Com o cenário da pandemia de COVID-19, causada pelo vírus SARS-CoV-2, as instituições de ensino necessitaram adotar medidas sanitárias de distanciamento social, para manter o ensino. Com isso, a comunidade acadêmica precisou adaptar-se ao ensino remoto emergencial, necessitando fazer uso de ambientes virtuais de ensino. Diante disso, o presente estudo objetivou avaliar a influência da monitoria acadêmica no processo de ensino-aprendizagem dos alunos da disciplina Biologia Celular frente às dificuldades trazidas pelo ensino remoto. Foram obtidas 21 respostas dos discentes, cujos resultados apontaram: para 76,2% dos entrevistados, a metodologia aplicada na disciplina foi considerara “excelente”, e para 19%, “boa”, restando o entendimento de que a forma de condução do ensino foi satisfatória aos alunos. Sobre as atividades da monitoria acadêmica, 100% dos estudantes consultados avaliaram positivamente e relataram que os monitores foram excelentes, sobretudo, por sanarem dúvidas, revisarem conteúdos e estarem disponíveis quando solicitados. Em relação aos perfis dos monitores, 100% dos acadêmicos destacaram aspectos positivos, a citar: eficientes, prestativos, proativos, boa didática e importantes para o processo de aprendizagem. Sobre as dificuldades enfrentadas no ensino remoto, 33,3% dos estudantes apontaram a falta de acesso à internet de qualidade e 19,05% indicaram a dificuldade de concentração nas aulas. A monitoria acadêmica, em Biologia Celular, é uma importante ferramenta educacional, por auxiliar nos processos de ensino-aprendizagem, no desempenho acadêmico e na adaptação dos alunos aos ambientes virtuais de ensino, além de contribuir para a formação profissional e pessoal do monitor e na relação professor/monitor/monitorados.