Zur Überwindung der Antibiotika‐Resistenzkrise werden dringend neuartige bakterielle Angriffsziele benötigt. In diesem Artikel untersuchen wir systematisch Pyridoxalphosphat‐abhängige Enzyme (PLP‐DEs) in Bakterien, um uns auf Ziele zu konzentrieren, die an entscheidenden Stoffwechselprozessen beteiligt sind. Zu diesem Zweck haben wir acht Pyridoxal (PL)‐Sonden mit Modifikationen an verschiedenen Positionen entwickelt. Insgesamt übertrafen die Sonden die Leistung einer früheren Generation und lieferten detaillierte Informationen der PLP‐DEs in klinisch relevanten Krankheitserregern, einschließlich schwierig zu adressierender Gram‐negativer Stämme. Ausgewählte PLP‐DEs mit unbekannter Funktion wurden durch enzymatische Aktivitätsassays charakterisiert. Schließlich untersuchten wir eine Reihe von mutmaßlichen PLP‐Inhibitoren auf ihre antibiotische Aktivität und entschlüsselten die Zielenzyme aktiver Trefferverbindungen. Hier wurde ein kaum charakterisiertes Enzym, das für das bakterielle Wachstum unerlässlich ist, als PLP‐abhängige Cystein‐Desulfurase identifiziert und bestätigt, dass es durch das zugelassene Medikament Phenelzin gehemmt wird. Unser Ansatz bietet eine Grundlage für die Entschlüsselung neuartiger PLP‐DEs als essenzielle Antibiotikaziele sowie entsprechende Möglichkeiten zur Entschlüsselung kleiner Molekül‐Inhibitoren.