Genetic variability analysis of Byrsonima crassifolia germplasm collected in Pará State using ISSR markers

Abstract

ABSTRACT. Native of the Amazon, the nanche (Byrsonima crassifolia) is a fruit cultivated by family farmers and used in cooking; as such, it represents an opportunity for regional agribusiness. The Embrapa Eastern Amazon set up an active germplasm bank (BAG) consisting of 22 accessions sampled in 11 municipalities of Pará State. Due to its economic potential, there is an interest to advance the genetic breeding program of this species. The aim of this study was to characterize the BAG nanche collection using inter-simple sequence repeat (ISSR) markers. Accessions were genotyped using 23 preselected ISSR primers resulting in 109 amplified polymorphic and 51 monomorphic bands. With eight polymorphic bands each, the most polymorphic primers were UBC 809 and UBC 848. An unweighted pair-group method with arithmetic average cluster analysis based on Jaccard's coefficient indicated that the individuals clustered into two distinct groups. Accessions Igarapé Açu-2 and Augusto Corrêa-Pl 1 were most similar. The genetic dissimilarity values ranged from 0.10 to 0.59. We conclude that the ISSR markers were efficient in detecting polymorphisms in the nanche accessions, and that it is possible to infer the genetic variability among accessions of the collection. This demonstrate the importance of using molecular markers in poorly studied species and the advantages that this information can bring to the genetic improvement of such species.

Genetic diversity among Hymenaea courbaril L. genotypes naturally occurring in the north of Mato Grosso State, Brazil

“…The genotypes that showed the lowest dissimilarity were 14 and 19, whereas the most divergent were 3 and 22. Rodrigues et al (2016) evaluated the genetic variability of Byrsonima crassifolia (L.) H.B.K. from the germplasm database of Embrapa Amazônia Oriental and identified dissimilarity values between 0.10 and 0.59.…”

Compuestos de interés funcional del nanche (Byrsonima crassifolia (L.) H.B.K.)

“…Para la cáscara se reporta 1.89 por ciento, mientras que para la semilla 8.8 por ciento (Araújo et al 2018;Carlos et al 2017 (Pires et al 2017Siguemoto 2013. En el caso de la semilla, se han reportado valores del contenido de lípidos de 15.0 a 33.0 g, donde se identifican como principales ácidos grasos al palmítico, oléico y linoléico, los cuales son responsables de 95 por ciento del total de ácidos grasos (Araújo et al 2018;Costa et al 2017;Rodríguez et al 2016). El nanche también es una importante fuente de fibra dietética, particularmente soluble en pulpa (pectinas, almidones) e insoluble en cáscaras (ligninas Compuestos funcionales del nanche Agredano-de la Garza et al…”

“…Normalmente, se encuentran en cantidades pequeñas en los alimentos que consumimos como parte de nuestra dieta habitual y en casi todos los casos provienen de fuentes alimentarias vegetales (Patil et al 2009;Jiménez-Colmenero et al 2013). Entre los compuestos bioactivos presentes en nanche se han encontrado, principalmente, fenólicos tales como: catequinas, taninos, así como también algunos carotenoides (Pires et al 2019;Rodríguez et al 2016;Mariutti et al 2013;Jiménez et al 2012). La investigación sugiere que el aumento del consumo de alimentos ricos en compuestos antioxidantes, como los compuestos fenólicos, se asocian a una reducción del riesgo de sufrir enfermedades crónicas (Almeida et al 2011;Canuto et al 2010).…”

“…Adicionalmente, proporciona diferentes compuestos bioactivos antioxidantes, como compuestos fenólicos, carotenoides (luteína y zeaxantina) y vitamina C (Almeida et al 2011;Mariutti et al 2013). Los principales compuestos bioactivos contenidos en el fruto de nanche son el ácido gálico y quercetina (Pires et al 2019;Rodríguez et al 2016). También contiene cantidades traza de catequina, epicatequina, rutina y kaempferol (Mariutti et al 2013).…”

Μελέτη της βιοποικιλότητας του Cistus στην Ελλάδα και επιλογή γονοτύπων για ενεργές χημικές ουσίες με βιοτεχνολογικές προσεγγίσεις

“…Σε επόμενη εργασία χρησιμοποιήθηκαν δείκτες ISSRs σε δεκαεπτά ινδικούς γονότυπους αραβοσίτου και αξιολογήθηκε η ομοιότητα μεταξύ μητρικών και in vitro φυτών, επιβεβαιώνοντας τη μεταξύ τους γενετική ακεραιότητα (Ramakrishnan et al, 2014). Η τεχνική των μοριακών δεικτών ISSRs εφαρμόστηκε και σε πολλά άλλα είδη με μεγάλο οικονομικό ενδιαφέρον, ενώ αργότερα εφαρμόστηκε και σε είδη με μικρότερη οικονομική σημασία, όπως το ~ 35 ~ Brachypodium distachyon (Hammami et al, 2014), την Cassia fistula L. (Verma et al, 2017), το Sesamum indicum L. (Abate et al, 2015), το Corylus avellana (Martins et al, 2014), το Byrsonima crassifolia (Rodrigues et al, 2016) το Dendrocalamus strictus (Goyal et al, 2015), το Justicia adhatoda (Kumar et al, 2014), κ.ά.…”