Nuclear and mitochondrial rDNA variability in Crinipellis perniciosa from different geographic origins and hosts

The distribution of a transposase sequence in Moniliophthora perniciosa confirms the occurrence of two genotypes in Bahia, Brazil

“…Arruda et al (2003b) also showed that some isolates of M. perniciosa from the Bahia state are genetically related to isolates from Belém-PA, Brazilian Amazon region. In a parallel study, Arruda et al (2003a) has shown that IGS sequences of isolates from southern Bahia are highly similar to sequences of isolates from the Amazon region. Ploetz et al (2005), through the use of AFLP markers, demonstrated the grouping of isolates derived from Bahia with isolates from the Amazon region.…”

“…At the molecular level, the intraspecific variability of M. perniciosa was demonstrated by the restriction fragment length polymorphism (RFLP) pattern and sequencing of the intergenic spacer (IGS) region from the rDNA (Arruda et al, 2003a). Characterization by Enterobacterial Repetitive Intergenic Consensus (ERIC) repetitive element sequence-based PCR from different isolates of M. perniciosa has also allowed the detection of intraspecific variability and the correlation of this variation with the host and geographic origin of isolates (Arruda et al, 2003b).…”

Avaliação da diversidade genética e associação com patogenicidade de isolados de Moniliophthora perniciosa oriundos da Amazônia Brasileira

“…Diversas análises genéticas e moleculares sugerem que os biótipos -C e -S são mais semelhantes entre si do que para o biótipo-L, com ambos exibindo um nível de diversidade menor em comparação ao biótipo-L (ARRUDA et al, 2003a;2003b;HEDGER, 1994a;GRIFFITH et al, 2003). Determinar a história da evolução e adaptação dos biótipos aos hospedeiros é fundamental para definir as áreas com a maior diversidade e o modo de desenvolvimento da infecção no hospedeiro, ajudando a elaborar uma estratégia para pesquisar a resistência na região Amazônica, supostamente considerada o centro de origem do M. perniciosa HOLLIDAY, 1957;GRIFFITH et al, 1994;.…”

“…Os mesmos isolados não apresentaram polimorfismo para sequências de ITS (Internal Transcribed Spacer) do rDNA nuclear e para o gene da subunidade ribossomal pequena do rDNA mitocondrial (mtDNA SSU rDNA) por digestão de produtos amplificados (ARRUDA et al, 2003b). A região IGS (Inter Genic Spacer) do gene rDNA apresentou polimorfismo, e permitiu a separação de isolados de acordo com hospedeiro por PCR-RFLP, e ainda parcialmente por sequenciamento e análise filogenética, a separação por hospedeiro e origem geográfica (ARRUDA et al, 2003b). O recente desenvolvimento de locos microssatélites para M. perniciosa SILVA et al, 2008) oferece o potencial de análise e classificação de isolados de acordo com origem geográfica, hospedeiro, patogenicidade e agressividade.…”

“…Os produtos das amplificações com os iniciadores ITS1-18S e ITS4 foram digeridos separadamente com as enzimas MspI e HinfI, para revelar fragmentos de restrição (ARRUDA et al, 2003b;SILVA, 2007). Para a digestão com cada enzima foi utilizado um volume de 10 µL da reação de amplificação, 2 µL do tampão da enzima e 2 unidades da enzima MspI ou HinfI (Fermentas) num volume total de 20 µL, incubados por uma hora a 37ºC.…”