“…Key words: arfak rainbowfish, Manokwari, riparian vegetation, stream PENDAHULUAN Sungai merupakan salah satu ekosistem perairan yang berperan penting dalam mendukung kehidupan manusia dan biota yang hidup di dalamnya. Sungai Nimbai yang merupakan salah satu sungai yang termasuk dalam sistem Sungai Prafi di Kabupaten Manokwari saat ini keberadaannya banyak mengalami perubahan akibat aktivitas manusia, di antaranya pembukaan lahan untuk pertanian, perkebunan kelapa sawit, dan permukiman penduduk di sekitar sungai (Manangkalangi, 2009;Manangkalangi et al, 2014). Padahal di dalam perairan sungai ini hidup berbagai macam biota, di antaranya ikan pelangi arfak yang endemik dan sembilan jenis ikan asli lainnya (misalnya, Awous grammepomus, Sicyopterus cyanocephalus, Stiphodon semoni, Belobranchus segura, Kuhlia marginata, Anguilla megastoma), serta berbagai ordo makrozoobentos (Ephemeroptera, Diptera, Hymenoptera, Trichoptera, Coleoptera, Odonata, Hemiptera, Megaloptera, dan Oligochaeta) (Manangkalangi et al, 2014).…”