Identifying Chinese Herbal Medicine Network for Endometriosis: Implications from a Population‐Based Database in Taiwan

Tsai, Pei Ju; Lin, Yi‐Hsuan; Chen, Jiun Liang; Yang, Shun-Min; Chen, Yi Chun; Chen, Hsing-Yu

doi:10.1155/2017/7501015

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“…Relationships between a small number of kampo formulas have been analyzed in previous studies . In addition, relationships between a small number of formulas used in traditional Chinese medicine have been analyzed , but the entire network structure of kampo formulas has not been analyzed systematically.…”

Section: Introductionmentioning

confidence: 99%

Network analysis of kampo formulas based on crude drug composition and indications

Oku

2019

Traditional & Kampo Medicine

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Aim Many kampo formulas have been developed by combining crude drugs in various ways, providing diverse medicinal effects. Similarity between kampo formulas is usually determined based on their compositions and medicinal effects, but the entire network structure of Kampo formulas has not been analyzed systematically. In this study, I investigated the associations between kampo formulas based on their compositions and indications in order to provide an overview of the complex network structure of kampo formulas. In addition, relationships between crude drugs and indications were also investigated in a similar manner. Methods The list of the 294 over‐the‐counter kampo formulas defined by the Ministry of Health, Labour and Welfare, Japan was analyzed to construct networks of kampo formulas. Kampo formulas were connected by edges if their crude drug compositions or indications had significant overlap. A network of crude drugs and indications was also constructed by linking crude drugs and indications if they co‐occurred in significantly many kampo formulas. Results Three groups related to keishito, shosaikoto, and rikkunshito were identified in the network of kampo formulas based on crude drug composition. Three groups related to the treatment of gastric disorders, women's diseases, and neuralgia were also identified in the network of kampo formulas based on indications. Major groups were also identified in the network of crude drugs and indications. Conclusion The networks of kampo formulas as well as crude drugs and indications were successfully obtained, which may help to facilitate our understanding of kampo formulas and crude drugs.

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Section: Introductionmentioning

confidence: 99%

Network analysis of kampo formulas based on crude drug composition and indications

Oku

2019

Traditional & Kampo Medicine

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“…Redes Semânticas (MALLAT et al, 2015;KE et al, 2014) também tiveram suas abordagens evidenciadas, além de Redes Biológicas (HONG et al, 2018;FU et al, 2017;TSAI et al, 2017;Özgür Cingiz;BIRICIK;DIRI, 2017;DASGUPTA;SAHA, 2016;BELYI et al, 2016;SOROKINA;MEDIGUE;VALLENET, 2015;MORE et al, 2011) que embora seja uma aplicação e não uma modelagem proposta, ainda é definida como uma Rede.…”

Section: Resultsunclassified

“…Quanto às tarefas de agrupamento (VALLE; RUZ; MORRÁS, 2018;ZHANG et al, 2018;GUO;YU et al, 2017;TSAI et al, 2017;FU et al, 2017;MARTÍNEZ-BALLESTEROS et al, 2017;SLAIMI et al, 2017;MONDAL;BHATTACHARYA;MONDAL, 2016;ZHENWEI;LINGYUN;LIZHU, 2016;RUSH et al, 2016;XING, 2016;LI-XIONG et al, 2015; RODRIGUES; GAMA; FERREIRA, 2012; AL-KHASSAWNEH; BAKAR; ZAINUDIN, 2012; RAJPUT; THAKUR; THAKUR, 2012; CHOOBDAR; SILVA; RIBEIRO, 2011; ALZOUBI; OMAR; BAKAR, 2011), várias abordagens fazem uso das Redes na etapa de pós-processamento da mineração. Destaca-se os trabalhos de Karimi-Majd e Mahootchi (2014) que efetua, na etapa de pós-processamento da mineração, o uso de Redes para auxílio no agrupamento e mapeamento das regras.…”

Section: Resultsunclassified

“…Disponibilidade de Base de Dados nos artigos estudados Fonte: Elaborada pelo autor.de recursos, ou mesmo por não conseguir mensurar algumas métricas específicas os artigos não efetuaram a demonstração desse processo. Para dados relacionados à saúde(DELGADO et al, 2018;MINELGA et al, 2017;INDHUMATHY;NABHAN;ARUMUGAM, 2017;TSAI et al, 2017;KIM et al, 2017;TURGEMAN;SCIULLI, 2017;MARTÍNEZ-BALLESTEROS et al, 2017;BELYI et al, 2016;HERNANDEZ-LEAL et al, 2013), a validação estatística transcreve os índices de acurácia dos métodos, além de possibilitar um comparativo com outras abordagens já existentes na literatura. Outros trabalhos que utilizam Redes Bayesianas(DELGADO et al, 2018;CAI et al, 2017;NEMATI;SANT'ANNA;NOWACZYK, 2016;IQBAL et al, 2014;ODEH;AL-NAJDAWI, 2013;ZHANG, 2011;VEDULA;THATAVARTI, 2011) também executam o estudo estatísticos, pois são a base para a construção desse tipo de Rede.A utilização de uma validação estatística foi possível em pesquisas relacionadas a Grafos e Redes (FAN;NAMAKI et al, 2017;ADARICHEVA;NATION, 2017;CAI et al, 2017;XU, 2016;SHEN, 2016; HENDRICKX et al, 2015) por fazerem uso de Medidas de Rede que podem auxiliar no processo de mineração de dados e geração de conhecimento.Estruturas de árvores de decisão foram utilizadas nas pesquisasde Li et al (2017) e Sheu et al (2016, além do trabalhode Wang et al (2018) que utiliza árvores na validação estatística dos itemsets frequentes.Outros trabalhos também realizaram a validação estatística com o uso de métricas específicasSHENG et al, 2016;LI-XIONG et al, 2015) e em etapas de pós-processamento de Regras de Associação (PADUA;...…”

unclassified

“…A pesquisa deBaralis et al (2013) utiliza os conceitos de sumarização com Grafos para implementar uma nova abordagem de detecção de correlações em múltiplos termos, sendo validada por especialistas. A avaliação por especialistas foi detectada principalmente em dados relacionados à saúde(HONG et al, 2018;Özgür Cingiz;BIRICIK;DIRI, 2017;TSAI et al, 2017;FU et al, 2017). 19 -Descrição do método proposto aplicado na pesquisa Fonte: Elaborada pelo autor.Os processos de validação apresentados foram realizados com o uso de várias estruturas e métricas como Redes Bayesianas(DELGADO et al, 2018;CAI et al, 2017;NEMATI; SANT'ANNA; NOWACZYK, 2016) e árvores de decisão(FU et al, 2017;LI et al, 2017;SHEU et al, 2016).Em 55% dos artigos é efetuada uma comparação (Figura 21) do método proposto com outros na literatura.…”

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Redes de regras de associação filtradas e multialvo

Calçada¹

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Este trabalho é dedicado à minha família em todos os planos da vida AGRADECIMENTOS Agradecimentos são sempre feitos de forma simples e direta citando nomes e elementos de uma forma geral que contribuíram com este trabalho. Farei um pouco diferente, pois são nas diferenças que percebemos o quanto a nossa vitória realmente compensou.Dizer que agradeço a Deus é muito pouco diante de tamanha dívida que possuo com o criador. Graças a Ele, tive e tenho a oportunidade de usufruir de uma reencarnação repleta de aprendizados, sendo a conclusão deste trabalho de grande importância em minha vida. Não tendo realmente outras palavras, simplesmente digo OBRIGADO SENHOR! Muito mais que uma orientadora, uma amiga e quase uma mãe, acima de tudo alguém que confiou em mim, no meu potencial. Ela me motivou desde o início, mesmo antes de saber que seria minha orientadora, e continua me inspirando a seguir firme, em frente, e a sempre "defender meu cinturão" após o doutorado. Prof a Solange Rezende, obrigado pela veracidade e pelo norteamento de minha vida acadêmica e pessoal, tornando-me um cientista da computação de verdade e um ser humano melhor.Agradecer a todos que contribuíram diretamente com os experimentos e estudos. Meu amigo Renan pelo tempo compartilhado em várias conversas e debates nos estudos de Mineração de Regras de Associação. Minhas "protetoras" Ivone, Roberta e Camila que me auxiliaram em tantas oportunidades, não só com orientações e sugestões sobre o trabalho, mas também sobre aspectos de minha vida pessoal.Agradecer aos demais membros da equipe SOL que tive o prazer de conviver. João Antunes, Ricardo Scheicher, Ricardo Marcacini, Vítor e Dildre, além dos outros que contribuíram bastante comigo, mesmo sem saber. Agradecer a todos do LABIC, na pessoa dos professores Alneu e Gustavo, e de todos seus orientandos, por me acolherem tão bem e me ensinarem que para crescer profissionalmente a gente DEVE compartilhar.Meu muito obrigado aos professores do Programa de Pós-graduação em Ciências da Computação e Matemática Computacional da USP em São Carlos pela paciência a mim direcionada e pelas disciplinas fundamentais em minha formação, destaco o Professor Cláudio Toledo que se tornou um parceiro de pesquisa e um amigo para o resto da vida. A todos os funcionários da USP que eu tanto "perturbei", muito obrigado! Emano gratidão a todos que coordenaram esse programa durante a minha passagem, em especial ao professor Ades que muitas vezes pareceu que estava atendendo a um parente próximo bem querido quando eu a ele me dirigia para tirar dúvidas e principalmente pedir ajuda. Ajuda que nunca foi negada.Às vezes agradecemos pela realização de sonhos, principalmente àqueles que nem sabíamos que poderiam ser realizados, por isso agradeço à UESPI e à USP-São Carlos por possibilitarem que eu fizesse um doutorado na melhor Universidade da América Latina, e ainda com nota 7 da CAPES, algo inimaginável para mim.Agradecimento a todos os meus colegas de DINTER, que mesmo sem a possibilidade de convivermos durante todo o processo do douto...

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Pharmaceuticals targeting signaling pathways of endometriosis as potential new medical treatment: A review

Hung

Zhang

Tan

et al. 2021

Medicinal Research Reviews

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Endometriosis (EM) is defined as endometrial tissues found outside the uterus. Growth and development of endometriotic cells in ectopic sites can be promoted via multiple pathways, including MAPK/MEK/ERK, PI3K/Akt/mTOR, NF‐κB, Rho/ROCK, reactive oxidative stress, tumor necrosis factor, transforming growth factor‐β, Wnt/β‐catenin, vascular endothelial growth factor, estrogen, and cytokines. The underlying pathophysiological mechanisms include proliferation, apoptosis, autophagy, migration, invasion, fibrosis, angiogenesis, oxidative stress, inflammation, and immune escape. Current medical treatments for EM are mainly hormonal and symptomatic, and thus the development of new, effective, and safe pharmaceuticals targeting specific molecular and signaling pathways is needed. Here, we systematically reviewed the literature focused on pharmaceuticals that specifically target the molecular and signaling pathways involved in the pathophysiology of EM. Potential drug targets, their upstream and downstream molecules with key aberrant signaling, and the regulatory mechanisms promoting the growth and development of endometriotic cells and tissues were discussed. Hormonal pharmaceuticals, including melatonin, exerts proapoptotic via regulating matrix metallopeptidase activity while nonhormonal pharmaceutical sorafenib exerts antiproliferative effect via MAPK/ERK pathway and antiangiogenesis activity via VEGF/VEGFR pathway. N‐acetyl cysteine, curcumin, and ginsenoside exert antioxidant and anti‐inflammatory effects via radical scavenging activity. Natural products have high efficacy with minimal side effects; for example, resveratrol and epigallocatechin gallate have multiple targets and provide synergistic efficacy to resolve the complexity of the pathophysiology of EM, showing promising efficacy in treating EM. Although new medical treatments are currently being developed, more detailed pharmacological studies and large sample size clinical trials are needed to confirm the efficacy and safety of these treatments in the near future.

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Identifying Chinese Herbal Medicine Network for Endometriosis: Implications from a Population‐Based Database in Taiwan

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Network analysis of kampo formulas based on crude drug composition and indications

Network analysis of kampo formulas based on crude drug composition and indications

Redes de regras de associação filtradas e multialvo

Pharmaceuticals targeting signaling pathways of endometriosis as potential new medical treatment: A review

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