Objetivo: avaliar a Qualidade de Vida (QV) dos residentes de um Programa Multiprofissional Integrado em Saúde, em um hospital universitário do Recife/PE, durante a pandemia da COVID-19. Metodologia: Trata-se de um estudo descritivo, transversal e quantitativo, realizado com 36 residentes das áreas de Nefrologia e Saúde da Mulher, do primeiro e segundo ano da especialização. A coleta de dados foi realizada entre agosto e setembro de 2020, utilizando como instrumentos um questionário estruturado de caracterização dos participantes com dados sociodemográficos, econômicos, clínicos e laborais no programa de residência multiprofissional, e o SF-36, disponibilizados online. Para análise dos dados, foram calculadas as estatísticas descritivas pela distribuição de frequência e aplicação de testes no software SPSS, versão 21, considerando a significância de 5%. Resultados: Os residentes apresentaram melhor QV nos domínios: Capacidade Funcional, Dor e Estado Geral de Saúde; e pior QV em: Emocional, Vitalidade e Saúde Mental. Dentre as categorias participantes, fisioterapeutas obtiveram melhores pontuações da QV em todos os domínios avaliados, exceto para o Emocional, no qual os psicólogos se destacaram. Ao comparar ano de especialização, nenhum resultado foi expressivo entre os domínios, já entre a área de concentração, os residentes de Nefrologia obtiveram melhores resultados na Capacidade Funcional e Vitalidade. Conclusão: Conclui-se que a COVID-19 foi um dos marcadores para que houvesse alteração do estado de saúde, bem-estar e satisfação relacionadas ao trabalho dos residentes multiprofissionais em saúde, com diminuição do índice de qualidade de vida, segundo os domínios do SF-36.