Genetic diversity within and among populations of Cajazeira

Abstract

Spondias mombin is a fruit species belonging in the Anacardiaceae family with a large geographical distribution. It is of economical and social importance due to its fruit being intensively used for the industrial purposes of making juice, popsicle, jelly, and liquors. The objective of this work was the characterization of the genetic diversity both intra and inter populations of this species. This analysis was made by means of molecular markers of the type AFLP (amplified fragment length polymorphism) in three populations in a region close to Manaus city, state of Amazonas: Amozonas National University (UFAM), Buriti village (VLB) and the Executive Commission for the Cultivation of Cacao (Ceplac).

Genetic divergence between Brazilian Northern and Northeastern populations of Spondias mombin revealed with SNP markers

“…Although intrapopulation variation was the major source of variation detected in the AMOVA, the percentage of inter-population variation was also quite expressive. F statistics indicate signi cant genetic divergence between the DAPC groups and the populations, results similar to those identi ed by Magalhães et al (2013), who analyzed yellow mombin populations in the Amazon using AFLP markers and identi ed 47.2% of the variation between populations and 52.8% within the studied populations. Two studies evaluating populations of S. mombin originating from the State of Mato Grosso, in the Midwest region of Brazil, also observed that most of the genetic variation was found within populations: observed that 78% of the variation in Anacardium occidentale L. originated between individuals within populations.…”

Diversidade genética entre e dentro de populações de Cenostigma tocantinum Ducke

“…Houve uma variação de 29 a 37 locos polimórficos por combinação de oligonucleotídeo (Tabela 1). O percentual de locos polimórficos encontrados neste trabalho é comparável a outros trabalhos com espécies arbóreas, tanto usando marcadores AFLP (MAGALHÃES et al, 2013) Os valores da heterozigosidade esperada (H e ) e o índice de diversidade genética de Shannon e Weaver (I) apresentaram baixa variação nas três populações (Tabela 2). A população Presidente Figueiredo apresentou os maiores valores de H e (0,284) e I (0,431), sugerindo maior diversidade genética intrapopulacional.…”

Genômica populacional da cajazeira (>i<Spondias mombin>/i< L.)

“…Para avaliar o atual estado de conservação da espécie e traçar estratégias para sua conservação, é imprescindível a realização de estudos para quantificar e caracterizar a diversidade genética existente em populações naturais. Em trabalhos realizados para estudos da diversidade da espécie foram utilizados marcadores morfológicos, bioquímicos (isoenzimas) e moleculares do tipo RAPD (Random Amplified Polymorphic DNA), AFLP (Amplified Fragment Length Polymorphism), e ISSR (Inter Simple Sequence Repeat) (Silva et al, 2009a;Lima et al, 2011;Magalhães et al, 2013;Silva et al, 2014;Silva et al, 2017a,b). Nenhum dos estudos realizados anteriormente possuem uma amostragem tão extensa geograficamente quanto a realizada no presente estudo.…”

“…Os valores observados na estatística F indicam divergência genética significativa entre os grupos DAPC e as populações coletadas. Os resultados obtidos na AMOVA são semelhantes aos identificados porMagalhães et al (2013) que analisaram populações de cajazeira do Amazonas a partir de marcadores AFLP e identificaram 47,2% da variação entre populações e 52,8% dentro das populações estudadas.Em um estudo realizado com a espécie Mangifera indica,Surapaneni et al (2013) observaram que 62,25% da variação genética tinha origem na variação entre os indíduos eSantos et al (2019), em um estudo realizado com Anacardium occidentale, observaram que 78% da variação tinha origem nos indivíduos.Os resultados obtidos para diversidade genética (HE) no presente estudo demonstraram que sete das nove populações avaliadas apresentaram valores de HE superiores aos encontrados porHamrick et al (1992) em um estudo realizado com seis espécies de angiospermas arbóreas tropicais, identificando o valor de 0,106 para a média de diversidade genética apresentada pelas espécies. Duas das populações de cajazeira (Chapadinha e Areia) apresentaram valores baixos de diversidade genética.…”