Diversidade bacteriana da rizosfera de genótipos de milho contrastantes na eficiência de uso de fósforo

Abstract

Resumo -O objetivo deste trabalho foi avaliar a diversidade funcional e genética de bactérias associadas à rizosfera de genótipos de milho contrastantes quanto à eficiência de uso de fósforo, por meio do teste de fontes de carbono no sistema EcoPlate e da eletroforese em gel de gradiente desnaturante (DGGE) dos fragmentos amplificados dos genes 16S ribossomais (rDNA) das bactérias. Foram coletadas amostras de solo da rizosfera de linhagens e híbridos contrastantes quanto à eficiência de uso de fósforo, cultivados em Latossolo Vermelho-Escuro fase cerrado, com baixo e alto teor de P. Bactérias da rizosfera de híbridos e linhagens eficientes, sob estresse de P, analisadas pelo sistema EcoPlate, tenderam a se agrupar conforme a análise de componentes principais, o que indica que utilizaram fontes de carbono semelhantes. Não houve diferença na diversidade bacteriana, analisada pela DGGE, entre bactérias associadas a genótipos eficientes e ineficientes no uso de P. Com base no sequenciamento do 16S rDNA, foi verificado que a rizosfera de genótipos de milho sob estresse de P parece selecionar grupos específicos de bactérias. A estrutura populacional genética e metabólica de bactérias da rizosfera foi mais influenciada pelo teor de fósforo no solo do que pela eficiência das plantas em usar o fósforo.Termos para indexação: Zea mays, deficiência de fósforo, ecologia microbiana, PCR-DGGE, sistema EcoPlate. Bacterial diversity in the rhizosphere of maize genotypes contrasting for phosphorus use efficiencyAbstract -The objective of this work was to evaluate the functional and genetic diversity of bacteria associated to the rhizosphere of maize genotypes contrasting for phosphorus use efficiency by means of the EcoPlate carbon source test and denaturing gradient gel electrophoresis (DGGE) of amplified 16S ribosomal DNA (rDNA) fragments of bacteria. Rhizosphere soil samples of maize genotypes (hybrids and lineages) contrasting for phosphorus use efficiency cultivated in an Oxisol with high and low P content were collected. Bacteria from the rhizosphere of P-efficient maize genotypes under P stress conditions analyzed by the EcoPlate system tended to group together according to main components analysis, which indicates that these bacteria used similar carbon sources. Microbial diversity analyzed by DGGE did not differ between P-efficient and inefficient maize genotypes. Based on the 16S rDNA fragment sequencing, the rhizosphere of maize genotypes growing on low-P soils seemed to select specific bacteria species. The genetic and metabolic structure of the rhizosphere bacterial community was more strongly influenced by the level of P in the soil than by the genotypes with contrasting P-use efficiency.

Farming and soil urban occupation in the water quality of Jaboticabal and Cerradinho streams

“…This methodology compares the use of different carbon sources and is generally used in studies on bacterial communities in various environments such as soil, sludge, fresh water, sediments, biofilms and several other environments (Oliveira et al, 2009;Salomo;Munch;Roske, 2009;Medihala et al, 2012;Gryta;Frac;Oszust, 2014;Patel et al, 2014;Flores-Rentería et al, 2016). By knowing the potential of this method to compare microbial communities in various environments, we opted to use it to measure the ability of bacteria to metabolize different sources of carbon as a comparison tool for water samples.…”

Atributos bioquímicos e químicos do solo rizosférico e não rizosférico de culturas em rotação no sistema de semeadura direta

“…As divergentes respostas apresentadas pelas diferentes plantas sobre a atividade das enzimas podem ser decorrentes do estímulo diferenciado da comunidade microbiana ao efeito da rizosfera (Caravaca et al, 2004). A rotação de culturas e o sistema de semeadura direta avaliados neste estudo são manejos que podem influenciar a composição dos exsudatos por meio do tipo e da idade das plantas utilizadas, do metabolismo, da condição nutricional e de outros fatores ambientais (Oliveira et al, 2009). Além disso, as quantidades de resíduos vegetais incorporados ao solo, incluindo o sistema radicular morto, e a taxa de decomposição desses resíduos alteram os fluxos de energia e nutrientes para a comunidade microbiana (Nannipiere et al, 2007).…”

Identificação de bactérias da rizosfera de inhame, macaxeira e batata-doce potencialmente produtoras de polihidroxialcanoatos

“…6 A composição desses exsudatos pode variar com a idade e o genótipo da planta, bem como metabolismo, condição nutricional, tipo de estresse e outros fatores ambientais. 7 Esse tipo de ambiente favorece a multiplicação de rizobactérias.…”