Modeling a spatially restricted distribution in the Neotropics: How the size of calibration area affects the performance of five presence-only methods

Giovanelli, João Gabriel Ribeiro; Siqueira, Marinez Ferreira de; Haddad, Célio F. B.; Alexandrino, João

doi:10.1016/j.ecolmodel.2009.10.009

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“…Dentre as vantagens, destaca-se o fato de necessitar apenas de dados de presença para modelar toda a área de estudo, juntamente com as informações ambientais (PHILIPS et al, 2006). O Maxent é amplamente utilizado em trabalhos de modelagem de nicho ecológico (MDE), tendo mostrado melhor resultado de predição em estudos que comparam diferentes MDE (ELITH & GRAHAM, 2009;GIOVANELLI et al, 2010;TARKESH & JETSCHKE, 2012) além de resultados satisfatórios com poucos pontos de presença (WILLIAMS et al, 2009).…”

Section: Seleção Das Variáveis Construção Do Modelo E Validação Do Munclassified

MODELO PREDITIVO DO POTENCIAL DE DISTRIBUIÇÃO GEOGRÁFICA DA ESPÉCIE Richeria grandis VAHL. NO ESTADO DE MINAS GERAIS E SUA RELAÇÃO COM AS FLUTUAÇÕES CLIMÁTICAS DO QUATERNÁRIO

Moura¹,

Costa²,

Oliveira³

et al. 2017

Enci Bio

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RESUMOO objetivo deste trabalho foi avaliar o efeito das flutuações climáticas do Quaternário sobre a distribuição preditiva da espécie Richeria grandis VAHL. no estado de Minas Gerais. Foram utilizados dados de ocorrência da espécie e 10 variáveis climáticas referentes a três cenários passados (Holoceno, Último Glacial Máximo e Interglacial) e período atual para a análise da modelagem. O algoritmo Maxent foi selecionado para relacionar a ocorrência da espécie com variáveis bioclimáticas que refletem diferentes condições de temperatura, precipitação e sazonalidade. Os modelos foram validados por meio do índice Area Under Curve (AUC) e a inflluência das variáveis sobre a distribuição foi avaliada por meio do teste Jackknife. Os modelos apresentaram bom desempenho, visto que os índices AUC variaram entre 0,81 a 0,87. Os modelos do Quaternário evidenciaram um aumento gradativo da adequabilidade para a Richeria grandis nos cenários do Interglacial (120 -140 mil anos atrás), Último Glacial Máximo (22 mil anos atrás) e Holoceno (6000 anos atrás), respectivamente. Já para o cenário atual (1960 -1990), houve uma baixa de adequabilidade, quando comparado ao período Holoceno. As variáveis bioclimáticas que melhor contribuíram para a modelagem foram: Precipitação do mês mais chuvoso, a qual parece ter a maior informação útil agregada, seguida da variável Precipitação do mês mais seco, Isotermalidade e por último a Sazonalidade de temperatura. Esta ferramenta mostrou-se bastante útil em fornecer contribuições para o estudo de questões ecológicas sobre a distribuição da espécie, além de ser uma importante ferramenta para planos de conservação da biodiversidade. PALAVRAS-CHAVE: mata de galeria, maxent, modelagem.

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Section: Seleção Das Variáveis Construção Do Modelo E Validação Do Munclassified

MODELO PREDITIVO DO POTENCIAL DE DISTRIBUIÇÃO GEOGRÁFICA DA ESPÉCIE Richeria grandis VAHL. NO ESTADO DE MINAS GERAIS E SUA RELAÇÃO COM AS FLUTUAÇÕES CLIMÁTICAS DO QUATERNÁRIO

Moura¹,

Costa²,

Oliveira³

et al. 2017

Enci Bio

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“…A família mais rica foi Myrtaceae, com 30 espécies (20% da riqueza total); destas, oito espécies foram amostradas somente nesta cota altitudinal, e talvez possam ser utilizadas como indicadoras de distribuição restrita em estudos de modelagem de nicho (Giovanelli et al 2010). A segunda família com maior riqueza foi Fabaceae, com 18 espécies (12% da riqueza), seguida por Rubiaceae, com 15 espécies (10%), Lauraceae e Sapotaceae, com oito espécies cada (5% da riqueza total, cada).…”

Section: Características Físicas E Florísticaunclassified

Florística e fitossociologia em parcelas permanentes da Mata Atlântica do sudeste do Brasil ao longo de um gradiente altitudinal

et al. 2012

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Este trabalho resume os dados de florística e fitossociologia de 11, das 14 parcelas de 1 ha, alocadas ao longo do gradiente altitudinal da Serra do Mar, São Paulo, Brasil. As parcelas começam na cota 10 m (Floresta de Restinga da Praia da Fazenda, município de Ubatuba) e estão distribuídas até a cota 1100 m (Floresta Ombrófila Densa Montana da Trilha do rio Itamambuca, município de São Luis do Paraitinga) abrangendo os Núcleos Picinguaba e Santa Virgínia do Parque Estadual da Serra do Mar. Na Restinga o solo é Neossolo Quartzarênico francamente arenoso, enquanto que na encosta o solo é um Cambisolo Háplico Distrófico argilo-arenoso, sendo que todas as parcelas apresentaram solo ácido (pH 3 - 4) com alta diluição de nutrientes e alta saturação de alumínio. Na Restinga e no sopé da encosta o clima é Tropical/Subtropical Úmido (Af/Cfa), sem estação seca, com precipitação média anual superior a 2.200 mm e temperatura média anual de 22 ºC. Subindo a encosta mantêm-se a média de precipitação, mas há um gradativo resfriamento, de forma que a 1.100 m o clima é Subtropical Úmido (Cfa/Cfb), sem estação seca, com temperatura média anual de 17 ºC. Destaca-se ainda que, quase diariamente, a parte superior da encosta, geralmente acima de 400 m, é coberta por uma densa neblina. Nas 14 parcelas foram marcados, medidos e amostrados 21.733 indivíduos com DAP > 4,8 cm, incluindo árvores, palmeiras e fetos arborescentes. O número médio de indivíduos amostrados nas 14 parcelas foi de 1.264 ind.ha-1 (± 218 EP de 95%). Dentro dos parâmetros considerados predominaram as árvores (71% FOD Montana a 90% na Restinga), seguidas de palmeiras (10% na Restinga a 25% na FOD Montana) e fetos arborescentes (0% na Restinga a 4% na FOD Montana). Neste aspecto destaca-se a FOD Terras Baixas Exploradas com apenas 1,8% de palmeiras e surpreendentes 10% de fetos arborescentes. O dossel é irregular, com altura variando de 7 a 9 m, raramente as árvores emergentes chegam a 18 m, e a irregularidade do dossel permite a entrada de luz suficiente para o desenvolvimento de centenas de espécies epífitas. Com exceção da FOD Montana, onde o número de mortos foi superior a 5% dos indivíduos amostrados, nas demais fitofisionomias este valor ficou abaixo de 2,5%. Nas 11 parcelas onde foi realizado o estudo florístico foram encontradas 562 espécies distribuídas em 195 gêneros e 68 famílias. Apenas sete espécies - Euterpe edulis Mart. (Arecaceae), Calyptranthes lucida Mart. ex DC. e Marlierea tomentosa Cambess (ambas Myrtaceae), Guapira opposita (Vell.) Reitz (Nyctaginaceae), Cupania oblongifolia Mart. (Sapindaceae) e as Urticaceae Cecropia glaziovii Snethl. e Coussapoa microcarpa (Schott) Rizzini - ocorreram da Floresta de Restinga à FOD Montana, enquanto outras 12 espécies só não ocorreram na Floresta de Restinga. As famílias com o maior número de espécies são Myrtaceae (133 spp), Fabaceae (47 spp), Rubiaceae (49) e Lauraceae (49) ao longo de todo gradiente da FOD e Monimiaceae (21) especificamente nas parcelas da FOD Montana. Em termos de número de indivíduos as famílias mais importantes foram Arecaceae, Rubiaceae, Myrtaceae, Sapotaceae, Lauraceae e na FOD Montana, Monimiaceae. Somente na parcela F, onde ocorreu exploração de madeira entre 1960 e 1985, a abundância de palmeiras foi substituída pelas Cyatheaceae. O gradiente estudado apresenta um pico da diversidade e riqueza nas altitudes intermediárias (300 a 400 m) ao longo da encosta (índice de Shannon-Weiner - H' - variando de 3,96 a 4,48 nats.indivíduo -1). Diversas explicações para este resultado são apresentadas neste trabalho, incluindo o fato dessas altitudes estarem nos limites das expansões e retrações das diferentes fitofisionomias da FOD Atlântica durante as flutuações climáticas do Pleistoceno. Os dados aqui apresentados demonstram a extraordinária riqueza de espécies arbóreas da Floresta Ombrófila Densa Atlântica dos Núcleos Picinguaba e Santa Virgínia do Parque Estadual da Serra do Mar, reforçando a importância de sua conservação ao longo de todo o gradiente altitudinal. A diversidade desta floresta justifica também o investimento de longo prazo, através de parcelas permanentes, para compreender sua dinâmica e funcionamento, bem como monitorar o impacto das mudanças climáticas nessa vegetação.

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“…Predictive ecological niche models for the last glacial maximum, present and future Giovanelli et al 2010), since these can lead to overfitting of the model. After removing those variables that exhibited a strong correlation, five of them for C. calyculata and L. b ssp.…”

Section: Methodsmentioning

confidence: 99%

From past to future: impact of climate change on range shifts and genetic diversity patterns of circumboreal plants

Wróblewska

Mirski

2017

Reg Environ Change

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Climate change is projected to influence the genetic resources of plant species. Recent research has examined genetic diversity patterns under current climate conditions, with little attention to the future genetic consequences for species. In this study, we combined ecological niche modeling and population genetic approaches to project future changes in genetic diversity using plastid and nuclear DNA and reconstructed distribution patterns of three circumboreal plants (Chamaedaphne calyculata, Linnaea borealis ssp. borealis, and Pedicularis sceptrum-carolinum ssp. sceptrumcarolinum) in the last glacial maximum. We found that circumboreal plants could potentially lose their geographic ranges in the future (2070; 35-52% in RCP 4.5 (representative concentration pathways), 37-53% in RCP 6.0, and 56-69% in RCP 8.5), only slightly compensated by a predicted range gain of 18-33% (across the three RCPs). It is expected that future genetic diversity level could remain similar or lower than the present level. On the other hand, the homogeneity of the genetic background-a lack of admixture and domination of one gene pool in most populations of C. calyculata and L. borealis ssp. borealis-was predicted to become more pronounced in the future. Combining the paleoecological niche modeling and genetic data revealed, more precisely, the climate refugia for circumboreal plants in the Alps, central Asia, Beringia, and southern North America and the macrorefugia more restricted to the northern part of Eurasia and North America, reaching the arctic zone.

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Modeling a spatially restricted distribution in the Neotropics: How the size of calibration area affects the performance of five presence-only methods

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MODELO PREDITIVO DO POTENCIAL DE DISTRIBUIÇÃO GEOGRÁFICA DA ESPÉCIE Richeria grandis VAHL. NO ESTADO DE MINAS GERAIS E SUA RELAÇÃO COM AS FLUTUAÇÕES CLIMÁTICAS DO QUATERNÁRIO

MODELO PREDITIVO DO POTENCIAL DE DISTRIBUIÇÃO GEOGRÁFICA DA ESPÉCIE Richeria grandis VAHL. NO ESTADO DE MINAS GERAIS E SUA RELAÇÃO COM AS FLUTUAÇÕES CLIMÁTICAS DO QUATERNÁRIO

Florística e fitossociologia em parcelas permanentes da Mata Atlântica do sudeste do Brasil ao longo de um gradiente altitudinal

From past to future: impact of climate change on range shifts and genetic diversity patterns of circumboreal plants

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