Deteksi Molekuler Mikroorganisme Patogen pada Bahan Pangan dengan Metode RT-PCR

Abstract

Foodborne diseases caused by pathogenic microorganism is one of health threats which need to be guarded. Great number of species but little amount of cells that contaminated ABSTRAKPenyakit akibat makanan yang terkontaminasi oleh mikroorganisme patogen menjadi salah satu ancaman kesehatan yang perlu diwaspadai. Banyaknya jenis mikroorganisme patogen serta kecilnya jumlah sel yang mengontaminasi bahan pangan menjadikan deteksi mikroorganisme patogen dalam bahan pangan menjadi suatu tantangan tersendiri. Deteksi secara konvensional melalui kultur mikroorganisme dalam media tertentu dianggap kurang efektif karena memerlukan waktu yang relatif lama serta potensi kontaminasinya yang cukup besar. Oleh karena itu, diperlukan metode deteksi mikroorganisme patogen pada bahan pangan yang lebih cepat, efektif, spesifik, dan sensitif untuk mencegah wabah penyakit akibat kontaminasi bahan pangan. Deteksi molekuler banyak dikembangkan karena menyajikan hasil pengujian yang lebih spesifik dan sensitif berdasarkan penanda molekuler tertentu. Salah satu yang paling banyak dikembangkan adalah Real Time-Polymerase Chain Reaction (RT-PCR) yang dapat mendeteksi materi genetik mikroorganisme pengontaminasi makanan dengan menggunakan primer dan probe (penanda) yang spesifik. Deteksi dengan RT-PCR memberikan hasil yang lebih spesifik dan sensitif untuk mencegah penyebaran penyakit akibat bahan pangan yang terkontaminasi mikroorganisme patogen.

Deteksi Bakteri Enterohemorrhagic Escherichia Coli Pada Lawar Merah Babi Dengan Menggunakan Teknik Polymerase Chain Reaction (Pcr) Pada Warung Di Denpasar

“…Beberapa metode telah digunakan untuk mendeteksi bakteri Escherichia coli pada makanan seperti metode konvensional seperti kultur/biakan, metode uji biokimia, dan uji serologis. Namun, teknik yang lebih sensitif dan spesifik digunakan yaitu teknik Polymerase Chain Reaction (PCR) 7 . Metode ini memiliki banyak kelebihan yaitu dapat mengidentifikasi bakteri lebih sensitif, menghasilkan amplifikasi produk yang akurat, spesifik karena target yang digunakan merupakan gen spesifik pada bakteri yang diteliti, serta menggunakan jumlah sampel yang sedikit.…”