O uso do livro didático no Ensino de Ciências Naturais é um recurso de grande relevância, tendo em vista a abstração de muitos conceitos e fenômenos científicos, todavia o ensino pautado na apresentação de termos técnicos e descrição de fenômenos muitas vezes desestimula os alunos em seus processos de aprendizagem. As arboviroses, infecções virais transmitidas por vírus, são problemas de saúde pública no Brasil, sendo objeto de conhecimento nas matrizes curriculares. Deste modo, este trabalho tem por objetivo analisar o ensino das arboviroses à luz do livro didático, em escolas públicas de Ensino Médio. Para essa pesquisa foi realizada a análise de dois livros didáticos aprovados no PNLD 2016-2019, utilizados nas cidades cearenses de Acopiara e Jucás. A pesquisa de abordagem qualitativas foi desenvolvida em dois grandes frentes: análise do livro didático e análise das práticas pedagógicas dos docentes. A abordagem da temática “arboviroses” foi desenvolvida a partir de três eixos principais: conteúdo teórico, recursos visuais e recursos complementares. Doze docentes, que atuam em cinco escolas públicas, como professores de Biologia do Ensino Médio, participaram da pesquisa. A análise dos livros mostrou que há divergência no modo como o conteúdo de arboviroses é abordado, embora ambos os livros careçam de ilustrações, detalhamento maior das infecções, medidas preventivas como foco na educação em saúde e na investigação científica, sendo a alfabetização científica um dos pontos de análise deste estudo. Na prática pedagógica é comum os professores buscarem complementar as carências que se encontram nos livros didáticos. Em geral, os livros, muito focados nos conteúdos, acabam por não estarem conectados à realidade dos educandos, exigindo que o docente procure em outras fontes tal associação.