Entendendo a importância do planejamento das despesas indiretas nos empreendimentos da construção civil, esse estudo buscou comparar duas metodologias, uma que distribui o total de custos indiretos de forma igual para todos os meses, e outra, que distribui de acordo com o planejamento do empreendimento. Essa última analisa a distribuição dos custos indiretos conforme o cronograma físico, o histograma de mão de obra, as etapas do empreendimento, as parcelas de contratos constantes e os contratos de consultorias. Como aplicação, foi realizado um estudo de caso de um empreendimento de 32 andares, localizado em Fortaleza-CE. Os resultados indicaram que os custos indiretos distribuídos conforme os critérios abordados, retratam melhor a realidade, onde na primeira metade dos meses foi distribuído 33,13% das despesas indiretas totais em contrapartida com 50% na metodologia uniforme, mostrando que esses custos crescem e se concentram mais na segunda metade do empreendimento, representando aproximadamente 2/3 dos custos indiretos totais, para o caso analisado. Comparando as duas metodologias observou-se que a falta de uma análise dos custos indiretos pode comprometer a programação de desembolso financeiro da empresa. Por fim, concluiu-se que a utilização da metodologia uniforme, ocasiona uma falsa interpretação de economia e prejudica na tomada de decisões.