Genetic and biochemical characterization of staphylococci occurring in Novosibirsk, Russia

Abstract

Staphylococci are capable of penetrating many hu man tissues and organs, causing superficial and deep purulent infections, respiratory and urinary tract in fections, food poisoning and intoxication. Last years, coagulasenegative staphylococci were the cause of infection in many cases. Infectious agents, namely Staphylococcus epidermidis, Staphylococcus haemolyticus, and Staphylococcus hominis, were detected more often as nosocomial infections. A particular danger of these infections is a high virulence and pathogenicity of bacterial strains and their resistance to various anti biotics. Methicillinresistant staphylococci are espe cially difficult to treat. The correct identification of staphylococci and their sensitivity to antibiotics are important for clinical diagnosis and appointment of adequate drug therapy. Rapid and accurate identifica tion of Staphylococcus species and detection of their sensitivity to antibiotics is quite important. The aim of this study was to study staphylococci isolated in Novo sibirsk from human, animal and environmental sam ples. A collection of 100 staphylococcus strains was analyzed. Staphylococcus species were identified by sequencing the 16S rRNA gene. Eleven staphylococcus species were identified. Among the strains obtained from hospitalized patients, Staphylococcus aure us do Стафилококки способны поражать практически любые органы и ткани организма человека, вызывая поверхностные и глубокие гнойные инфекции, поражения дыхательных и мочевыводящих пу тей, а также провоцировать пищевые отравления и интоксикации. В последние годы участились случаи заболеваний, возбудителями которых оказываются коагулазонегативные стафилококки. Такие виды, как Staphylococcus epidermidis, Staphylococcus haemolyticusb и Staphylococcus hominis значительно чаще выявляются при внутри больничных инфекциях. Особая опасность этих патогенов заклю чается в повышенной вирулентности и патогенности штаммов, а также в их частой устойчивости к различным антибиотикам. Осо бенно трудно поддаются лечению заболевания, вызванные мети циллинрезистентными стафилококками. Правильная идентифика ция стафилококков и их чувствительности к антибиотикам важна для постановки клинического диагноза и назначения адекватной лекарственной терапии. В связи с этим востребованы методы бы строго и точного определения видов стафилококков для оценки их патогенных свойств и наличия метициллинрезистентности. Цель данного исследования -характеризация стафилококков, в том числе и по устойчивости к антибиотикам, изолированных в г. Новосибирске из образцов, полученных от людей, животных и из окружающей среды. Проанализирована коллекция из 100 штам мов стафилококков. Видовая идентификация стафилококков про ведена по результатам секвенирования гена 16S рРНК. Выявлено 11 видов стафилококков. Среди штаммов, полученных от больных из стационаров, доминировали Staphylococcus aureus (79.1 %), Staphylococcus epidermidis составили около 12.5 %. Среди внебольнич ных штаммов S. aureus и S. epidermidis выделены примерно в рав ных соотношениях. Обнаружение к...

Changes in the Ultrastructure of Staphylococcus aureus Treated with Cationic Peptides and Chlorhexidine

“…Staphylococcus aureus (S. aureus), which causes a wide variety of pathologies, remains one of the most harmful bacteria, and has been researched for over 100 years. The notorious “reputation” of S. aureus is primarily based on its resistance to various groups of conventional antibiotics [ 1 , 2 , 3 , 4 ], and the need to obtain a new drugs which effectively destroy S. aureus and do not cause the development of drug resistance is among the top priorities for effective control of the infection [ 5 , 6 ]. Antimicrobial peptides (AMPs) are considered as promising tool to fight multidrug-resistant bacteria.…”

Antibiotic Resistance and Pathogenomics of Staphylococci Circulating in Novosibirsk, Russia

“…Most studies of staphylococci in Russia focused on the monitoring of antibiotic resistant isolates in hospitals and were often limited to characterizing only S. aureus [11][12][13][14][15]. Only a few studies of environmental, veterinary, and community-associated staphylococci in Russia have been published [16,17]. Data on genomes, virulence factors (VF), and antibiotic resistance genes (ARG) of staphylococci found in Russia are still limited, especially in Siberian Russia, which is located between the Far Eastern and European regions.…”

PHENOTYPIC RESISTANCE TO ANTIBIOTICS OF Staphylococcus aureus STRAINS ISOLATED FROM COW MILK

“…Признаки устойчивости к антимикробным агентам кодируются генами, которые могут переноситься на бактериальной хромосоме, плазмидах, транспозонах или на генных кассетах, включенных в интегроны (15)(16)(17). У штаммов S. aureus показано присутствие генов устойчивости rpoB, blaZ, mecA (18), aacA-D, tetK, tetM, ermA (19,20), msrA (21), linA, vatA, vatB, dfrA, gyrA, grlA, cat1 к антибиотикам групп ансамицины, пенициллины, аминогликозидам, тетрациклинам, макролид-линкозамид-стрептограминам В, линкозамидам, стрептограминамам и фторхинолонамам (22,23). Устойчивые к пенициллину изоляты несут плазмидный ген blaZ, который кодирует -лактамазный фермент, называемый пенициллиназой (24,25).…”