Представлены результаты изучения минерального состава голоценовых осадков озера Малые Чаны, принадлежащего Чановской озерной системе, расположенной в Барабинской степи и состоящей из трех озер: Большие Чаны, Малые Чаны и Яркуль, соединенных протоками. Методы исследования-рентгеновская дифрактометрия (XRD), ИК и КР-спектроскопия, лазерная гранулометрия, определение стабильных изотопов 18О и 13С, элементный анализ и др. Установлено, что доминирующими минералами в озерных осадках являются кварц, полевые шпаты и карбонаты, в подчиненных количествах присутствуют гипс, бассанит, пирит, слюда, хлорит, каолинит. Моделированием XRD профилей карбонатов функцией Пирсона VII в образцах идентифицированы присутствующие карбонатные фазы и определены их количественные соотношения. Сопоставлением высокоразрешающей карбонатной записи, содержащей сведения о стратиграфическом распределении карбонатов в датированном разрезе, с литологическими, геохимическими и изотопными данными реконструирована эволюция бассейна оз. Малые Чаны, выделено пять стадий его развития на протяжении голоцена. Показано, что соотношения минералов в разрезе меняются в соответствии с колебаниями уровня озера, отражающими характерное чередование периодов иссушения/увлажнения голоценового климата Сибирского региона. Выполнено сравнение минерального состава донных осадков оз. Малые Чаны и Ярковского плеса оз. Большие Чаны. Выявленные ассоциации отражают локальные особенности озерной системы и влияние природно-климатических факторов на процессы континентального осадконакопления.