Las organizaciones conocen la importancia de controlar correctamente sus inventarios mediante un adecuado monitoreo organizacional, elemento clave para alcanzar objetivos y aumentar la competitividad de forma eficiente y eficaz. La presente investigación tiene como objetivo determinar el método y software de control como herramientas que aplican las microempresas en el manejo de inventarios, para ello se planteó un estudio de enfoque cuantitativo con alcance descriptivo, no experimental; teniendo como objeto de estudio la población de la ciudad de Machala, donde, se tomó como muestra por conveniencia a 107 microempresas. En el procesamiento de los datos se utilizó la herramienta IBM SPSS STATISTICS 23, obteniendo como resultados deficiencia en la aplicación de herramientas tecnológicas como métodos y software de control; prevaleciendo el uso hojas de control o kardex y el registro de los datos en la aplicación de excel, continuando con la realización de pedidos de forma empírica, es decir de acuerdo al criterio o experiencia del administrador o gerente; esto se debe a que gran parte de estas organizaciones no cuentan con personal adecuado para la coordinación y gestión del mismo. Se concluye que el control de inventarios presenta debilidades que deben ser corregidas para que la organización tenga competitividad en el mercado mediante la automatización de los procesos en el sistema de inventarios.