Multi‐institutional validation of a novel textural analysis tool for preoperative stratification of suspected thyroid tumors on diffusion‐weighted MRI

Brown, Anna M.; Nagala, Sidhartha; McLean, Mary A.; Lu, Yutong; Scoffings, Daniel; Apte, Aditya; Gönen, Mithat; Stambuk, Hilda E.; Shaha, Ashok R.; Tuttle, R. Michael; Deasy, Joseph O.; Priest, Andrew N.; Jani, Piyush; Shukla–Dave, Amita; Griffiths, John R.

doi:10.1002/mrm.25743

Cited by 47 publications

(47 citation statements)

References 30 publications

Supporting

Mentioning

Contrasting

Unclassified

Order By: Relevance

“…In this study it was shown that co-occurrence matrices are more effective descriptors of local texture in comparison to features based on momentums, run-length matrices or local anisotropy. Similar results could be found in other trials on NMR image texture analysis [29]. It should be noted that co-occurrence matrices are sensitive to the number and volume in voxels of samples.…”

Section: Image Texturesupporting

confidence: 89%

Novel Dominant Mutation in BIN1 Gene Causing Mild Centronuclear Myopathy Revealed by Myalgias and CK Elevation

Garibaldi

Böhm

Fattori

et al. 2016

JND

View full text Add to dashboard Cite

We present the clinical, morphological and molecular data of an Italian family with centronuclear myopathy, carrying a novel pathogenic mutation of BIN1 gene in heterozygous state, consistent with autosomal dominant inheritance. The proband, a 56-years-old man suffered of lower limbs myalgia and slight CK elevation. Clinical examination revealed no muscle weakness, short stature, mild symmetric eyelid ptosis, scapular winging, ankle retraction and well-developed muscles. Muscle biopsy showed nuclear centralization and clustering, deep sarcolemmal invaginations and type 1 fibers hypotrophy. Muscle MRI revealed fatty infiltration of posterior legs compartments, lumbar paraspinal and serratus muscles. By sequencing BIN1, we identified a heterozygous pathogenic mutation [c.107C>A (p.A36E)], and we demonstrate that the mutation strongly impairs the membrane tubulation property of the protein. One affected sister with similar phenotype carried the same mutation. Our findings expand the clinical, morphological and genetic spectrum of the autosomal dominant CNM associated with BIN1 mutations.

show abstract

Section: Image Texturesupporting

confidence: 89%

Novel Dominant Mutation in BIN1 Gene Causing Mild Centronuclear Myopathy Revealed by Myalgias and CK Elevation

Garibaldi

Böhm

Fattori

et al. 2016

JND

View full text Add to dashboard Cite

show abstract

“…В этом исследовании показано, что вычисление ма-триц совместной встречаемости -более эффективное описание локальной текстуры мышц по сравнению с характеристиками, основанными на моментах, матри-цами группового кодирования или локальной анизо-тропией. Аналогичные результаты приводятся и в дру-гих исследованиях по оценке текстуры изображения [192]. Следует отметить, что матрицы совместной встре-чаемости обладают чувствительностью по отношению к количеству и размерам вокселей.…”

Section: лекции и обзорыunclassified

Skeletal muscle quantitative nuclear magnetic resonance imaging and spectroscopy as an outcome measure for clinical trials (part II)

Carlier

Marty

Scheidegger

et al. 2017

Neuromuscular Diseases

View full text Add to dashboard Cite

Активность болезниБолее 2 десятилетий назад в исследованиях на мо-делях мышей с мышечной дистрофией было показано, что ткань скелетных мышц имеет повышенный сигнал Т2 [1,2]. Аналогичные результаты получены и на мо-делях более крупных животных -собаках породы зо-лотистый ретривер с мышечной дистрофией [3][4][5]. Интересно, что сигнал Т2 от мышц нормализовывался, когда генная терапия оказывалась успешной [6][7][8].Исследования последних лет подтвердили и рас-ширили наши знания об изменении мышечного сиг-нала Т2 у животных моделей с мышечной дистрофией. Временные изменения сигнала Т2 от мышц были точно определены у mdx-мышей (животная модель прогрессирующей мышечной дистрофии (ПМД) Дю-шенна). Наибольшие изменения были выявлены в воз-расте 4-8 мес, затем наблюдалось постепенное умень-шение изменений [9][10][11]. Аномалии сигнала Т2 были описаны и на других моделях дистрофии [12,13] с разным характером внутримышечного распределе-ния жира при мутациях в гене LARGE и у mdx-мышей. Особая чувствительность дистрофичных мышц к экс-центрическим упражнениям была показана посредст-вом более высокого сигнала Т2 у mdx-мышей, которых заставляли много бегать [14].При оценке ответа mdx-мышей на экспрессию гена микродистрофина картирование Т2 продемонст-рировало более высокую дискриминационную способ-ность по сравнению с соотношением передача намаг-ниченности/диффузионно-тензорное изображение [15]. Успешный скиппинг U7-экзонов у золотистых ретриверов с мышечной дистрофией ассоциировался со сни жением сигнала Т2 от леченых конечностей [16]. Терапия лозартаном нормализовала сигнал Т2 от мышц у мышей, больных врожденной мышечной дистрофи-ей с дефицитом ламинина альфа 2 [13].Сигнал Т2 или время релаксации спин-эхо воды в мышцах может использоваться как индикатор ак-тивности болезни в скелетных мышцах. Активность болезни -достаточно расплывчатое понятие, предпо-лагающее, что изменение сигнала Т2 -результат неспе-цифических процессов, в основе которых лежат такие механизмы, как воспаление, некроз, дистрофия мышц, острая денервация, а также любые обстоятельства, при-водящие к внеклеточному или внутриклеточному отеку, или их комбинации. Этот факт неоднократно был про-демонстрирован у животных и у человека [17][18][19][20]. Физические упражнения умеренной или высокой ин-тенсивности приводят к увеличению сигнала Т2 от мышц в результате накопления воды в миоцитах. Процесс является временным и проходит в течение нескольких часов в отличие от патологического увели-чения сигнала Т2. Это может исказить результаты, если обследовать пациентов непосредственно или через ко-роткий промежуток времени после тренировки, в связи с чем мы рекомендуем выполнять визуализацию до проведения оценки моторной функции, особенно у пациентов со слабостью мышц.

show abstract

“…25,27 For example, some works have treated the GLCMs as separated in each direction, [29][30][31] whereas others have preferred to average the matrices to reduce the number of parameters used in the subsequent statistical analysis. 28,32 • Specific parameters for texture matrix formulation: the choice of the distance between pixels for the computation of GLCM is another factor that can affect the value and number of the features.…”

mentioning

confidence: 99%

“…However, in this case, it is general practice to consider a distance of 1 pixel, 9 even if some works preferred to take into account more than one distance. 31,33 • Use of already available packages: the availability of different software for the computation of textural features makes texture analysis more appealing and easy to use. However, this leads to doubting if all the considered features were correctly computed.…”

mentioning

confidence: 99%

Texture analysis of medical images for radiotherapy applications

Scalco¹,

Rizzo²

2017

The British Journal of Radiology

127

108

View full text Add to dashboard Cite

The high-throughput extraction of quantitative information from medical images, known as radiomics, has grown in interest due to the current necessity to quantitatively characterize tumour heterogeneity. In this context, texture analysis, consisting of a variety of mathematical techniques that can describe the grey-level patterns of an image, plays an important role in assessing the spatial organization of different tissues and organs. For these reasons, the potentiality of texture analysis in the context of radiotherapy has been widely investigated in several studies, especially for the prediction of the treatment response of tumour and normal tissues. Nonetheless, many different factors can affect the robustness, reproducibility and reliability of textural features, thus limiting the impact of this technique. In this review, an overview of the most recent works that have applied texture analysis in the context of radiotherapy is presented, with particular focus on the assessment of tumour and tissue response to radiations. Preliminary, the main factors that have an influence on features estimation are discussed, highlighting the need of more standardized image acquisition and reconstruction protocols and more accurate methods for region of interest identification. Despite all these limitations, texture analysis is increasingly demonstrating its ability to improve the characterization of intratumour heterogeneity and the prediction of clinical outcome, although prospective studies and clinical trials are required to draw a more complete picture of the full potential of this technique.

show abstract

Multi‐institutional validation of a novel textural analysis tool for preoperative stratification of suspected thyroid tumors on diffusion‐weighted MRI

Cited by 47 publications

References 30 publications

Novel Dominant Mutation in BIN1 Gene Causing Mild Centronuclear Myopathy Revealed by Myalgias and CK Elevation

Novel Dominant Mutation in BIN1 Gene Causing Mild Centronuclear Myopathy Revealed by Myalgias and CK Elevation

Skeletal muscle quantitative nuclear magnetic resonance imaging and spectroscopy as an outcome measure for clinical trials (part II)

Texture analysis of medical images for radiotherapy applications

Contact Info

Product

Resources

About