Keragaman Genetik Inbrida Jagung QPM dan Normal Berbasis Marka Mikrosatelit dan Hubungannya dengan Penampilan Hibrida

Abstract

Genetic Diversity of QPM and Normal Maize Inbreds asRevealed by SSR Markers and Its Relationship with the Hybrid Performance. Marcia B. Pabendon, M. Azrai, M.J. Mejaya, and Sutrisno. Information on genetic divergence of inbred lines and performance of the hybrids developed from the lines is a great value in maize hybrid program. A study was conducted to evaluate genetic diversity of six QPM and five normal maize inbred lines, to determine the relationship between genetic distance based on SSR markers and the grain yield of single cross hybrid, and to get information promising hybrid from the single cross of QPM hybrid. Twenty four polymorphic primers that covered the 10 maize chromosomes were used to fingerprint the lines, detecting in 94 alleles (average of 3.9 and a range of 2-6 alleles per locus). Genetic divergences were determined using the Jaccard's similarity coefficient, and a dendrogram was constructed using the UPGMA. Cluster analysis divided the inbreds into two clusters that were confirmed by principal coordinate analysis. Two promising QPM hybrids that are crossed from different heterotic group were found. The estimated value of simple correlations (r) of GDs with the gain yield of single cross hybrid was negatif (-0.07). There is a need to conduct more field trials to obtain more accurate correlations, particularly in a practical utility for predicting maize hybrid performance for grain yield.Key words: Maize, QPM and normal inbreds, SSR, genetic distance, hybrid performance. PENDAHULUANMalnutrisi di berbagai daerah di Indonesia akhirakhir ini semakin meningkat, yang dipicu oleh rendahnya daya beli masyarakat. Salah satu sumber bahan pangan di Indonesia, khususnya di Indonesia Bagian Timur adalah jagung. Kandungan protein jagung normal berkisar 8-11% (Vasal 2000), namun masih kekurangan dua asam amino esensial, yaitu lisin dan triptofan dengan kandungan masing-masing hanya 0,225% dan 0,05% (Cordova 2001). Jika jagung digunakan sebagai sumber pangan, maka orang yang mengonsumsi jagung tersebut juga akan kekurangan asam amino lisin dan triptofan. Quality Protein Maize (QPM)Hak Cipta © 2008, BB-Biogen memiliki potensi yang sangat baik untuk nutrisi manusia, khususnya bagi bayi yang mengalami kekurangan gizi dan sebagai sumber protein bagi anakanak prasekolah. Selain manusia, kedua asam amino tersebut juga sangat dibutuhkan oleh ternak, terutama ternak "monogastric", seperti unggas, yang tidak dapat menghasilkan lisin dan triptofan sendiri, sehingga harus dipasok dari makanannya sebagai sumber protein hewani (Srivastava et al. 2005).Penelitian dan promosi QPM pernah mengalami kemunduran pada masa lalu, karena rendahnya kualitas sumber plasma nutfah dan kurangnya galur-galur elit QPM yang toleran cekaman. Namun sekarang, untuk memecahkan masalah kerapuhan genetik QPM dan untuk mempercepat pembentukan hibrida QPM, sejumlah besar plasma nutfah tropika dan subtropika telah tersedia di CIMMYT dan dapat diintroduksi. Hal lain yang penting adalah mengklasifikasikan inbridainbrida QPM ke dalam kelompo...

Genetic Variability of Local Corn Cultivars from Kisar Island Southwest Maluku Regency using Microsatellite Molecular Marker

“…The use of microsatellite markers to analyze the genetic diversity of corn have been also reported (Smith et al, 1997;Senior et al, 1998;Gethie et al, 2002;Lie et al ,. 2004;Pabendon et al, 2006;Pabendon et al, 2008;Zhang et al, 2012).…”

“…Research on the genetic diversity of corn in Indonesia using microsatellite markers have been reported by Pabendon, et al (2003), and Pabendon (2006), or a combination of morphological markers and microsatellite (Pabendon, et al, 2008, andFate, et al, 2009). Especially for local corn on Kisar Island Southwest Maluku Regency, there is no research had never done to determine the genetic diversity of these cultivars.…”

Seleksi Jagung Inbrida dengan Marka Molekuler dan Toleransinya terhadap Kekeringan dan Nitrogen Rendah

“…Hasil penelitian Pabendon et al (2008) Indikator jagung inbrida yang toleran cekaman kekeringan dan pemupukan N rendah dapat ditentukan berdasarkan tingkat penurunan hasil biji yang lebih kecil pada kondisi cekaman dibanding kondisi optimum (Banziger et al 2000) dan tingkat toleransinya dapat digolongkan berdasarkan nilai indeks sensitivitas cekaman (ISC) (Fischer and Maurer 1978). Semakin kecil penurunan hasil biji pada kondisi cekaman maka nilai ISC akan semakin kecil pula sehingga berpeluang digolongkan sebagai inbrida toleran.…”

“…Menurut Liu et al (2003), keragaman genetik yang luas dari sejumlah inbrida dan membagi-baginya ke dalam kelompok-kelompok heterotik bermanfaat untuk memandu para pemulia dalam menyeleksi kandidat tetua dalam program persilangan. Informasi tersebut memungkinkan pemulia memilih inbrida sebagai calon tetua dalam pembentukan varietas unggul jagung hibrida atau jagung sintetik (Legesse et al 2007, Pabendon et al 2008.…”

Short Communication: Genetic variability of local corn cultivars from Kisar Island, Maluku, Indonesia based on morphological characters

“…Research on the genetic diversity of corn based on morphological characterization in Indonesia has been reported by Wijayanto (2007), Febriani et al (2008, Amzeri et al (2011), as well as by Yusran and Maemunah (2011), while the combination of morphological and molecular characters has been reported by Pabendon et al (2007), Pabendon et al (2008), and Andi Takdir et al (2009). Research on morphological performances of corn from Southwest Maluku District have been also reported by Pesireron et al (2013a), as well as in Leti and Pulau-Pulau Terselatan (Pesireron et al 2013b).…”