Multiplex polymerase chain reaction-based serotype analysis of dengue virus during 2015 dengue outbreak in Pakistan

Abstract

Analyse des sérotypes du virus de la dengue par amplification en chaîne par polymérase multiplexe pendant la flambée de dengue de 2015 à Rawalpindi (Pakistan) RÉSUMÉ La dengue est l'une des plus importantes maladies virales transmises par des arthropodes. Elle est endémique dans plus de 125 pays dont le Pakistan, l'incidence mondiale étant comprise entre 50 et 200 millions. Nous avons déterminé la fréquence des différents sérotypes du virus de la dengue pour mettre en évidence son hyperendémicité à Rawalpindi (Pakistan). Les échantillons de sérum de 140 patients susceptibles d'avoir contracté le virus de la dengue ont été analysés entre mai et octobre 2015 à l'aide du test ELISA et de l'amplification en chaîne par polymérase multiplexe. Cent huit patients étaient infectés par le sérotype 2, 16 par le sérotype 3, sept par le sérotype 4 et trois par le sérotype 1. Trois patients étaient infectés par les sérotypes 1 et 2, un patient par les sérotypes 1 et 4 et un autre par les séroptypes 2 et 3. L'incidence de la dengue a considérablement augmenté ces 50 dernières années et elle s'est étendue à des zones qui étaient précédemment exemptes de la maladie. Le sérotype 2 était prédominant dans notre population suivi par le sérotype 3. Il n'existe actuellement aucun traitement spécifique pour la dengue. La lutte antivectorielle et la vaccination constituent les seules méthodes efficaces pour prévenir les flambées futures. ABSTRACT Dengue is one of the most important arthropod-borne viral diseases. It is endemic in > 125 countries including Pakistan, with a global incidence of 50-200 million. We determined the frequency of different serotypes of dengue virus to highlight its hyperendemicity in Rawalpindi, Pakistan. Between May and October 2015 we analysed the serum samples of 140 patients with a suspicion of dengue, using ELISA and multiplex polymerase chain reaction. One hundred and eight were infected with serotype 2, 16 with serotype 3, 7 with serotype 4 and 3 with serotype 1. Three patients were infected with serotypes 1 and 2, and 1 each with serotypes 1 and 4 and serotypes 2 and 3. Incidence of dengue has increased many fold in the past 50 years and has expanded to areas that were previously free from the disease. Serotype 2 was predominant in our population followed by serotype 3. There is currently no specific treatment for dengue, and vector control and vaccination are the only effective methods to prevent future outbreaks.

Burden and distribution of dengue infection in Pakistan (2000-19): a review

“…The prevalent serotype in 2013 was DENV-II in the country (Shahid et al, 2019). In 2015 all the four serotypes were reported from Rawalpindi and Malakand (Ghani et al, 2017;Suleman et al, 2017b). The prevalent serotypes in Faisalabad in 2011 were DENV-II, DENV-III, and DENV-IV while during 2014-17, DENV-I, DENV-II, DENV-III were reported (Ahmed et al, 2017;Raza et al, 2018).…”