Differentiation of Erwinia Species in the “Amylovorap” Group by Class Analysis of Cellular Fatty Acids

Abstract

Cellular fatty acids of Erwinia species in the Amylovora group (E. amylovora, E. nigrifluens, E. quercina, E. rubrifaciens, E. salicis and E. tracheiphila), grown on King's medium B agar for 1,3, and 6 days at 28°C, were analyzed by gas‐liquid chromatography, grouped by chemical class, and compared in order to differentiate the species. For the group in general, the average percentage in 1‐day‐old cells ranged 36.4–41.5% for the saturated straight‐chain even‐carbon fatty acids, (Class A), 0.3–0.7% for saturated straight‐chain odd‐carbons (Class B), 43.4–53.3% for unsaturated acids (Class C), 4.5–7.1% for hydroxy‐substituted acids (Class D), 0.2–2.0% for branched‐chain acids (Class E), and 0–7.5% for cyclopropane fatty acids (Class F). Species could be differentiated in 4 sequential steps based on: 1) percentage of the 12:0 fatty acid (E. amylovora >3.6%, E. quercina (1%);2) sum of Classes E + F (E. tracheiphila (0.3%);3) ratio Class A/(E + F) (E. salicis <8); and percentage of 18:1 (E. rubrifaciens >14%, E. nigrifluens < 14%). Physiological age significantly affected relative percentages of Classes B, C and F in E. amylovora and E. salicis; of Classes A, C and F in E. quercina; of Class A in E. tracheiphila; and of Class C in E. nigrifluens.

Genetic Diversity of Brenneria Nigrifluens Strains in North of Iran (Margin of Caspian Sea)

“…For example use of bacteriofages (Zeitoun and Wilson, 1966), study of Serological properties (Harighi and Rahimian, 1997; Yousefi Kopaei et al, 2004), study of electrophoretic profiles of total cell proteins (Harighi and Rahimian, 1997;Scortichini, 1999;Yousefi Kopaei et al, 2004), Study of fat acids (Wells et al, 1994;Scortichini, 1999) and molecular methods for example RFLP (Thoth et al, 2001) and Rep-PCR (Moretti et al, 2007).…”

Caracterización fenotípica y genotípica de aislados españoles de Erwinia amylovora.

“…Se lleva a cabo mediante cromatografía de gases y el perfil obtenido se compara con patrones de especies conocidas almacenadas en la base de datos. En función de su estructura química, los ácidos grasos de las bacterias del grupo "amylovora" se dividieron en siete clases (van der Zwet y Wells et al, 1994) y su clasificación se basa en el contenido y proporción de los ácidos grasos en cada una de ellas.…”

“…Se lleva a cabo mediante cromatografía de gases y el perfil obtenido se compara con patrones de especies conocidas almacenadas en la base de datos. En función de su estructura química, los ácidos grasos de las bacterias del grupo "amylovora" se dividieron en siete clases (van der Zwet y Wells, 1993;Wells et al, 1994) y su clasificación se basa en el contenido y proporción de los ácidos grasos en cada una de ellas.El uso de bacteriófagos específicos constituye una herramienta adicional para la confirmación de la identidad de esta especie, aunque con limitaciones, ya que, hasta ahora, los fagos aislados no parecen ser completamente específicos de E. amylovora (Sobiczewski et al, 1997;Gill et al, 2003). …”