QTL mapping for angular leaf spot in common bean using microsatellite markers

Abstract

QTL identification is the first step in the application of molecular-marker-assisted selection in breeding. Common bean molecular maps are already available and QTL and, recently, SSR markers have been identified. The objective of this study was to identify QTL for reaction to angular leaf spot using segregating families from cross Jalo EEP 558 x Small White using SSR. These families presented significant differences for the trait. High heritability estimates were obtained. Environment effects and the interaction genotypes x environments influenced the trait expression. A map with 400.1 cM was established with 24 markers arranged in eight linkage groups with a mean length of 50.01 cM, and mean distance between adjacent markers of 25.01 cM. It was possible to identify steady QTL and associate them to a high percentage of phenotypic variance for reaction to angular leaf spot. BM210 and BM146 were the most outstanding markers.

Genetic control of the angular leaf spot reaction in common bean leaves and pods

“…For all cases, the Chi-square test was not significant which indicated the occurrence of monogenic inheritance where the dominant allele is responsible for the resistance (Table 2). Jalo EEP 558 cultivar has one gene with a dominant allele for resistance that is used as a source of resistance to the angular leaf spot in south Minas Gerais state, Brazil, for more than 30 years (Teixeira et al, 2005). Resistance of Cornell 49-242 cultivar is also due to a dominant allele (Caixeta et al, 2005).…”

Seleção fenotípica e assistida por marcadores moleculares de famílias de feijoeiro-comum com alta produtividade

“…O pequeno número de marcadores polimórfi cos obtidos foi atribuído ao fato de os genitores utilizados serem linhagens melhoradas, todas com grãos do tipo "carioca", o que reduziu a variabilidade e, principalmente, ao fato de o feijoeiro-comum ser uma espécie na qual não se encontra grande polimorfi smo naturalmente, nem mesmo quando os genitores são muito contrastantes (Faleiro et al, 2003;Teixeira et al, 2005;Blair et al, 2006a;Rodrigues et al, 2007). Assim, os resultados do presente trabalho confi rmam a necessidade de utilização de maior número de marcadores de QTL, para que se aumente a chance de encontrar mais marcadores polimórfi cos, em populações geneticamente mais homogêneas.…”

“…Para as análises com marcadores moleculares microssatélites, foi realizada a extração de DNA das famílias das populações 2 e 3, que totalizaram 200 famílias, e também reações de PCR, por meio de um procedimento semelhante ao utilizado por Teixeira et al (2005), com os microssatélites identifi cados por Pereira et al (2007), como polimórfi cos para cada população (quatro marcadores para a população 3 e dois para a população 2), e ligados a QTL responsáveis pela produtividade de grãos (Rodrigues, 2004;Teixeira, 2004). Como o objetivo do trabalho foi testar a seleção com marcadores em uma situação semelhante à que ocorre em um programa de melhoramento, foram selecionadas as duas populações mais promissoras para a análise com marcadores moleculares, que foram a 2 e 3, por terem apresentado bom desempenho em produtividade, pelo número de marcadores polimórfi cos e por terem se originado de quatro genitores diferentes.…”

Translational Genomics in Agriculture: Some Examples in Grain Legumes

“…Resistance to biotic stresses Angular leaf spot QTL 22-64 Oblessuc et al, 2012;Teixeira et al, 2005 (Khedikar et al, 2010;Liang et al, 2009a;Qin et al, 2012;Sujay et al, 2012;Wang et al, 2013 (Gautami et al, 2012b;Ravi et al, 2011;Varshney et al, 2009b) Gautami et al, 2012a;Liang et al, 2009;Ravi et al, 2011;Selvaraj et al, 2009;Shirasawa et al, 2012;Varshney et al, 2009b) (Continued on next page) (Liang et al, 2009;Pandey et al, 2012c;Sarvamangala et al, 2011;Selvaraj et al, 2009;Shirasawa et al, 2012) Pea Plant height QTL 19-65 (Tullu et al, 2008;Tar'an et al, 2003b;Dirlewanger et al, 1994) (Atibalentja et al, 2005;Guo et al, 2006;Guo et al, 2008;Han et al, 2008;Huynh et al, 2010;Kazi et al, 2008;Ruben et al, 2006;Shi et al, 2008;Silva and Danielle, 2008;Vuong et al, 2008;Wang et al, 2010;Winter et al, 2007) (Continued on next page) Funatsuki et al, 2005;Githiri et al, 2006;Githiri et al, 2007;…”