Estructura y diversidad genética en vacas Holstein de Antioquia usando un polimorfismo del gen bGH

Abstract

RESUMENObjetivo. Determinar las frecuencias alélicas y genotípicas del polimorfismo del intrón 3 del gen bGH y estimar algunos parámetros de estructura poblacional en ganado Holstein. Materiales y métodos. El estudio se realizó con 1366 vacas Holstein en 120 hatos de 11 municipios del departamento de Antioquia. Se extrajo DNA por el método de Salting out y la genotipificación se realizó usando la técnica de PCR-RFLPs. La diversidad genética se determinó mediante la comparación de las heterocigosidades, El equilibrio de Hardy-Weinberg (HW) y la diferenciación genética entre las poblaciones se realizó usando el software Arlequín 2.0 Las frecuencias alélicas y genotípicas se evaluaron mediante el paquete estadístico SAS ® . Resultados. Las frecuencias genotípicas encontradas fueron 0.764 (+/+), 0.223 (+/-) y 0.013 (-/-) y las frecuencias alélicas 0.876 (+) y 0.124 (-). No se encontraron desviaciones del Equilibrio de Hardy Weinberg en ninguna de las subpoblaciones. La diversidad genética determinada mediante la comparación de las heterocigosidades fue relativamente baja entre poblaciones pero al interior de estas no. El valor de FST de toda la población fue de 0.0068 y significativo (p<0.05), algunos FST pareados también lo fueron, tomando valores desde 0.0 a 0.13. Los estadísticos FIT y FIS no fueron significativos. Conclusiones. El gen bGH es un candidato interesante para evaluar características de importancia económica ya que no parece haber sido sometido a selección directa, presenta una variabilidad media en las poblaciones, observándose diferenciación genética significativa entre distintos municipios, producto de los diferentes sistemas de producción y acceso a las biotecnologías.Palabras clave: Ganado lechero, genética de poblaciones, marcadores moleculares, polimorfismo (Fuente:AGROVOC). ORIGINALRev. MVZ Córdoba 18(1):3346-3354, 2013.

Genetic structure of Antioquia Holstein from two SNPs and association with dairy traits

“…Esto podría explicar la diferenciación genética encontrada entre las subpoblaciones del departamento de Antioquia; aunque existe flujo genético entre ellas este no ha sido suficiente para homogenizar las frecuencias alélicas, sin embargo se puede pensar que las poblaciones se encuentran en un proceso homogenización. En otros estudios (4,19) se ha reportado un número de migrantes mucho mayor al encontrado en esta investigación. Con base en un SNP del gen de hormona de crecimiento (bGH) se reportó para la población Holstein de Antioquia un Nm=36 (4), mientras que con base en un SNP del gen de lactoferrina (LTF) se ha reportado un Nm=25 para la misma población (19).…”

“…Con base en un SNP del gen de hormona de crecimiento (bGH) se reportó para la población Holstein de Antioquia un Nm=36 (4), mientras que con base en un SNP del gen de lactoferrina (LTF) se ha reportado un Nm=25 para la misma población (19). Este alto valor puede deberse a la implementación de la inseminación artificial que permite eliminar las barreras geográficas y aumentar el flujo genético entre las poblaciones (4,19).…”

“…Entre las metodologías existentes para seleccionar individuos superiores se encuentra la selección asistida por marcadores moleculares (SAM), son sitios en el genoma donde existen diferencias en la secuencia nucleotídica entre individuos de la misma especie, generando polimorfismos de un solo nucleótido (SNP) que se pueden identificar mediante la PCR-RFLP (3). Estos polimorfismos también pueden ser usados para conocer la estructura y diversidad poblacional (4). El SNP A192G se encuentra en el exón 1 de la inhibina alfa (INHA), al ser una mutación sinónima no cambia la secuencia de aminoácidos de la proteína pero genera un sitio de restricción adicional para la endonucleasa MspI (5,6).…”

“…Among the existing methodologies to select superior individuals we find marker assisted selection (MAS), which are sites in the genome where differences exist in the nucleotide sequence between individuals of the same species, generating single nucleotides polymorphism (SNP) that can be identified by the PCR-RFLP (3). These polymorphisms can also be used to know the structure and diversity of a population (4). The SNP A192G is found in the exon 1 of the inhibin alpha gene (INHA), and since it is a synonymous mutation it does not change the protein amino acid sequence, but rather generates an additional restriction site for the MspI endonuclease (5,6).…”

Parámetros De Variabilidad Genética De Bovinos Certificados De La Raza Holstein Del Cantón Cuenca, Ecuador

“…Referencias de estudios genéticos en diferentes países indican el empleo de marcadores microsatélites para la caracterización de la raza Holstein (Hanslik et al, 2000;Řehout et al, 2006;Ozkan et al, 2009;Rincón et al, 2013); sin embargo, en Ecuador se desconocen datos actuales sobre la variabilidad génica de esta raza. Se ha reportado que presenta problemas de consanguinidad y deficiencias reproductivas graves (Heins et al, 2006;Lucy, 2007;Galarza et al, 2017); por lo que, es necesario conocer las características de la estructura genética mediante un monitoreo sistemático del flujo de genes de la población Holstein presente en las zonas de mayor producción lechera del Ecuador.…”