Glossário de termos usados no planejamento de fármacos (recomendações da IUPAC para 1997)

Abstract

a N.T.: Por se tratar de um campo de evolução muito rápida, muitos termos novos surgiram desde a publicação do glossário em língua inglesa e a atual tradução. Este trabalho deve ser considerado como um esforço inicial para suprir as necessidades de padronização dos termos do planejamento computacional de fármacos na língua portuguesa, os quais já são usados com freqüência em artigos de química medicinal publicados em nosso país. b N.T.: AMBER também refere-se ao campo de força. Apesar deste campo de força ter sido parametrizado e definido para proteínas e ácidos nucléicos, parâmetros têm sido adicionados para estendê-lo para cálculos de outras classes de moléculas. c N.T.: Na maior parte dos casos as relações quantitativas envolvem atividades farmacológicas, mas o método pode ser aplicado igualmente a conjuntos de moléculas planejadas para causar qualquer ação sobre organismos vivos, inclusive tóxica, como é o caso dos pesticidas. d N.T.: O método CoMFA também pode ser usado para a análise de relações quantitativas entre afinidades (por receptores, etc.) com propriedades físico-químicas tridimensionais.

Um paradigma da química medicinal: a flexibilidade dos ligantes e receptores

“…Este quadro vem se modificando com a ampliação do número de trabalhos utilizando outros tipos de metodologias capazes de produzirem modelos "dinâmicos" do complexo entre o ligante e sua proteí-na-alvo. Dentre estas podemos citar a QSAR-4D 5 , o "docking" flexível 6 , a dinâmica molecular [7][8][9] e o método de Monte Carlo 6,10 . Esta mudança no perfil dos modelos gerados por modelagem molecular está sendo possibilitada principalmente pela redução do custo computacional necessário à realização destes estudos, de forma que computadores pessoais já substituem eficientemente custosas estações de trabalho.…”

Modelagem molecular aplicada ao desenvolvimento de moléculas com atividade antioxidante visando ao uso cosmético

“…• Cálculos computacionais: cálculos das propriedades moleculares realizadas por computador, com níveis diversos de variáveis, que podem substituir as medidas experimentais quando o procedimento necessário é muito elaborado ou de difícil realização (Cohen, 1996). Algumas propriedades como: energia de formação, energia de ativação, momento de dipolo, características de orbitais moleculares, eletrônicas, atômicas, de ligações, polarizabilidade, caráter hidrofóbico, e outras como coeficiente de partição (logP) e refratividade molar (MR) podem ser originados por através de cálculos computacionais que incluem mecânica molecular, métodos semiempíricos, cálculos ab initio e outros métodos empíricos (Cohen, 1996;Sant'Anna, 2002).…”

“…Os métodos recentes usam parametrizações oriundas de cálculos ab initio baseados na teoria de Huckel estendida e no programa CNDO (Complete Neglet of Differential Overlap), que auxiliam nos cálculos de orbitais e cargas. A fim de obter dados mais seguros quanto à energia, métodos semiempíricos aperfeiçoados foram introduzidos como MINDO-3 (Modified Intermediate Neglect of Differential Overlap), MNDO (Modified Neglect of Diatomic Overlap) e AM1 (Austin Model 1) (Cohen, 1996;Sant'Anna, 2002).…”

A QSAR, Pharmacokinetic and Toxicological Study of New Artemisinin Compounds with Anticancer Activity

“…In the theoretical chemistry area there are some strategies that are promising in relation to the design of new drugs, such as rational design, which consists of using information in different areas of human knowledge, especially those related to the electronic levels of the drug, physical-chemical parameters (hydrophobic, steric and electronic) related with the biological activity [16][17][18][19]. This type of strategy, unlike molecular modification, does not have high time demands and is low in financial investment.…”