CARACTERIZAÇÃO IN SILICO DOS GENES ENVOLVIDOS NO METABOLISMO DO NITROGÊNIO EM MILHO (Zea mays)

Abstract

CANTÚ, T.; TREVIZAN, C. B.; VIEIRA, C. E.; PIFFER, R. D.; CARNEIRO LUIZ, G.; SOUZA, S. G. H. de. Caracterização in silico dos genes envolvidos no metabolismo do nitrogênio em milho (Zea mays). Arq. Ciênc. Vet. Zool. UNIPAR, Umuarama, v. 19, n. 4, p. 231-239, out./dez. 2016. RESUMO:O N é o nutriente mineral requerido pelas plantas em maior quantidade e frequentemente limita o crescimento e produtividade. A partir de uma análise in silico foram identificados 26 genes envolvidos na assimilação do nitrogênio: quatro genes que codificam a enzima nitrato redutase (ZmNR), oito nitrato redutase de transporte (ZmNRT), uma nitrito redutase (ZmNRi), uma nitrito de transporte (ZmNRiT), seis glutamina sintetase (ZmGS), quatro glutamato sintase (ZmGOGAT) e duas glutamato desidrogenase (ZmGDH). A árvore filogenética foi construída onde foi possível observar a formação de cinco grupos distintos de acordo com as funções. A análise da estrutura dos genes mostrou que o número de íntrons variou de 0 a 32. A análise dos domínios conservados mostrou que a maioria dos genes identificados possuem o domínios específicos a função que desempenham na rota de assimilação do N em milho. Além disso, esses genes apresentaram padrões de expressão diferenciais em tecidos e órgãos. Os dados gerados neste trabalho forneceram subsídios para selecionar genes-candidatos para futuras análises funcionais a serem utilizados nos programas de melhoramento de milho. PALAVRAS-CHAVE: Assimilação de N. Eficiente uso do Nitrogênio. Filogenia. IN SILICO CHARACTERIZATION OF GENES INVOLVED IN NITROGEN METABOLISM IN MAIZE (Zea mays)ABSTRACT: Nitrogen is a mineral highly requested by plants and often limits both growth and productivity. From an in--silico analysis, a total of 26 genes were identified as being involved in nitrogen assimilation: four genes encoding nitrate reductase enzyme (ZmNR), eight encoding nitrate reductase transporters (ZmNRT), one encoding nitrite reductase (ZmNRi), one encoding nitrite transporter (ZmNRiT), six encoding glutamine synthesis (ZmGOGAT) and two encoding glutamate dehydrogenase (ZmGDH). A phylogenetic tree was generated where the formation of five distinct clusters could be observed according to gene function. Structural genes analysis showed that introns varied from 0 to 32. The analysis of conserved domains showed that most of the identified genes play a domain-specific function in the N assimilation pathway in maize. Moreover, these genes present a differential expression pattern in tissues and organs. Data from this study will provide subsidies to select candidate genes for further functional analyses in maize breeding programs. KEYWORDS: Efficient use of nitrogen. N-assimilation. Phylogeny. CARACTERIZACIÓN IN SILICO DE GENES IMPLICADOS EN EL METABOLISMO DE NITRÓGENO EN MAÍZ (Zea mays)RESUMEN: N es el nutriente mineral requerido por las plantas en mayor cantidad y a menudo limita el crecimiento y la productividad. Desde un análisis in silico se ha identificado 26 genes implicados en la asimilación de nitrógeno: cuatro genes q...

Oral lesions in broilers caused by corn mycotoxins: Review

“…A mudança na cor dos grãos ocorre devido a desaminação das proteínas onde os aminoácidos liberados são utilizados na formação de ácidos orgânicos e compostos amoniacais resultando em maior intensidade de escurecimento e odor fétido, ou seja, putrefação dos grãos. Estas atividades enzimáticas podem ser oriundas da interferência física da água e temperatura, assim como microbiológica, enzimas produzidas pelos fungos (Cantú et al, 2016) Outras variáveis que podem afetar a qualidade do grão além das citadas anteriormente, podemos ter a presença de insetos, que infestam os grãos de milho, Gorgulho (Sitophilus zeamais) e a Traça dos Cereais, animais que provocam a perda de peso e nos níveis energéticos dos grãos, doenças, baixo índice de germinação e vigor das plantas, que impactam a produtividade e viabilidade financeira da comercialização, utilização na alimentação dos animais (Antunes et al, 2017;Elias et al, 2009).…”