Microsatellite markers based genetic diversity and bottleneck studies in Zanskari pony

Gupta, Ashok Kumar; Chauhan, Mamta; Bhardwaj, Arun; Tandon, S. N.

doi:10.1016/j.gene.2012.03.008

Cited by 8 publications

(10 citation statements)

References 17 publications

(16 reference statements)

Supporting

Mentioning

Contrasting

Unclassified

Order By: Relevance

“…Tail commonly touches the ground. The common body colour is grey followed by bay and black (Gupta, Pal and Tandon, 2010).…”

Section: Zanskari Ponymentioning

confidence: 99%

“…During the last five decades, overall population of the horses and animals true to breed in particular have decreased at an alarming rate due to indiscriminate breeding, poor availability of good quality stallions, their decreased demand and utility as well as poor health and management. Some of the equine breeds namely Zanskari, Manipuri, Bhutia and Spiti breeds are now endangered, as their populations are very limited (Gupta, Pal and Tandon, 2010; http://ahdhp.nic.in/chamurthi.pdf, Animal Husbandry Department, Arunachal Pradesh, http://www.e-pao.net/GP.asp?src=23..221011. oct11). Kathiawari breed also has been considered as an endangered breed as its population is <10 000 (Kachhiapatel, 2010).…”

Section: Introductionmentioning

confidence: 99%

See 1 more Smart Citation

Morphological diversities and ecozones of Ethiopian horse populations

Kefena

Dessie²,

Han

et al. 2012

Anim. Genet. Resour.

View full text Add to dashboard Cite

Las opiniones expresadas en esta publicación son las de su(s) autor(es), y no reflejan necesariamente los puntos de vista de la FAO. All rights reserved. FAO encourages reproduction and dissemination of material in this information product. Non-commercial uses will be authorized free of charge, upon request. Reproduction for resale or other commercial purposes, including educational purposes, may incur fees.

show abstract

“…Tail commonly touches the ground. The common body colour is grey followed by bay and black (Gupta, Pal and Tandon, 2010).…”

Section: Zanskari Ponymentioning

confidence: 99%

Section: Introductionmentioning

confidence: 99%

Morphological diversities and ecozones of Ethiopian horse populations

Kefena

Dessie²,

Han

et al. 2012

Anim. Genet. Resour.

View full text Add to dashboard Cite

show abstract

“…Zanskari, are among the registered breeds of horses found in Leh and Laddakh region of Jammu and Kashmir, India (Behl et al, 2006). Since, their height at wither is between 125 and 127 cm, hence this breed was clubbed under the category of pony breeds (Gupta et al, 2010). Zanskari horse is a symbol of wealth and used as a source of entertainment as well as transport along the upper Indus River.…”

Section: Horse Genetic Resourcesmentioning

confidence: 99%

An Overview of Diversified Animal Genetic Resources in the Indian State of Jammu and Kashmir

Kour¹,

Singh²,

Kumar³

et al. 2018

Int.J.Curr.Microbiol.App.Sci

View full text Add to dashboard Cite

“…Ortalama allel sayısı Arap ve İngiliz atlarında yaklaşık 5 iken Rahvan atlarında 10.65 olarak bulunmuştur. Bu çalışmada rahvan atlarından elde edilen ortalama allel sayısı, yerli Mısır atlarından (23), Zanskari ponilerinden (16), Hindistan at ırklarından (17) (29), iki populasyon arasındaki F ST değerini 0.05'in altında olması durumunda bunun düşük bir değer olduğunu ve populasyonların birbirinden ayrışmadığı şeklinde değerlendirildiğini ve farklılıkların çoğunlukla bireysel varyasyondan kaynaklandığını bildirmektedirler. Dolayısıyla bölgeler arasındaki F ST değerlerinin çok küçük olması, mevcut populasyonların birbirinden ayrışmadığını göstermektedir.…”

Section: Tartışma Ve Sonuçunclassified

“…Yerli at ırkında etkili allel sayısı 5.70, Arap atında 3.82, İngiliz atında ise 4.85 olarak hesaplanmıştır. Zanskari ponilerinde mikrosatelit markerler kullanılarak genetik çeşitliliğin incelendiği bir araştırmada (16), ortalama allel sayısı 8.52, gözlenen heterozigotluk (H o ) 0.68, F IS değeri 0.115 olarak belirlenmiştir. İtalyan Lipizzan atlarının populasyon yapısı ve kan yakınlığı üzerine yapılan bir çalışmada (5), F IS , F IT , F ST , H o , H e , allel frekansı ve lokus başına etkili allel sayısı sırasıyla, -0.133, -0.067, 0.058, 0.660, 0.628, 0.485 ve 2.921 olarak hesaplanmıştır.…”

Section: Introductionunclassified

Türkiye’de rahvan koşan atlar arasındaki genetik çeşitlilik

ERDOĞAN¹

2016

Ankara Üniversitesi Veteriner Fakültesi Dergisi

View full text Add to dashboard Cite

Özet: Bu araştırma, Türkiye'de 7 farklı coğrafi bölgede yetiştirilen ve Rahvan koşularına katılan atların 17 mikrosatelit lokus bakımından genetik yapılarının belirlenmesi amacıyla yapılmıştır. Bunun için 4 yaş ve üzeri 353 rahvan atın kan/kıl örnekleri kullanılmıştır. Ayrıca, Rahvan koşularına katılan atlar ile Gıda, Tarım ve Hayvancılık Bakanlığı, Yüksek Komiserler Kurulu'na kayıtlı bulunan Arap (n=53) ve İngiliz (n=51) atları arasındaki genetik benzerlik veya farklılıklar da ortaya konulmuştur. Genetik analizler sonucunda, ortalama F IS, F IT ve F ST değerleri sırasıyla 0.0982, 0.0999 ve 0.0019; bölgelere göre (İç Anadolu, Karadeniz, Ege, Marmara, Doğu Anadolu, Güneydoğu Anadolu ve Akdeniz Bölgesi) gözlenen heterozigotluk indeksi (H o) sırasıyla, 0.718, 0.688, 0.711, 0.719, 0.722, 0.700 ve 0.708 olarak belirlenmiştir. Rahvan, Arap ve İngiliz atı populasyonlarındaki ortalama allel sayıları sırasıyla, 10.65, 5.18 ve 5.00 olarak hesaplanmıştır. Populasyonlar arasındaki farklılıkları ortaya çıkarmak amacıyla yapılan Faktöriyel Benzerlik Analizi'nde Rahvan, Arap ve İngiliz atlarının ayrı kümeler oluşturduğu görülmüştür. Aynı sonuçlar yapı (structure) analizinde de ortaya çıkmıştır. Sonuç olarak, Rahvan atlarının bölgelere göre önemli farklılıklar göstermediği ancak, Arap ve İngiliz atlarından ise oldukça farklı oldukları ortaya konmuştur. Anahtar sözcükler: At, genetik çeşitlilik, mikrosatelit, rahvan, Türkiye. Genetic diversity between rahvan (pacing) horses in Turkey Summary: This study was conducted to determine the genetic structures of Rahvan (pacing) horses from 7 different geographical region in Turkey. For this purpose, 17 microsatellite loci were used. Blood or hair root samples were collected from 353 Rahvan horses aging 4 years or older. Also, genetic similarities or differences were investigated between Rahvan, Arabian (n=53) and Thoroughbred (n=51) horses. As a result of genetic analysis, F IS , F IT and F ST values of Rahvan horses were calculated as 0.0982, 0.0999 and 0.0019, respectively. According to region (The Central Anatolia, Black Sea, Aegean, Marmara, Eastern Anatolia, Southeastern Anatolia and Mediterranean Region), observed heterozigosities (H o) were estimated as 0.718, 0.688, 0.711, 0.719, 0.722, 0.700 and 0.708, respectively. Numbers of alleles of Rahvan, Arabian and Thoroughbred horses were 10.65, 5.18, and 5.00, respectively. Factorial Correspondences Analysis was performed to reveal differences among populations. Rahvan, Arabian and Thoroughbred horses were all clustered as separate groups. Also, structure analysis were given the same results. The results showed that Rahvan horses were similar in all regions in terms of microsatellite loci, but quite different from Arabian and Thoroughbred horses.

show abstract

Microsatellite markers based genetic diversity and bottleneck studies in Zanskari pony

Cited by 8 publications

References 17 publications

Morphological diversities and ecozones of Ethiopian horse populations

Morphological diversities and ecozones of Ethiopian horse populations

An Overview of Diversified Animal Genetic Resources in the Indian State of Jammu and Kashmir

Türkiye’de rahvan koşan atlar arasındaki genetik çeşitlilik

Contact Info

Product

Resources

About