RESUMELa pyriculariose du riz est la principale maladie fongique la plus destructive de cette culture au Burkina Faso et au Togo. Afin d'élaborer une méthode de gestion durable de cette maladie, la connaissance de la diversité de l'agent pathogène s'avère nécessaire. L'objectif est d'acquérir des données sur la structure génétique des isolats de M. oryzae collecté entre 2013 et 2015 au Burkina Faso et au Togo. Treize (13) marqueurs microsatellites ont été utilisés pour caractériser 220 isolats selon la méthode décrite par Adreit et al. (2007). Les résultats révèlent un niveau de polymorphisme très élevé entre les isolats. Les valeurs moyennes de la diversité (He) et des allèles par marqueur sont respectivement 0.55 et 9.36. Sur la base de la taille des séquences génotypes, 86 génotypes multilocus (MLGs) ont été identifiés. Ces résultats sont la conséquence probable de la diversité variétale du riz et de l'action environnementale sur l'expression des gènes chez le pathogène. Des MLGs sont partagés entre les deux pays et les pays voisins. Ce qui est probablement la conséquence directe des échanges de matériel végétal infecté entre ces pays. Ainsi, ces données couplées à la pathogénie de chaque génotype multilocus permettront l'amélioration des résistances de riz à la pyriculariose et les diverses relations identifiées nous inspirent des réflexions sur les stratégies de lutte contre M. oryzae excluant toute spécificité d'action dans la gestion de l'agent pathogène à l'intérieur d'un même pays. © 2016 International Formulae Group. All rights reserved.
Mots clés : Caractérisation, Magnaporthe oryzae, diversité, microsatellites (SSRs).
Analysis of the genetic diversity of Magnaporthe oryzae isolates from Burkina Faso and Togo by microsatellite markers (SSRs) ABSTRACTThe blast is the most serious fungal disease, harmful to the cultivation of rice in Burkina Faso and Togo. In order to elaborate a methods of lasting management of disease, the knowledge a diversity of pathogen will be necessary. This study aims to collect data on the genetic structure within the isolates of M. oryzae collected between 2013 and 2015 in Burkina Faso and Togo. Thirteen (13) microsatellite markers were used to A. I. KASSANKOGNO et al. / Int. J. Biol. Chem. Sci. 10(5): 2259-2267, 2016 2260 characterize 220 isolates. The results showed a very high level of polymorphism between the isolates. The average values of gene diversity and allele frequency were 0.55 and 9.36, respectively. Based on the size of the sequences genotypes, 86 genotypes multilocus (MLGs) were identified. These results are the probable consequence of the varietal diversity of rice and the environmental action on the gene expression. The common MLGs were identified between the two countries and the neighbour countries. What is probably the direct consequence of the exchanges of plant material infected by M. oryzae between these countries? Thus, these data coupled to pathogenesity of each genotype multilocus will improve rice resistance to blast and the various relationships we ...