Caracterização molecular de cultivares de cana-de-açúcar utilizando marcadores ISSR

Abstract

, Márcia Vanusa da Silva RESUMOA diversidade genética de catorze cultivares de cana-de-açúcar (Saccharum oficinarum) foi acessada por meio de marcadores moleculares ISSR. Objetivou-se caracterizar molecularmente as cultivares estudadas. Foram utilizados trinta e sete primers de ISSR, dos quais, oito foram eficientes na amplificação do DNA das amostras analisadas, sendo sete primers suficientes para distinguir todas as cultivares de cana-de-açúcar envolvidas nas análises. A faixa de amplicons variou de 300 a 2000 pb. As cultivares RB 92579 e RB 863129 apresentaram maiores coeficientes de similaridade (77%) enquanto as cultivares RB 961 e RB 931611 formaram o grupo com menor similaridade (22%). Os resultados indicam que os marcadores ISSR foram úteis na análise da diversidade genética e geração de padrões genéticos (fingerprint), em germoplasma de cana-de-açúcar. Marcadores ISSR cultivar-específico foram obtidos com o primer UBC 817 para as 14 cultivares testadas. Num próximo trabalho, mais primers ISSR serão utilizados para buscar mais polimorfismos dessas e de outras cultivares de cana-de-açúcar. Termos para indexação:Saccharum oficinarum, marcadores moleculares ISSR, diversidade genética. ABSTRACTGenetic diversity of fourteen sugarcane cultivars was accessed by ISSR molecular markers. With the aim to characterizing and validating the efficiency of these markers in the fingerprint of studied cultivars, thirty seven ISSR primers were used, from which, eight were efficient for the DNA amplification. Seven primers were efficient to discriminate the fourteen studied sugarcane cultivars. The amplicons varied from 300 to 2000 bp. The cultivars RB 92579 and RB 863129 presented higher similarity coefficient (77%) while the cultivars RB 961 and RB 93611 formed the group with lower similarity (22%). The results suggested that ISSR markers were useful in the analysis of the genetic diversity and in the fingerprint in sugarcane germosplasm. In the next step more ISSR primers will be used in order to obtain more polymorphism from these varieties and to analyze more sugarcane cultivars.Index terms: Saccharum oficinarum, molecular markers, genetic diversity. A cana-de-açúcar (Saccharum officinarum) é uma cultura de grande importância econômica para alguns países da América, especialmente para o Brasil. O agronegócio da cana-de-açúcar, que reúne 6% dos empregos agroindustriais brasileiros, é responsável por 35% do PIB do estado de São Paulo, maior produtor do país, e 10% do PIB de Pernambuco, segundo maior produtor do Nordeste (SINDAÇÚCAR, 2005). Assim, a atividade canavieira do Brasil é responsável por cerca de um milhão de empregos diretos, o que destaca o seu potencial socioeconômico.A busca constante de novas cultivares através do melhoramento genético tem possibilitado a seleção de genótipos mais promissores e adaptados às diversas condições edafoclimáticas do país (SIMÕES NETO et al.,

Population structure and genetic diversity in natural populations of Theobroma speciosum Willd. Ex Spreng (Malvaceae)

“…Therefore, this is an efficient method to detect genetic variability within and between populations of T. speciosum. Some authors have reported the successful use of ISSR markers (Almeida et al, 2009;Rossi et al, 2009;Brandão et al, 2011). These markers are efficient, cost-effective, and generate large amount of information.…”

Determining the genetic stability of micropropagated sugarcane using inter-simple sequence repeat markers

“…In addition, oligonucleotides were chosen based on them being polymorphic for the varieties of sugarcane tested (Almeida et al, 2009).…”

Genetic diversity in natural populations of Theobroma subincanum Mart. in the Brazilian Amazon

“…Therefore, this method is efficient to detect genetic variability within and between populations of T. subincanum. The usefulness of this type of marker has been previously described for both cultivated and wild species (Rossi et al, 2009;Almeida et al, 2009;Brandão et al, 2011). This marker also presents high reproducibility and potential to be used in species without detailed DNA sequence information (Rossi et al, 2009;Almeida et al, 2009;Brandão et al, 2011).…”