Characterisation of turnip mosaic virus isolates reveals high genetic variability and occurrence of pathotype 1 in Brazil

Abstract

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The recombinogenic history of turnip mosaic potyvirus reveals its introduction to Japan in the 19th century

“…2003 ; Nguyen, Tomitaka, and Ho et al. 2013b ) and Brazil ( Rodrigues, Chaves, and Kitajima et al. 2021 ).…”

Viroma associado aos cultivos de brássicas no Brasil: caracterização dos vírus mais frequentes

“…Enquanto para os vírus que infectam humanos e animais há uma corrida por vacinas e medicamentos, para os vírus de plantas, as estratégias de manejo e controle baseiam-se em prevenção, na tentativa de impedir o contato dos vírus com as plantas hospedeiras (entrada do patógeno na propriedade), ou na obtenção de plantas que sejam resistentes à infecção viral ou ao vetor (Eiras et al 2018). A disseminação dos principais vírus de brássicas que ocorrem no Brasil é realizada por afídeos vetores (Rodrigues et al 2021), sendo que as interações biológicas e moleculares vírus-vetor-hospedeira podem ser determinantes no sucesso da transmissão (Zhou et al 2018).…”

“…Espécies e variedades cultivadas dos gêneros Brassica e Raphanus destacam-se na produção agrícola nacional (Melo et al 2019). Porém, fatores como clima, baixa fertilidade dos solos, uso excessivo de agrotóxicos, sobreposição de cultivos, pragas (insetos e ácaros) e doenças causadas por bactérias, fitoplasmas, fungos, nematoides e vírus, podem influenciar a qualidade e o rendimento da produção (Carrijo & Rêgo 2000;Rimmer et al 2007;Newbert 2016;Rodrigues et al 2021;Oliveira et al 2022 (Kitajima et al 1970;Cupertino et al 1986;Shattuck 1992b;Rimmer et al 2007;Park & Hahn 2019;Greer et al 2021;ICTV 2022;Oliveira et al 2022).…”

“…A epidemiologia das coinfecções com outros vírus (CaMV e TuMV), a transmissão por afídeos e o papel das plantas da vegetação espontânea, bem como os danos associados à produção nos cultivos de brássicas também são desconhecidos.Aspectos envolvidos no entendimento da diversidade genética das populações virais, incidência, danos e epidemiologia dos vírus de brássicas têm sido estudados pelo Grupo de Pesquisa do Laboratório de Fitovirologia e Fisiopatologia do Instituto Biológico. Com relação ao TuMV, observou-se que que os isolados brasileiros apresentam elevada variabilidade genética, embora todos os isolados analisados pertençam ao patotipo I(Rodrigues et al 2021). Análises filogenéticas revelaram que os isolados brasileiros de TuMV se agruparam nos clados world-B (subgrupos world-B2 e world-B3) e basal-BR, sendo que, neste último, houve a formação de um clado composto exclusivamente por isolados brasileiros.…”

“…Análises filogenéticas revelaram que os isolados brasileiros de TuMV se agruparam nos clados world-B (subgrupos world-B2 e world-B3) e basal-BR, sendo que, neste último, houve a formação de um clado composto exclusivamente por isolados brasileiros. Além disso, análises filogenéticas e de recombinação sugerem que os isolados brasileiros de TuMV, muito provavelmente, tiveram uma origem europeia(Rodrigues et al 2021), o que poderia ser decorrente da origem das brássicas no Brasil(Madeira et al 2008) e a história evolutiva desse vírus(Yasaka et al 2017;Kawakubo et al…”