Molecular characterization of the plum collection [Prunus domestica (L.) Borkh] of the Pedagogical and Technological University of Colombia

Abstract

Eight Random Amplified Microsatellite markers (RAMs) were used to characterize the genetic diversity found in 14 Prunus materials belonging to the deciduous collection of the Pedagogical and Technological University of Colombia. A total of 121 bands were generated: they range from nine for the GT primer to 26 for the ACA primer, and have molecular weights between 100 and 2050 Kb. At a Nei-Li similarity level of 0.75, four groups were formed, according to the characteristics of the fruit. The number of polymorphic loci varied between 8 (GT and AG) and 21 (ACA); the higher levels of heterozygosity were CA (0.43) and CT (0.41). The average value of heterozigosity for the total population was 0.35, much lower than those found in other Prunus species, but higher than other fruit species where RAM markers were used. Therefore, strategies must be deployed for the collections in order to increase genetic variability, such as the introduction of wild or hybrid materials. The RAM technique proved useful as a method for assessing genetic diversity in species of the Prunus genus.

Caracterización molecular de cubios (Tropaeolum tuberosum Ruíz y Pavón) en el departamento de Boyacá

“…Los valores de heterocigosidad estimada estuvieron comprendidos entre 0,25 para el cebador CGA y 0,442 para el AG (Tabla 3). El valor promedio para la población fue de 0,35, con una desviación estándar de 0,01, el cual fue bajo si se compara con los resultados obtenidos por Morillo et al (2015) quien caracterizó molecularmente diez cultivares de ibias (Oxalis tuberosa Mol.) con marcadores RAMs, encontrando un valor de heterocigosidad de 0,39.…”

“…(Microsatélites Amplificados al Azar) son muy útiles para medir la diversidad genética en plantas, animales y microorganismos, además permiten detectar la variación a nivel intra e inter específico, no necesita información previa y es una metodología útil para la determinación de parámetros genéticos (Morillo et al, 2015). Teniendo en cuenta que los tubérculos andinos, y especialmente los cubios, son especies amenazadas por erosión genética, y que la colección, caracterización u evaluación de germoplasma en el Altiplano Cundiboyacense es escasa, el presente trabajo de investigación tuvo como objetivo principal, la caracterización molecular de los morfotipos de cubios en el departamento de Boyacá, usando marcadores microsátelites RAMs, con el propósito de identificar la diversidad genética.…”