Comparison of methods of estimating variance components in pigs.

Keele, J. W.; Long, Tiha M.; Johnson, R. K.

doi:10.2527/1991.6941428x

Cited by 10 publications

(4 citation statements)

References 19 publications

Supporting

Mentioning

Contrasting

Unclassified

Order By: Relevance

“…The value found agrees with results reported by Smith (1984) but is smaller than the values of 10 to 20% reported by other authors (Merks, 1988;Van Diepen and Kennedy, 1989;Keele et al, 1991;Haley and Lee, 1992;Hofer et al, 1992a).…”

Section: Geneticsupporting

confidence: 44%

Animal model estimation of genetic parameters and response to selection for litter size and weight, growth, and backfat in closed seedstock populations of large white and Landrace swine2

Ferraz

Johnson

1993

Journal of Animal Science

View full text Add to dashboard Cite

ABSTRACTranged from .01 to .14 for NBA, from .18 to .22 for LW, from .23 to .34 for ADG, and from .40 to .50 for BF. Maternal genetic variance was from 2.4 to 3.8% of phenotypic variance in NBA, from 1.2 to 3.6% in LW, from .5 to 1.5% in ADG, and from 1.9 to 3.4% in BF.The correlation between o and m was -.07 for NBA, -.25 for LW, -.34 for ADG, and -.26 for BF. Permanent environmental effects explained from 16 to 17% of total phenotypic variation for NBA and from 1.6 to 5.3% for LW. Approximately 7% of the variation in ADG and 5% in BF was due to litter environmental effects. Genetic trends were .012 pigsiyr for NBA, .25 kg/yr for LW, 5.91 g/yr for ADG, and -.063 mmlyr for BF.

show abstract

Section: Geneticsupporting

confidence: 44%

Animal model estimation of genetic parameters and response to selection for litter size and weight, growth, and backfat in closed seedstock populations of large white and Landrace swine2

Ferraz

Johnson

1993

Journal of Animal Science

View full text Add to dashboard Cite

show abstract

“…Segundo Meyer (1989) e Keele et al (1991), o método de máxima verossimilhança (ML), sob certas condições, pode corrigir para os efeitos de seleção. O problema observado no método ML, quando usado em modelos mistos, é que os efeitos fixos são trabalhados como se fossem conhecidos, sendo ignorada a perda de graus de liberdade com a inclusão desses efeitos.…”

Section: Introductionunclassified

Avaliação de modelos para estimação de componentes de variância e parâmetros genéticos para características de crescimento de bovinos da raça Guzerá

Silva

Packer²,

Silva³

et al. 2006

R. Bras. Zootec.

View full text Add to dashboard Cite

RESUMO -Foram utilizados registros de pesos de 26.314 bovinos da raça Guzerá referentes ao período de 1975 a 2001, divididos em intervalo de 90 dias do nascimento aos 630 dias de idade. Quatro modelos foram utilizados para estimar componentes de variância e parâmetros genéticos usando a metodologia REML: no modelo 1, foram considerados os efeitos genéticos direto (GA), materno (GM), de ambiente permanente materno (AM) e residual; no modelo 2, eliminou-se GM; no modelo 3, excluiu-se AM; e, no modelo 4, excluíram-se GM e AM. O teste de razão de verossimilhança (LRT) não detectou diferenças significativas em quase nenhuma das classes de idades dos modelos 1 e 2. As herdabilidades diretas estimadas nos modelos 1 e 2 foram semelhantes. Os valores de herdabilidade cresceram da primeira classe de idade até a segunda, mantiveram-se até o desmame e depois cresceram. As estimativas de herdabilidade direta, nas classes de idade mais próximas dos 205, 365 e 550 dias, para os modelos 1 e 2, foram 0,15; 0,12 e 0,14 e, nos modelos 3 e 4, foram 0,15; 0,14; 0,15 e 0,26; 0,19 e 0,17, respectivamente. O modelo 3 apresentou valores maiores de herdabilidade materna, em virtude da exclusão de AM. No modelo 4, houve superestimação da variância genética aditiva, como resultado da exclusão de GM e AM. A comparação entre modelos comprovou que o modelo sem GM foi equivalente ao modelo completo 1.Palavras-chave: bovinos de corte, estimativas de variâncias, efeitos maternos, herdabilidades Evaluation of models to estimate variance components and genetic parameters for growth traits of Guzerá cattleABSTRACT -Data from 26.314 animals of Guzerá cattle, weighted every 90 days from birth to 630 days, between 1975 and 2001, were used to estimate covariance components by REML methodology using four different models. The first model was the complete one and included four random components: direct genetic (GA), maternal genetic (GM), maternal permanent environmental (AM) and the residual; model 2 did not include the GM effect; model 3 did not include the AM effect and model 4 did not include both GM and AM effects. Models 1 and 2 did not differ by likelihood ratio test in almost all age classes. Direct heritability estimates obtained from models 1 and 2 were quite similar, and increased from first to second age, remained the same until weaning and then increased. Direct heritability estimates for weight in age classes close to 205, 365 and 550 days, by models 1 and 2, were respectively 0.15, 0.12 and 0.14. Estimates of the same parameter obtained by models 3 and 4 were respectively 0.15, 0.14, 0.15 and 0.26, 0.19, 0.17. Maternal heritability estimates by model 3 were higher because it did not include the AM effect. The additive genetic variance was probably superestimated by model 4 because it did not include GM and AM effects. The comparison between the models indicated that the model without GM was equivalent to the complete model 1.

show abstract

“…Cada um desses métodos apresenta propriedades que, em determinada situação, faz com que um ou outro seja de uso mais recomendado. O método REML tem sido considerado (SEARLE, 1971;HAR VILLE, 1977;HENDERSON, 1984a;MANDOUR et al, 1985;MEYER, 1986;LIN, 1987;VALENTE, 1988;GROENEVELD & KOVAC, 1990;MISZTAL, 1990;BOLDMAN & VAN VLECK, 1991;KEELE et al, 1991;MEYER, 1991MEYER, e 1993 e CALVIN, 1993, entre outros) o preferido para estimar componentes de covariâ.ncia de dados não balanceados. As razões para esta preferência passam pelas propriedades estatísticas desejáveis que os estimadores REML apresentam, a maioria das quais comuns com o método ML.…”

Section: Comentários Adicionaisunclassified

“…Todavia, o avanço considerável que se tem observado na área de informática, bem como a adaptação e implementação de eficientes algoritmos computacionais, têm permitido um uso generalizado deste método na área de melhoramento. Assim, nos últimos anos, inúmeros trabalhos de pesquisa, utilizando o mé todo REML, para estimação de covariância, foram publicados ( veja, entre outros, SMITH & GRASER, 1986;MEYER, 1983MEYER, , 1985MEYER, , 1986MEYER, , 1988MEYER, , 1989MEYER, , 1991MEYER, e 1993MEYER et al, 1991, LIN & LEE, 1986GRASER et al, 1987;LAIRD et al, 1987;VALENTE, 1988;DA et al, 1989;BOLDMAN & VAN VLECK, 1991;GROENEVELD & KOVAC, 1990;CHAUHAN & HAYES, 1991;KEELE, 1991;WEIGEL et al, 1991e VAN VLECK & GREGORY, 1992.…”

Section: Comentários Adicionaisunclassified

Procedimentos numéricos e estimação de componentes de covariância em análise multivariada pelo método da máxima verossimilhança restrita - modelos mistos aplicados ao melhoramento animal

Verneque¹

View full text Add to dashboard Cite

show abstract

Comparison of methods of estimating variance components in pigs.

Cited by 10 publications

References 19 publications

Animal model estimation of genetic parameters and response to selection for litter size and weight, growth, and backfat in closed seedstock populations of large white and Landrace swine2

Animal model estimation of genetic parameters and response to selection for litter size and weight, growth, and backfat in closed seedstock populations of large white and Landrace swine2

Avaliação de modelos para estimação de componentes de variância e parâmetros genéticos para características de crescimento de bovinos da raça Guzerá

Procedimentos numéricos e estimação de componentes de covariância em análise multivariada pelo método da máxima verossimilhança restrita - modelos mistos aplicados ao melhoramento animal

Contact Info

Product

Resources

About