Objetivo: Determinar los factores de riesgo asociados a mortalidad en pacientes hospitalizados con neumonía por SARS-CoV-2 en el Hospital San José del Callao durante el periodo mayo – octubre del 2020. Métodos y materiales: se realizó un estudio tipo analítico cuantitativo, observacional, transversal y retrospectivo, la población estuvo constituida por 215 pacientes con neumonía por SARS-CoV-2 que fueron hospitalizados en el Hospital San José del Callao entre los meses de mayo a octubre del 2020. Resultados: Los factores de riesgo para la mortalidad por neumonía por SARS-CoV2, de acuerdo al modelo de regresión logística con método de selección stepwise, fueron la Edad, Linfopenia, Saturación de oxigeno e Hipertensión Arterial (p<0.05). Los pacientes mayores de 60 años presentan un riesgo de mortalidad de OR: 5.6 veces más que los pacientes menores de 60 años. Similarmente los pacientes con linfopenia presentan un riesgo de mortalidad de OR: 8.1 veces más que los pacientes que no presentaron linfopenia. Por otro lado, una saturación de oxigeno < 93% representa un riesgo de mortalidad de OR: 19.0 veces más que en aquellos pacientes con saturación de oxigeno > 93% y finalmente la hipertensión arterial presenta un riesgo de OR: 2.5 veces más que aquellos pacientes que no tuvieron hipertensión arterial. Las variables restantes: Sexo, Índice de PaO2/FiO2, Polipnea, Diabetes Mellitus y Obesidad no presentaron efecto significativo (p>0.05) en la mortalidad de los pacientes por SARS-CoV2. Conclusiones: Existen diferentes factores de riesgo asociados a mortalidad en pacientes hospitalizados con neumonía por SARS-CoV-2 de los cuales los más significativos son la edad mayor a 60 años, la linfopenia, la saturación de oxigeno menor a 93% y la hipertensión arterial y los que no son significativos son el sexo Índice de PaO2/FiO2, Polipnea, Diabetes Mellitus y Obesidad.