Divergent ancestral lineages of newfound hantaviruses harbored by phylogenetically related crocidurine shrew species in Korea

Abstract

Spurred by the recent isolation of a novel hantavirus, named Imjin virus (MJNV), from the Ussuri white-toothed shrew (Crocidura lasiura), targeted trapping was conducted for the phylogenetically related Asian lesser white-toothed shrew (Crocidura shantungensis). Pair-wise alignment and comparison of the S, M and L segments of a newfound hantavirus, designated Jeju virus (JJUV), indicated remarkably low nucleotide and amino acid sequence similarity with MJNV. Phylogenetic analyses, using maximum likelihood and Bayesian methods, showed divergent ancestral lineages for JJUV and MJNV, despite the close phylogenetic relationship of their reservoir soricid hosts. Also, no evidence of host switching was apparent in tanglegrams, generated by TreeMap 2.0β.

Anjozorobe Hantavirus, a New Genetic Variant of Thailand Virus Detected in Rodents from Madagascar

“…Twenty-three species are officially reported, but the number of described taxa is increasing exponentially (King et al 2012). Each virus taxon is usually associated with one natural host species, including rodents (Order Rodentia) and insectivores (Order Soricomorpha) ( Jonsson et al 2010, Arai et al 2012. Partial L sequences of new hantaviruses have also been recently detected in bats (Order Chiroptera) (Sumibcay et al 2012, Weiss et al 2012, Arai et al 2013, Guo et al 2013.…”

Expanded Host Diversity and Geographic Distribution of Hantaviruses in Sub-Saharan Africa

“…In reconstructing the biogeographic history of the Soricidae, Dubey and colleagues proposed three equally parsimonious scenarios, based on the premise of two independent origins of the Crocidura genus (18). Viewed within this context, the phylogenetic positions of KMJV and ULUV in relation to TPMV and MJNV, which are hosted by Asian crocidurine shrews, and the clade comprising African crocidurine shrew-borne hantaviruses (BOWV, TGNV, and AZGV) and Jeju virus (JJUV) (19), which is hosted by the Asian lesser white-toothed shrew (Crocidura shantungensis) in Korea, supports a scenario in which the first diversification of the monophyletic Crocidurinae into Crocidurini and Myosoricini tribes occurred in Eurasia rather than Africa.…”

Taxonomie des hantavirus et situation des hantaviroses en France

“…Il est maintenant établi qu'une même espèce virale peut infecter plusieurs espèces d'hôtes proches génétiquement, remettant en cause la pertinence du premier critère (Firth et al 2012). Il a été également proposé d'être plus exigeant pour le deuxième critère en demandant une différence en acides aminés entre les différentes espèces de plus de 10% pour la protéine N et de 12% pour la protéine GP (Maes et al 2009 (Figure 1) (Maes et al 2009 ;Jonsson et al 2010 ;Arai et al 2012). Des séquences de nouveaux hantavirus ont été très récemment détectées chez des chauvessouris africaines, américaines et asiatiques (Order Chiroptera) (Sumibcay et al 2012;Weiss et al 2012 ;de Araujo et al 2012 ;Guo et al 2013).…”

“…De plus, des hantavirus relativement proches ont été trouvés chez des hôtes relativement éloignés (et réciproquement), suggérant un saut d'espèces. Il est donc maintenant plus convenu de parler de processus d'adaptation à un hôte spécifique que de processus de coévolution (Ramsden et al 2009 ;Arai et al 2012). De nombreux taxons restent à découvrir en particulier chez les chauves-souris, qui constituent dans ce domaine un nouveau champ d'investigation.…”