil

Investigação e caracterização molecular do retrovírus da reticuloendoteliose aviária (REV) no Brasil

Causes of Cancer and Mechanisms of Carcinogenesis

Complete Genome Characterization of Reticuloendotheliosis Virus Detected in Chickens with Multiple Viral Coinfections

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