Procedimentos numéricos e estimação de componentes de covariância em análise multivariada pelo método da máxima verossimilhança restrita - modelos mistos aplicados ao melhoramento animal

Abstract

pelas sugestões e amizade. À Professora Dr ª Clarice Garcia. Borges Demétrio, "nossa adotada tia", pela consideração, ensinamentos e saudável convivência. Aos Professores do Departamento de Matemática e Estatística da. ESALQ / USP, pelos ensinamentos e convívio.

Avaliação genética de touros pelo modelo animal, modelo touro e método das companheiras de rebanho

“…PEV é a variância do erro de predição do valor genético do animal, calculada como: PEV = C-1 k, com C-1 a inversa da matriz de coeficientes das equações do modelo misto (MME); e k é um vetor de mesma ordem da matriz C, com 1 na linha correspondente ao animal e 0 nas demais linhas. Na realidade, para estimar PEV não se inverte a matriz C, mas a solução é obtida pelo mesmo processo de estimação do valor genético dos animais usando a decomposição de Cholesky da matriz C (VERNEQUE, 1994e BOLDMAN et al, 1995.…”

“…A avaliação genética é um processo que consiste em prever o valor genético dos animais, compatível com as restrições impostas pela estrutura dos dados disponíveis, pela metodologia adotada e pelos recursos computacionais existentes (VERNEQUE, 1994). Em gado de leite, a avaliação genética é importante na identificação de animais de genética aditiva superior.…”

Research Article Identification of SSR markers linked to partial resistance to soybean rust in Brazil from crosses using the resistant genotype IAC 100

“…The variance components were estimated using the Selegen-REML/BLUP software, which uses the restricted maximum likelihood (REML) method, which is recommended in the case of mixed models with unbalanced data (Verneque, 1994;Duarte et al, 2001). It also uses the optimal procedure for prediction of genetic values (best linear unbiased prediction, BLUP) (Resende, 2002).…”

Mapeamento de QTLs ligados à resistência parcial da soja à ferrugem asiática.

“…Para a realização da ANAVA foi utilizado o programa Selegen-REML/BLUP. As pressuposições da ANAVA foram testadas pelos programas GENES(CRUZ, 2006) e SPSS versão 8.0 (SPSS Inc., Chicago IL).Os componentes de variância foram estimados empregando o programa Selegen-REML/BLUP, que utiliza o método da REML, que é o método recomendado no caso de modelos mistos com dados desbalanceados(VERNEQUE, 1994;, e o procedimento ótimo de predição de valores genéticos (best linear unbiase prediction -melhor predição linear não viesada), ou BLUP. No modelo utilizado o efeito de bloco foi assumido como fixo, os efeitos dos genótipos como aleatórios e os efeitos de testemunhas como fixos, conforme expressão: em que: : é a observação gerada para a parcela do bloco j que recebeu o genótipo i oriundo do cruzamento k;: é a constante comum a todas as observações (média geral, sob restrições do tipo "soma zero" para cada um dos demais efeitos); : é o efeito do bloco j (j = 1, 2, ... b), assumido como fixo; : é o efeito do cruzamento k, incluindo-se testemunha (k: 1, 2, ..., c, c+1, c+2,..., c+t), sendo c o número de cruzamentos originando progênies e t o número de testemunhas); : é o efeito do genótipo (progênie ou testemunha) i, oriundo do cruzamento k (i: 1, 2,..., p k ; p k é o número de genótipos no cruzamento k), assumido fixo e nulo se i for testemunha, ou aleatório com distribuição N ) independente, se i for uma progênie relacionada ao cruzamento k; e : é o erro experimental aleatório associado a ijk-ésima parcela, assumido independente e identicamente distribuído, sob N ).Trata-se, portanto, de um modelo misto em que as n observações , de incidências dos efeitos contidos em β e γ, respectivamente.…”