Molecular characterization of human Torque Teno virus

Abstract

The present study analyzed the presence of human Torque Teno virus (TTV) in hospitalized patients from different departments. In total, 378 serum specimens were collected from the patients (171 with cardiovascular disease, 192 with tumor and 15 with gastroenteritis) and analyzed by ELISA and nest-polymerase chain reaction (PCR) to detect the presence of TTV. The results showed that 64 specimens (17%) were TTV positive from detection with the human ELISA kit, and the patients aged <30 years have a higher prevalence. TTV in males was more common than in female patients. In addition, nest-PCR was used to detect TTV within different phylogenetic groups among the 64 specimens, and the results showed that groups 1 (TA278 strain), 4 (KC009) and 5 (CT39) were much more prevalent than groups 2 (PMV isolate) and 3 (11 genotypes) in the different departmental patients.

Current Views of Torque Teno Virus (TTV) in Liver Diseases

“…ТТ-вирусные частицы имеют сферическую форму, лишены наружной оболочки, имеют размер от 30 до 50 нм [9]. Геном torque teno virus представлен безоболочечной одноцепочечной кольцевидной ДНК с отрицательной полярностью [3,10,11], протяженностью 3,8 kb и содержит 3739 спаренных оснований [5,8,12]. Плавучая плотность TTV в градиенте хлорида цезия составляет 1,31-1,34 г/см 3 [10].…”

“…Геном TTV обладает широким разнообразием нуклеотидной последовательности [3,5] и состоит из нетранслируемого региона (UTR), имеющего длину 1,2 kb, и потенциально кодирующего региона (длина 2,6 kb). Анализ кодирующего региона ДНК выявил наличие по меньшей мере четырех частично перекрывающихся открытых рамок считывания (ORF1-4) [5], а также гипервариабельный регион (HVR) и N-концевой аргининовый фрагмент [7,10,11,13].…”

“…При несовпадениях нуклеотидных последовательностей более чем на 30 % изолят рассматривается как генотип, а в интервале от 11 до 15 %как его субтип [14]. Основываясь на различии в строении, выделяют 5 генотипов вируса (G1-G5) и более 30 субтипов TTV [2,3,11,15,16]. Генотип 1-го вируса TT был обнаружен как у здоровых носителей, так и у пациентов с повышенным уровнем печеночных ферментов и гепатитом неизвестной этиологии [2,8].…”

“…Репликация TTV и активация клеточного звена иммунитета, являющегося основой противовирусной защиты, считаются пусковыми механизмами для продукции иммуноглобулинов [38][39][40]. Для качественного и количественного определения антител к вирусу TT (анти-TTV) в биологических пробах используют метод иммунопреципитации и иммуноблоттинга [3,4,38,40,41].…”

“…В 2009 году Международным комитетом по таксономии вирусов (International Committee on Taxonomy of Viruses) вирусу было присвоено название, отражающее наиболее частый путь передачи (Transfusion Transmitted) и объясняющее главные черты генетической организации вируса (torque teno virus -от латинского torque -«ожерелье», teno -«тонкий») [3][4][5]. TTV относится к роду Circoviridae, семейство Anelloviridae [2][3][4][5][6]. После выявления оригинального вируса TT, обладающего значительной вариабельностью генома, были открыты другие TTV-подобные вирусы: например torque teno mini virus (TTMV) и torque teno midi virus (TTMDV) (таблица 1) [2,7,8].…”