Recognition of Yeast Species from Gene Sequence Comparisons

Kurtzman, Cletus P.

doi:10.2174/1874136301105010020

Cited by 11 publications

(10 citation statements)

References 80 publications

Supporting

Mentioning

Contrasting

Unclassified

Order By: Relevance

“…In addition to phenotypic differentiation, the characterization of mutant strain at molecular level is essential to detect genotypic changes at nucleotide base pair level. The whole genome sequences of S. johnsonii have not been reported so far and only few sequences of rRNA gene are available in the databases which are used for molecular identification and phylogenetic inference [50,51]. In the present study, mutant UF16 was characterized based on rRNA gene sequences and investigations of mutations on these sequences were carried out.…”

Section: Morphological and Physiological Characterization Of Mutant Uf16mentioning

confidence: 99%

See 1 more Smart Citation

Morphological and Molecular Differentiation of Sporidiobolus johnsonii ATCC 20490 and Its Coenzyme Q10 Overproducing Mutant Strain UF16

et al. 2014

View full text Add to dashboard Cite

Coenzyme Q 10 (CoQ 10 ) is an industrially important molecule having nutraceutical and cosmeceutical applications. CoQ 10 is mainly produced by microbial fermentation and the process demands the use of strains with high productivity and yields of CoQ 10 . During strain improvement program consisting of sequential induced mutagenesis, rational selection and screening process, a mutant strain UF16 was generated from Sporidiobolus johnsonii ATCC 20490 with 2.3-fold improvements in CoQ 10 content. EMS and UV rays were used as mutagenic agents for generating UF16 and it was rationally selected based on atorvastatin resistance as well as survival at free radicals exposure. We investigated the genotypic and phenotypic changes in UF16 in order to differentiate it from wild type strain. Morphologically it was distinct due to reduced pigmentation of colony, reduced cell size and significant reduction in mycelial growth forms with abundance of yeast forms. At molecular level, UF16 was differentiated based on PCR fingerprinting method of RAPD as well as large and small-subunit rRNA gene sequences.Rapid molecular technique of RAPD analysis using six primers showed 34 % polymorphic fragments with mean genetic distance of 0.235. The partial sequences of rRNAgene revealed few mutation sites on nucleotide base pairs. However, the mutations detected on rRNA gene of UF16 were less than 1 % of total base pairs and its sequence showed 99 % homology with the wild type strain. These mutations in UF16 could not be linked to phenotypic or genotypic changes on CoQ 10 biosynthetic pathway that resulted in improved yield. Hence, investigating the mutations responsible for deregulation of CoQ 10 pathway is essential to understand the cause of overproduction in UF16. Phylogenetic analysis based on RAPD bands and rRNA gene sequences coupled with morphological variations, exhibited the novelty of mutant UF16 having potential for improved CoQ 10 production.

show abstract

Section: Morphological and Physiological Characterization Of Mutant Uf16mentioning

confidence: 99%

“…RAPD is proved to be a rapid molecular method for generating whole genomic DNA fingerprints which are species or even strain specific [29,51,52]. In this study, the RAPD analysis was conducted for differentiating mutant UF16 from wild type strain, taking account of its whole genome.…”

Section: Molecular Characterization Of Mutant Uf16 Based On Rapd Analmentioning

confidence: 99%

Morphological and Molecular Differentiation of Sporidiobolus johnsonii ATCC 20490 and Its Coenzyme Q10 Overproducing Mutant Strain UF16

et al. 2014

View full text Add to dashboard Cite

show abstract

“…In the era of molecular diagnosis, new techniques have been developed and used for accurate identification of fungi (26). However, the conventional methods are still employed in combination with the new advanced molecular techniques (27)…”

Section: Laboratory Diagnosis Of Candidiasismentioning

confidence: 99%

<i>Candida</i> species: the silent enemy

Al-laaeiby¹,

Ali²,

Al-Saadoon³

2019

Af J Clin Exp Micro

View full text Add to dashboard Cite

Candida species are known to cause serious infections in immunocompromised patients but uncommon cases have been reported in immunocompetent individuals regardless of the harmless coexistence of the fungi with the host. Recently, the incidence rate of candidiasis has increased dramatically alongside the emergence of antifungal resistance. Although conventional methods to ensure prompt diagnosis of candidiasis for effective therapy have been established, the scientific world is witnessing progress in the development of more accurate, timely and cost-effective methods that is coinciding with the molecular revolution and advanced DNA analysis. Moreover, the challenges of resistance of Candida to available antifungal agents are being met with the deployment of molecular techniques to investigate the mechanisms of resistance. This review is an attempt to provide up-to-date information on the persistent problems of Candida with highlights on the clinical importance, molecular diagnosis, and resistance to candidate antifungal drugs; azoles and echinocandins.

show abstract

“…İnsan sağlığına etkilerini bilenler %17-98, çevreye ve diğer canlılara olan etkilerini bilenler %17-87 olarak bildirilmiştir (26,28,(30)(31)(32)(33). Zararlı (23,25,27,29,32,(37)(38)(39). Türkiye'deki çalışmalarda bildirilen kullanım sıklıkları insektisitler için %29 ile %65 arasında, herbisitler %32, fungusitler %18 ile %29 arasında, akarisitler %12 ile %15 arasındadır (20,34,35).…”

Section: Bilgi Düzeyi Ve Genel Yaklaşımunclassified

TBHEB 2015-3 Vol 72 Full Printed Journal

DUMAN¹

2015

Turk Hij Den Biyol Derg

View full text Add to dashboard Cite

Dergide yayımlanmak üzere gönderilen yazılar, Türk Hijyen ve Deneysel Biyoloji Dergisi yazım kurallarına göre hazırlanmalıdır. Başvurular www.turkhijyen.org adresinden "Çevrimiçi Makale Gönder, Takip Et, Değerlendir Programı" aracılığıyla on line olarak yapılabilir.Gönderilen yazılarda aşağıdaki kurallara uyum aranır. Kurallara uymayan yazılar daha ileri bir incelemeye gerek görülmeksizin yazarlarına iade edilir.1. "Telif Hakkı Devir Formu" tüm yazarlarca imzalanarak onaylandıktan sonra dergimizin makale kabul sistemine yüklenmelidir. 2.Makale başlığı, İngilizce başlık, kısa başlık, yazar adları, çalışılan kurumlara ait birimler, yazışma işini üstlenen yazarın açık adresi, telefon numaraları (sabit ve cep), elektronik posta adresi belirtilmelidir: a. Yazının başlığı kısa olmalı ve küçük harfle yazılmalıdır.b. Sayfa başlarına konan kısa başlık 40 karakteri geçmemelidir.c. Çalışma bilimsel bir kuruluş ve/veya fon ile desteklenmişse dipnot veya teşekkür bölümünde mutlaka belirtilmelidir.d. Makale, kongre/sempozyumda sunulmuşsa sunum türü ile birlikte dipnot veya teşekkür bölümünde mutlaka belirtilmelidir. 3.Yazılardaki terimler mümkün olduğunca Türkçe ve Latince olmalı, dilimize yerleşmiş kelimelere yer verilmeli ve Türk Dil Kurumu'nun güncel sözlüğü kullanılmalıdır. Öz Türkçe'ye özen gösterilmeli ve Türkçe kaynak kullanımına önem verilmelidir. 4.Metin içinde geçen mikroorganizma isimleri ilk kullanıldığında tam ve açık yazılmalı, daha sonraki kullanımlarda kısaltılarak verilmelidir. Mikroorganizmaların orijinal Latince isimleri italik yazılmalıdır: Örneğin; Pseudomonas aeruginosa, P. aeruginosa gibi. Yazıda sadece cins adı geçen cümlelerde stafilokok, streptokok gibi dilimize yerleşmiş cins adları Türkçe olarak yazılabilir. Antibiyotik isimleri dil bütünlüğü açısından okunduğu gibi yazılmalı; uluslararası standartlara uygun olarak kısaltılmalıdır. Metin içerisinde bahsedilen birimlerin sembolleri Uluslararası BirimlerSistemi (SI)'ne göre verilmelidir.6. Yazılar bir zorunluluk olmadıkça "geçmiş zaman edilgen" kip ile yazılmalıdır. 7.Metnin tamamı 12 punto Times New Roman karakteri ile çift aralıkla yazılmalı ve sayfa kenarlarından 2,5 cm boşluk bırakılmalıdır.8. Yazarlar araştırma ve yayın etiğine uymalıdır. Klinik araştırmalarda, çalışmaya katılanlardan bilgilendirilmiş olur alındığının gereç ve yöntem bölümünde belirtilmesi gerekmektedir. Gönüllü ya da hastalara uygulanacak prosedürlerin özelliği tümüyle anlatıldıktan sonra, kendilerinin bilgilendirilip onaylarının alındığını gösterir bir cümle bulunmalıdır. Yazarlar Helsinki Bildirgesi'nde ana hatları çizilen ilkeleri izlemelidir. Yazarlar, bu tür bir çalışma söz konusu olduğunda, uluslararası alanda kabul edilen kılavuzlara ve yürürlükte olan tüm mevzuatta belirtilen hükümlere uymalı ve "Etik Kurul Onayı"nı göndermelidir.9. Hayvanlar üzerinde yapılan çalışmalar için de gereken izinler alınmalı; yazıda deneklere ağrı, acı ve rahatsızlık verilmemesi için neler yapıldığı açık bir şekilde belirtilmelidir. 10.Hasta kimliğini tanıtacak fotoğraf kullanıldığında, hasta...

show abstract

Recognition of Yeast Species from Gene Sequence Comparisons

Cited by 11 publications

References 80 publications

Morphological and Molecular Differentiation of Sporidiobolus johnsonii ATCC 20490 and Its Coenzyme Q10 Overproducing Mutant Strain UF16

Morphological and Molecular Differentiation of Sporidiobolus johnsonii ATCC 20490 and Its Coenzyme Q10 Overproducing Mutant Strain UF16

<i>Candida</i> species: the silent enemy

TBHEB 2015-3 Vol 72 Full Printed Journal

Contact Info

Product

Resources

About