Expresión de alfa sinucleína en sangre y su relación con el estreñimiento crónico en población residente en Bogotá, D.C., con problemas de consumo de alcohol

Abstract

Introducción. El consumo excesivo de alcohol resulta en neuroadaptación, neurodegeneración y expresión diferencial de numerosos genes.Objetivo. Determinar la relación entre la expresión del gen de la alfa sinucleína (SNCA) en sangre, las variantes de nucleótido único (Single Nucleotide Variant, SNV) en su región promotora y el estreñimiento crónico en personas con problemas de consumo de alcohol.Materiales y métodos. La muestra estuvo conformada por 35 controles y 27 casos, seleccionados según el puntaje obtenido con la herramienta AUDIT. En el diagnóstico del estreñimiento se aplicaron los criterios de Roma IV. La extracción de ácidos nucleicos se hizo a partir de sangre periférica y se evaluó la expresión del gen mediante qPCR, la cuantificación proteica por ELISA y la presencia de SNV en la región promotora del gen por la secuenciación de Sanger.Resultados. Se observó sobreexpresión génica relativa de ARNm del gen SNCA en el grupo de casos sin relación con el estreñimiento crónico. Se evidenció un riesgo 4,8 veces mayor de presentar estreñimiento en el grupo de casos. Se encontraron nueve variantes de nucleótido simple en un segmento de la región promotora del gen rica en secuencias reguladoras CpG, con frecuencia similar entre los grupos, y se detectó una variante en la posición -2171 que no se encuentra reportada en GenBank para variantes clínicas y cuyo genotipo A/T se relacionó con el incremento de la expresión del ARNm del SNCA.Conclusión. En personas con problemas de consumo de alcohol se evidenció la sobreexpresión del ARNm de alfa sinucleína, lo cual no se relacionó con el diagnóstico de estreñimiento crónico.

Research Article Inflammatory response genes differentially expressed in a Colombian university cohort with alcohol consumption problems

“…The Ct of the tested gene and the reference gene in each sample were directly compared, and then the ∆Ct of the samples was measured. We chose the GADPH (glyceraldehyde 3 phosphate dehydrogenase) gene as the most appropriate reference for this type of experimental design, and the interplate calibrator sample was a mixture of equal proportions of controls and cases cDNA with a concentration of genetic material of 1 ng/uL (Bustin et al, 2009;Martínez-Rodríguez and Rey-Buitrago, 2020;Vargas Hernández and Rey Buitrago, 2020). For calculating the relative transcription (Roche, 2016), the following equation was used: Expression Rate= ET(CtTCal-CtT) /ER(CtRCal-CtR) which corresponded to the calculation of relative transcription measures using a reference gene, where ET was the efficiency of amplification of the target gene; ER was the reference gene amplification efficiency; CtT was the quantification cycle of the target gene; CtR was the reference gene quantification cycle; Cal: interplate calibrator sample.…”